39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3249 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3249  hypothetical protein  100 
 
 		 103 aa  204  5e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.131531  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38170  hypothetical protein  98.02 
 
 		 104 aa  197  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00099917 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3298  hypothetical protein  74.26 
 
 		 104 aa  160  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1990  branched-chain amino acid transport  66.99 
 
 		 104 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.638482  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2384  branched chain amino acid ABC transporter  66.02 
 
 		 104 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.316334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3311  branched-chain amino acid transport  65.05 
 
 		 104 aa  136  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.993943  normal  0.35173 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1896  branched-chain amino acid transport  66.02 
 
 		 104 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1759  hypothetical protein  51.55 
 
 		 100 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2529  branched-chain amino acid transport  50.52 
 
 		 100 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2695  branched-chain amino acid transport  50.52 
 
 		 100 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1597  branched-chain amino acid transport  50 
 
 		 100 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.589442 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2783  branched-chain amino acid transport  50 
 
 		 100 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.426127  normal  0.341399 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1566  branched-chain amino acid transport  50 
 
 		 100 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1560  branched-chain amino acid transport  50 
 
 		 100 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2539  branched-chain amino acid transport  49.48 
 
 		 101 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2596  branched-chain amino acid transport  49.48 
 
 		 100 aa  110  5e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1458  branched-chain amino acid transport  49 
 
 		 100 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.311  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3236  branched-chain amino acid transport  49.48 
 
 		 100 aa  99  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0069593  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06281  hypothetical protein  41.75 
 
 		 103 aa  90.1  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3611  branched-chain amino acid transport  41.18 
 
 		 103 aa  88.6  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.480929  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0234  hypothetical protein  45 
 
 		 105 aa  89  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1189  putative branched-chain amino acid transport protein  40.21 
 
 		 106 aa  88.2  4e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3140  branched-chain amino acid transport  46.39 
 
 		 100 aa  87.4  6e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3799  branched-chain amino acid transport  40.2 
 
 		 103 aa  87.4  6e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001439  hypothetical protein  38.83 
 
 		 103 aa  80.9  0.000000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2444  hypothetical protein  37.11 
 
 		 103 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.416102 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1355  branched-chain amino acid transport  33.33 
 
 		 105 aa  71.2  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2853  hypothetical protein  35.79 
 
 		 106 aa  66.6  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.438366  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0476  branched-chain amino acid transport  30.3 
 
 		 107 aa  50.4  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0489  branched-chain amino acid transport  30.3 
 
 		 107 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0581449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2108  branched-chain amino acid transport  25.77 
 
 		 109 aa  47.8  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343037 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3294  branched-chain amino acid transport  37.25 
 
 		 109 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0975  branched-chain amino acid transport  36.27 
 
 		 112 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00167089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0971  branched-chain amino acid transport  36.27 
 
 		 112 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00496866  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0388  branched-chain amino acid transport  27.78 
 
 		 108 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1961  branched-chain amino acid transport  27 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0403  branched-chain amino acid transport  27.78 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.661242 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2208  branched-chain amino acid transport  36.11 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0507422  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1047  hypothetical protein  33.33 
 
 		 107 aa  40  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.473278  normal  0.977869 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>