40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_2596 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_2596  branched-chain amino acid transport  100 
 
 		 100 aa  199  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2695  branched-chain amino acid transport  99 
 
 		 100 aa  197  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2529  branched-chain amino acid transport  99 
 
 		 100 aa  197  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1759  hypothetical protein  94 
 
 		 100 aa  190  5e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1560  branched-chain amino acid transport  94 
 
 		 100 aa  187  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1597  branched-chain amino acid transport  94 
 
 		 100 aa  187  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.589442 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2783  branched-chain amino acid transport  94 
 
 		 100 aa  187  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.426127  normal  0.341399 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1566  branched-chain amino acid transport  94 
 
 		 100 aa  186  8e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1458  branched-chain amino acid transport  94 
 
 		 100 aa  186  1e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.311  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3236  branched-chain amino acid transport  77 
 
 		 100 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0069593  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3140  branched-chain amino acid transport  77 
 
 		 100 aa  141  3e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2539  branched-chain amino acid transport  66 
 
 		 101 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3249  hypothetical protein  49.48 
 
 		 103 aa  110  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.131531  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1189  putative branched-chain amino acid transport protein  56 
 
 		 106 aa  110  9e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38170  hypothetical protein  48.45 
 
 		 104 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00099917 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3298  hypothetical protein  47 
 
 		 104 aa  103  6e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1896  branched-chain amino acid transport  52 
 
 		 104 aa  103  6e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06281  hypothetical protein  56.25 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1990  branched-chain amino acid transport  48.45 
 
 		 104 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.638482  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2384  branched chain amino acid ABC transporter  47.42 
 
 		 104 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.316334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3311  branched-chain amino acid transport  46.39 
 
 		 104 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.993943  normal  0.35173 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0234  hypothetical protein  58.33 
 
 		 105 aa  96.7  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001439  hypothetical protein  52 
 
 		 103 aa  92.4  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2444  hypothetical protein  40.21 
 
 		 103 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.416102 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3799  branched-chain amino acid transport  38.38 
 
 		 103 aa  77.8  0.00000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3611  branched-chain amino acid transport  38.38 
 
 		 103 aa  75.9  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.480929  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1355  branched-chain amino acid transport  39.18 
 
 		 105 aa  71.6  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2853  hypothetical protein  33 
 
 		 106 aa  64.3  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.438366  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2569  branched-chain amino acid transport  34.88 
 
 		 95 aa  51.2  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2173  branched-chain amino acid transport  34.44 
 
 		 108 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0257  branched-chain amino acid transport  31.65 
 
 		 107 aa  47  0.00008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.751249  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0403  branched-chain amino acid transport  35.94 
 
 		 108 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.661242 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0093  branched-chain amino acid transport  32 
 
 		 103 aa  45.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0388  branched-chain amino acid transport  35.94 
 
 		 108 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0512  hypothetical protein  35.94 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.700284  normal  0.0494056 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0522  branched-chain amino acid transport  35.48 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1961  branched-chain amino acid transport  30.11 
 
 		 109 aa  41.6  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0569  hypothetical protein  32.63 
 
 		 107 aa  41.2  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5109  branched-chain amino acid transport  25.74 
 
 		 111 aa  40.8  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0376343  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0354  branched-chain amino acid transport  32.58 
 
 		 109 aa  40.8  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0971347 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>