49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3278 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3278  branched-chain amino acid transport  100 
 
 
107 aa  209  7.999999999999999e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.619269  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0688  hypothetical protein  93.46 
 
 
107 aa  174  5e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.242768 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0669  branched-chain amino acid transport  79.05 
 
 
107 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.83471 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0295  hypothetical protein  78.1 
 
 
107 aa  144  5e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.856609  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0036  hypothetical protein  78.1 
 
 
107 aa  144  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0836  AzlD family protein  78.1 
 
 
107 aa  144  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0659337  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0832  AzlD family protein  78.1 
 
 
107 aa  144  5e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2423  hypothetical protein  78.1 
 
 
107 aa  144  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0590  hypothetical protein  78.1 
 
 
107 aa  144  5e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2658  branched-chain amino acid transport  79.05 
 
 
107 aa  143  6e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.576231  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2629  branched-chain amino acid transport  79.05 
 
 
107 aa  143  6e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2018  branched-chain amino acid transport  79.05 
 
 
107 aa  143  6e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2549  branched-chain amino acid transport  77.14 
 
 
107 aa  142  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0554296  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2676  branched-chain amino acid transport  77.14 
 
 
107 aa  142  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5960  hypothetical protein  78.1 
 
 
107 aa  142  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.139211 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0662  hypothetical protein  78.1 
 
 
107 aa  142  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.103029  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0458  branched-chain amino acid transport  80 
 
 
107 aa  140  5e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.325942 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0476  branched-chain amino acid transport  52.83 
 
 
107 aa  99.8  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0489  branched-chain amino acid transport  51.89 
 
 
107 aa  97.8  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0581449  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0498  branched-chain amino acid transport  53.33 
 
 
107 aa  91.3  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.388953  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0562  hypothetical protein  50 
 
 
107 aa  84  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0569  hypothetical protein  53.77 
 
 
107 aa  83.6  8e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4636  branched-chain amino acid transport  41.28 
 
 
111 aa  82.8  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.671767  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3875  branched-chain amino acid transport  44 
 
 
117 aa  75.9  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0354  branched-chain amino acid transport  40 
 
 
109 aa  72.4  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0971347 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5109  branched-chain amino acid transport  39.25 
 
 
111 aa  70.1  0.000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0376343  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0829  branched-chain amino acid transport  37.37 
 
 
111 aa  65.5  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4079  branched-chain amino acid transport  37.76 
 
 
166 aa  65.1  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3534  branched-chain amino acid transport  39.39 
 
 
108 aa  62.8  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.450335  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4055  branched-chain amino acid transport  37.76 
 
 
111 aa  62.4  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.461564  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3400  branched-chain amino acid transport  37.76 
 
 
111 aa  62.4  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.737178  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3054  branched-chain amino acid transport  37.38 
 
 
108 aa  57.4  0.00000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0288  hypothetical protein  44.34 
 
 
110 aa  55.5  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0149216 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1273  branched-chain amino acid transport  34.91 
 
 
111 aa  55.8  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1961  branched-chain amino acid transport  36.7 
 
 
109 aa  55.1  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0008  branched-chain amino acid transport  40 
 
 
107 aa  51.2  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2108  branched-chain amino acid transport  30.11 
 
 
109 aa  47.8  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000343037 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0522  branched-chain amino acid transport  34.91 
 
 
116 aa  47  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4692  branched-chain amino acid transport  38.24 
 
 
111 aa  47  0.00009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1469  branched-chain amino acid transport  34.29 
 
 
107 aa  45.4  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.656646  normal  0.0172198 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4093  hypothetical protein  29.29 
 
 
108 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0257  branched-chain amino acid transport  27 
 
 
107 aa  43.9  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.751249  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0093  branched-chain amino acid transport  32 
 
 
103 aa  43.9  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3294  branched-chain amino acid transport  40.78 
 
 
109 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1380  branched-chain amino acid transport  32.69 
 
 
119 aa  43.5  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.551237  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0460  branched-chain amino acid transport  33.65 
 
 
113 aa  43.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4124  hypothetical protein  34.94 
 
 
108 aa  41.6  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1478  branched-chain amino acid transport  39.13 
 
 
101 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2853  hypothetical protein  28.44 
 
 
106 aa  40.4  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.438366  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>