38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_38170 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_38170  hypothetical protein  100 
 
 		 104 aa  206  8e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00099917 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3249  hypothetical protein  98.02 
 
 		 103 aa  197  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.131531  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3298  hypothetical protein  75.73 
 
 		 104 aa  165  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1990  branched-chain amino acid transport  67.96 
 
 		 104 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.638482  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2384  branched chain amino acid ABC transporter  66.99 
 
 		 104 aa  143  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.316334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3311  branched-chain amino acid transport  66.02 
 
 		 104 aa  140  7e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.993943  normal  0.35173 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1896  branched-chain amino acid transport  66.02 
 
 		 104 aa  138  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1759  hypothetical protein  50.52 
 
 		 100 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2695  branched-chain amino acid transport  49.48 
 
 		 100 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2529  branched-chain amino acid transport  49.48 
 
 		 100 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2539  branched-chain amino acid transport  48 
 
 		 101 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2596  branched-chain amino acid transport  48.45 
 
 		 100 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1597  branched-chain amino acid transport  49.48 
 
 		 100 aa  108  3e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.589442 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1566  branched-chain amino acid transport  49.48 
 
 		 100 aa  108  3e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2783  branched-chain amino acid transport  49.48 
 
 		 100 aa  108  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.426127  normal  0.341399 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1560  branched-chain amino acid transport  49.48 
 
 		 100 aa  108  3e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1458  branched-chain amino acid transport  49.48 
 
 		 100 aa  106  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.311  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3236  branched-chain amino acid transport  48.48 
 
 		 100 aa  98.2  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0069593  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06281  hypothetical protein  42.72 
 
 		 103 aa  93.6  7e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0234  hypothetical protein  46 
 
 		 105 aa  89.4  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1189  putative branched-chain amino acid transport protein  38.83 
 
 		 106 aa  89  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3611  branched-chain amino acid transport  42.86 
 
 		 103 aa  88.6  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.480929  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3799  branched-chain amino acid transport  41.84 
 
 		 103 aa  88.2  4e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3140  branched-chain amino acid transport  44 
 
 		 100 aa  87.4  5e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001439  hypothetical protein  38.83 
 
 		 103 aa  84.7  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2444  hypothetical protein  37.86 
 
 		 103 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.416102 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1355  branched-chain amino acid transport  34.62 
 
 		 105 aa  75.5  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2853  hypothetical protein  34.74 
 
 		 106 aa  64.7  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.438366  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0476  branched-chain amino acid transport  30.69 
 
 		 107 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0489  branched-chain amino acid transport  30.69 
 
 		 107 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0581449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2108  branched-chain amino acid transport  25.77 
 
 		 109 aa  47.8  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343037 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3294  branched-chain amino acid transport  38.24 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1961  branched-chain amino acid transport  28 
 
 		 109 aa  44.3  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0829  branched-chain amino acid transport  28.42 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0388  branched-chain amino acid transport  27.78 
 
 		 108 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0975  branched-chain amino acid transport  35.35 
 
 		 112 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00167089  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0403  branched-chain amino acid transport  27.78 
 
 		 108 aa  40.8  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.661242 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0971  branched-chain amino acid transport  35.35 
 
 		 112 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00496866  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>