36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3298 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3298  hypothetical protein  100 
 
 		 104 aa  206  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38170  hypothetical protein  75.73 
 
 		 104 aa  165  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00099917 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3249  hypothetical protein  74.26 
 
 		 103 aa  160  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.131531  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2384  branched chain amino acid ABC transporter  76.7 
 
 		 104 aa  157  4e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.316334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1990  branched-chain amino acid transport  75.73 
 
 		 104 aa  157  5e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.638482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3311  branched-chain amino acid transport  75.73 
 
 		 104 aa  154  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.993943  normal  0.35173 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1896  branched-chain amino acid transport  72.82 
 
 		 104 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2539  branched-chain amino acid transport  52.48 
 
 		 101 aa  118  3e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1759  hypothetical protein  48 
 
 		 100 aa  104  4e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2596  branched-chain amino acid transport  47 
 
 		 100 aa  103  7e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1560  branched-chain amino acid transport  47 
 
 		 100 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1597  branched-chain amino acid transport  47 
 
 		 100 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.589442 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2695  branched-chain amino acid transport  47 
 
 		 100 aa  102  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2529  branched-chain amino acid transport  47 
 
 		 100 aa  102  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2783  branched-chain amino acid transport  47 
 
 		 100 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.426127  normal  0.341399 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1566  branched-chain amino acid transport  47 
 
 		 100 aa  101  4e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1458  branched-chain amino acid transport  46 
 
 		 100 aa  99  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.311  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3236  branched-chain amino acid transport  51.52 
 
 		 100 aa  97.4  6e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0069593  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1189  putative branched-chain amino acid transport protein  44.66 
 
 		 106 aa  96.3  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3140  branched-chain amino acid transport  50 
 
 		 100 aa  95.1  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06281  hypothetical protein  47.57 
 
 		 103 aa  94  6e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0234  hypothetical protein  48 
 
 		 105 aa  88.2  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001439  hypothetical protein  45.63 
 
 		 103 aa  85.1  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3611  branched-chain amino acid transport  39.39 
 
 		 103 aa  82.8  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.480929  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3799  branched-chain amino acid transport  40.4 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1355  branched-chain amino acid transport  40.78 
 
 		 105 aa  82  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2444  hypothetical protein  38.83 
 
 		 103 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.416102 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2853  hypothetical protein  27.27 
 
 		 106 aa  52.8  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.438366  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2108  branched-chain amino acid transport  29.9 
 
 		 109 aa  51.6  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343037 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0476  branched-chain amino acid transport  28.16 
 
 		 107 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0489  branched-chain amino acid transport  28.71 
 
 		 107 aa  47.4  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0581449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0803  branched-chain amino acid transport  32.98 
 
 		 107 aa  45.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0769737  normal  0.181034 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3294  branched-chain amino acid transport  39.42 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3972  branched-chain amino acid transport  27.18 
 
 		 108 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.573883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0257  branched-chain amino acid transport  22.92 
 
 		 107 aa  40.8  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.751249  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1416  branched-chain amino acid transport  32.29 
 
 		 109 aa  40.8  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.456547  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>