54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0288 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0288  hypothetical protein  100 
 
 		 110 aa  216  7.999999999999999e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0149216 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4636  branched-chain amino acid transport  59.8 
 
 		 111 aa  131  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.671767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3875  branched-chain amino acid transport  62.04 
 
 		 117 aa  129  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5109  branched-chain amino acid transport  59.41 
 
 		 111 aa  123  7e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0376343  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4079  branched-chain amino acid transport  58.49 
 
 		 166 aa  123  8.000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4055  branched-chain amino acid transport  59.43 
 
 		 111 aa  120  9e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.461564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3400  branched-chain amino acid transport  59.43 
 
 		 111 aa  120  9e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.737178  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0354  branched-chain amino acid transport  56.36 
 
 		 109 aa  117  7e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0971347 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0829  branched-chain amino acid transport  57.28 
 
 		 111 aa  114  3.9999999999999997e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4692  branched-chain amino acid transport  57.8 
 
 		 111 aa  104  5e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0476  branched-chain amino acid transport  44.34 
 
 		 107 aa  82.8  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0489  branched-chain amino acid transport  44.34 
 
 		 107 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0581449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0836  AzlD family protein  44.95 
 
 		 107 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0659337  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0036  hypothetical protein  44.95 
 
 		 107 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0832  AzlD family protein  44.95 
 
 		 107 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2423  hypothetical protein  44.95 
 
 		 107 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0590  hypothetical protein  44.95 
 
 		 107 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0295  hypothetical protein  44.95 
 
 		 107 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.856609  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0662  hypothetical protein  45.87 
 
 		 107 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.103029  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0669  branched-chain amino acid transport  42.59 
 
 		 107 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.83471 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0498  branched-chain amino acid transport  40.19 
 
 		 107 aa  63.5  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.388953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2658  branched-chain amino acid transport  42.06 
 
 		 107 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.576231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2018  branched-chain amino acid transport  42.06 
 
 		 107 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2629  branched-chain amino acid transport  42.06 
 
 		 107 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0569  hypothetical protein  44.34 
 
 		 107 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3278  branched-chain amino acid transport  43.52 
 
 		 107 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.619269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2676  branched-chain amino acid transport  42.06 
 
 		 107 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2549  branched-chain amino acid transport  42.06 
 
 		 107 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0554296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0562  hypothetical protein  41.12 
 
 		 107 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5960  hypothetical protein  39.81 
 
 		 107 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.139211 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0458  branched-chain amino acid transport  45.37 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.325942 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0688  hypothetical protein  42.2 
 
 		 107 aa  57  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.242768 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1273  branched-chain amino acid transport  32.67 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3534  branched-chain amino acid transport  35.14 
 
 		 108 aa  50.1  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.450335  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3294  branched-chain amino acid transport  38.24 
 
 		 109 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0494  hypothetical protein  32.38 
 
 		 107 aa  47.8  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178268  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0093  branched-chain amino acid transport  30.61 
 
 		 103 aa  47.4  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0460  branched-chain amino acid transport  34.86 
 
 		 113 aa  46.2  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1469  branched-chain amino acid transport  30.19 
 
 		 107 aa  45.1  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.656646  normal  0.0172198 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4093  hypothetical protein  29 
 
 		 108 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1961  branched-chain amino acid transport  31.37 
 
 		 109 aa  44.7  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1599  branched-chain amino acid transport  34.95 
 
 		 103 aa  44.3  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.817749  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2208  branched-chain amino acid transport  31.25 
 
 		 112 aa  43.9  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0507422  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0971  branched-chain amino acid transport  30.21 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00496866  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0975  branched-chain amino acid transport  30.21 
 
 		 112 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00167089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4208  hypothetical protein  31.63 
 
 		 112 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000158916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1054  branched-chain amino acid transport  31.25 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0416307  normal  0.939947 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3079  AzlD branched-chain amino acid transport  36.36 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.900349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0388  branched-chain amino acid transport  32.61 
 
 		 108 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1095  branched-chain amino acid transport  31.25 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000116861  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0616  branched-chain amino acid transport  31.25 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.441128  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1380  branched-chain amino acid transport  34.48 
 
 		 119 aa  41.2  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.551237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0803  branched-chain amino acid transport  29.17 
 
 		 107 aa  40.8  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0769737  normal  0.181034 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4124  hypothetical protein  35.64 
 
 		 108 aa  40.8  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>