31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0971 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_0971  branched-chain amino acid transport  100 
 
 		 112 aa  216  1e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00496866  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0975  branched-chain amino acid transport  99.11 
 
 		 112 aa  212  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00167089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2208  branched-chain amino acid transport  94.5 
 
 		 112 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0507422  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4208  hypothetical protein  92.86 
 
 		 112 aa  186  9e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000158916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1095  branched-chain amino acid transport  90.83 
 
 		 112 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000116861  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1054  branched-chain amino acid transport  90.83 
 
 		 112 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0416307  normal  0.939947 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0616  branched-chain amino acid transport  90.83 
 
 		 112 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.441128  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1047  hypothetical protein  80.19 
 
 		 107 aa  167  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.473278  normal  0.977869 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2937  branched-chain amino acid transport  78.3 
 
 		 107 aa  163  6.9999999999999995e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00590698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0803  branched-chain amino acid transport  77.36 
 
 		 107 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0769737  normal  0.181034 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1690  hypothetical protein  76.85 
 
 		 113 aa  161  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0542077  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2108  branched-chain amino acid transport  45.26 
 
 		 109 aa  75.5  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343037 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3294  branched-chain amino acid transport  51.52 
 
 		 109 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0489  branched-chain amino acid transport  38.3 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0581449  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0476  branched-chain amino acid transport  37.23 
 
 		 107 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0008  branched-chain amino acid transport  38.46 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0512  hypothetical protein  35.96 
 
 		 108 aa  53.5  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.700284  normal  0.0494056 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0093  branched-chain amino acid transport  30.77 
 
 		 103 aa  52.4  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0569  hypothetical protein  39.36 
 
 		 107 aa  52.4  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1961  branched-chain amino acid transport  30.77 
 
 		 109 aa  51.6  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3972  branched-chain amino acid transport  38.54 
 
 		 108 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.573883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1273  branched-chain amino acid transport  32.29 
 
 		 111 aa  51.2  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0403  branched-chain amino acid transport  32.58 
 
 		 108 aa  47.4  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.661242 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0388  branched-chain amino acid transport  31.46 
 
 		 108 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3249  hypothetical protein  36.27 
 
 		 103 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.131531  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1416  branched-chain amino acid transport  32.26 
 
 		 109 aa  44.3  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.456547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2540  hypothetical protein  31.37 
 
 		 114 aa  43.5  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.137358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0494  hypothetical protein  35.96 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178268  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3534  branched-chain amino acid transport  27.08 
 
 		 108 aa  42  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.450335  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38170  hypothetical protein  35.35 
 
 		 104 aa  40.8  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00099917 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4636  branched-chain amino acid transport  30.11 
 
 		 111 aa  40.4  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.671767  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>