42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3236 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3236  branched-chain amino acid transport  100 
 
 		 100 aa  194  3e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0069593  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1759  hypothetical protein  79 
 
 		 100 aa  159  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2695  branched-chain amino acid transport  78 
 
 		 100 aa  157  3e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2529  branched-chain amino acid transport  78 
 
 		 100 aa  157  3e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2596  branched-chain amino acid transport  77 
 
 		 100 aa  155  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1560  branched-chain amino acid transport  77 
 
 		 100 aa  155  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1597  branched-chain amino acid transport  77 
 
 		 100 aa  155  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.589442 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2783  branched-chain amino acid transport  77 
 
 		 100 aa  155  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.426127  normal  0.341399 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1566  branched-chain amino acid transport  77 
 
 		 100 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1458  branched-chain amino acid transport  77 
 
 		 100 aa  152  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.311  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2539  branched-chain amino acid transport  68 
 
 		 101 aa  137  7e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3140  branched-chain amino acid transport  70 
 
 		 100 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1189  putative branched-chain amino acid transport protein  57.58 
 
 		 106 aa  110  8.000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3298  hypothetical protein  51.52 
 
 		 104 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3249  hypothetical protein  49.48 
 
 		 103 aa  107  6e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.131531  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06281  hypothetical protein  58.59 
 
 		 103 aa  107  8.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38170  hypothetical protein  48.48 
 
 		 104 aa  106  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00099917 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1990  branched-chain amino acid transport  51.52 
 
 		 104 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.638482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1896  branched-chain amino acid transport  54.55 
 
 		 104 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2384  branched chain amino acid ABC transporter  50.51 
 
 		 104 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.316334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3311  branched-chain amino acid transport  50.51 
 
 		 104 aa  103  9e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.993943  normal  0.35173 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001439  hypothetical protein  56.57 
 
 		 103 aa  100  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0234  hypothetical protein  57.29 
 
 		 105 aa  95.1  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2444  hypothetical protein  42.42 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.416102 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3799  branched-chain amino acid transport  36.36 
 
 		 103 aa  75.5  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3611  branched-chain amino acid transport  37.37 
 
 		 103 aa  73.2  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.480929  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1355  branched-chain amino acid transport  39.39 
 
 		 105 aa  69.7  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2853  hypothetical protein  30.53 
 
 		 106 aa  57.4  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.438366  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0388  branched-chain amino acid transport  41.27 
 
 		 108 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0403  branched-chain amino acid transport  39.68 
 
 		 108 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.661242 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2108  branched-chain amino acid transport  33.68 
 
 		 109 aa  47  0.00008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343037 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0512  hypothetical protein  39.68 
 
 		 108 aa  45.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.700284  normal  0.0494056 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2569  branched-chain amino acid transport  32.56 
 
 		 95 aa  44.7  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0476  branched-chain amino acid transport  31.68 
 
 		 107 aa  43.5  0.0009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0489  branched-chain amino acid transport  31.68 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0581449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2937  branched-chain amino acid transport  33.68 
 
 		 107 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00590698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1273  branched-chain amino acid transport  29.17 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0975  branched-chain amino acid transport  33.33 
 
 		 112 aa  40.4  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00167089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0257  branched-chain amino acid transport  30.38 
 
 		 107 aa  40.4  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.751249  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1047  hypothetical protein  33.01 
 
 		 107 aa  40.4  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.473278  normal  0.977869 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2173  branched-chain amino acid transport  32.22 
 
 		 108 aa  40  0.01  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0803  branched-chain amino acid transport  32.29 
 
 		 107 aa  40  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0769737  normal  0.181034 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>