19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2458 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2458  branched-chain amino acid transport  100 
 
 		 110 aa  206  7e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.478648  normal  0.376832 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6126  putative transmembrane protein  90 
 
 		 110 aa  171  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.603631  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2394  branched-chain amino acid transport  90 
 
 		 110 aa  171  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3079  AzlD branched-chain amino acid transport  58.95 
 
 		 110 aa  117  7e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.900349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0430  branched-chain amino acid transport  56.57 
 
 		 110 aa  100  8e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.000591514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0460  branched-chain amino acid transport  50.55 
 
 		 113 aa  92.4  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3758  branched-chain amino acid transport  41.28 
 
 		 114 aa  83.6  8e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1961  branched-chain amino acid transport  37.5 
 
 		 109 aa  61.6  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0403  branched-chain amino acid transport  38.04 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.661242 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0388  branched-chain amino acid transport  38.04 
 
 		 108 aa  52.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0093  branched-chain amino acid transport  32.29 
 
 		 103 aa  51.6  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1380  branched-chain amino acid transport  35.58 
 
 		 119 aa  48.1  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.551237  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1416  branched-chain amino acid transport  35.71 
 
 		 109 aa  47.4  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.456547  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0512  hypothetical protein  36.78 
 
 		 108 aa  45.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.700284  normal  0.0494056 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0494  hypothetical protein  36.78 
 
 		 107 aa  44.3  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178268  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2850  branched chain amino acid ABC transporter  39.8 
 
 		 101 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2540  hypothetical protein  28.3 
 
 		 114 aa  42  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.137358  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5109  branched-chain amino acid transport  34.69 
 
 		 111 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0376343  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3607  branched-chain amino acid transport  39.58 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.459125  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>