31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3799 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_3799  branched-chain amino acid transport  100 
 
 		 103 aa  199  9e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3611  branched-chain amino acid transport  93.2 
 
 		 103 aa  189  1e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.480929  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2444  hypothetical protein  62.14 
 
 		 103 aa  135  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.416102 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1355  branched-chain amino acid transport  56.57 
 
 		 105 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1896  branched-chain amino acid transport  41.75 
 
 		 104 aa  90.5  8e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1990  branched-chain amino acid transport  41.75 
 
 		 104 aa  90.1  9e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.638482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3311  branched-chain amino acid transport  41.75 
 
 		 104 aa  89  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.993943  normal  0.35173 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2384  branched chain amino acid ABC transporter  41.75 
 
 		 104 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.316334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38170  hypothetical protein  41.84 
 
 		 104 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00099917 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3249  hypothetical protein  40.2 
 
 		 103 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.131531  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3298  hypothetical protein  40.4 
 
 		 104 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2529  branched-chain amino acid transport  38.38 
 
 		 100 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2695  branched-chain amino acid transport  38.38 
 
 		 100 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1566  branched-chain amino acid transport  36.36 
 
 		 100 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2539  branched-chain amino acid transport  35.35 
 
 		 101 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1458  branched-chain amino acid transport  37.37 
 
 		 100 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.311  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2596  branched-chain amino acid transport  38.38 
 
 		 100 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1759  hypothetical protein  36.36 
 
 		 100 aa  76.6  0.00000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1560  branched-chain amino acid transport  36.36 
 
 		 100 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1597  branched-chain amino acid transport  36.36 
 
 		 100 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.589442 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2783  branched-chain amino acid transport  36.36 
 
 		 100 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.426127  normal  0.341399 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1189  putative branched-chain amino acid transport protein  35.48 
 
 		 106 aa  75.9  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06281  hypothetical protein  36.46 
 
 		 103 aa  72.8  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3236  branched-chain amino acid transport  36.36 
 
 		 100 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0069593  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001439  hypothetical protein  35.48 
 
 		 103 aa  68.6  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3140  branched-chain amino acid transport  37.37 
 
 		 100 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0234  hypothetical protein  35.79 
 
 		 105 aa  65.5  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2853  hypothetical protein  29.35 
 
 		 106 aa  50.1  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.438366  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2108  branched-chain amino acid transport  28.57 
 
 		 109 aa  47.4  0.00008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343037 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0829  branched-chain amino acid transport  32.99 
 
 		 111 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1961  branched-chain amino acid transport  24.75 
 
 		 109 aa  40.4  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>