48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A0688 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A0688  hypothetical protein  100 
 
 		 107 aa  209  7.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.242768 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3278  branched-chain amino acid transport  93.46 
 
 		 107 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.619269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0669  branched-chain amino acid transport  80 
 
 		 107 aa  147  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.83471 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2658  branched-chain amino acid transport  80 
 
 		 107 aa  147  6e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.576231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2629  branched-chain amino acid transport  80 
 
 		 107 aa  147  6e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2018  branched-chain amino acid transport  80 
 
 		 107 aa  147  6e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5960  hypothetical protein  79.05 
 
 		 107 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.139211 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2676  branched-chain amino acid transport  78.1 
 
 		 107 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2549  branched-chain amino acid transport  78.1 
 
 		 107 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0554296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0836  AzlD family protein  78.1 
 
 		 107 aa  144  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0659337  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0832  AzlD family protein  78.1 
 
 		 107 aa  144  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2423  hypothetical protein  78.1 
 
 		 107 aa  144  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0036  hypothetical protein  78.1 
 
 		 107 aa  144  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0295  hypothetical protein  78.1 
 
 		 107 aa  144  3e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.856609  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0458  branched-chain amino acid transport  81.13 
 
 		 107 aa  144  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.325942 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0590  hypothetical protein  78.1 
 
 		 107 aa  144  3e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0662  hypothetical protein  77.14 
 
 		 107 aa  141  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.103029  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0476  branched-chain amino acid transport  50 
 
 		 107 aa  95.9  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0489  branched-chain amino acid transport  49.06 
 
 		 107 aa  93.6  7e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0581449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0498  branched-chain amino acid transport  48.57 
 
 		 107 aa  80.1  0.000000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.388953  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0569  hypothetical protein  50.94 
 
 		 107 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4636  branched-chain amino acid transport  38.53 
 
 		 111 aa  79.3  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.671767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0354  branched-chain amino acid transport  41.9 
 
 		 109 aa  76.3  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0971347 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0562  hypothetical protein  47.17 
 
 		 107 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5109  branched-chain amino acid transport  40.19 
 
 		 111 aa  71.6  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0376343  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3875  branched-chain amino acid transport  41 
 
 		 117 aa  72  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3400  branched-chain amino acid transport  39.8 
 
 		 111 aa  68.6  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.737178  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4055  branched-chain amino acid transport  39.8 
 
 		 111 aa  68.6  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.461564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0829  branched-chain amino acid transport  37.37 
 
 		 111 aa  66.2  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4079  branched-chain amino acid transport  37.76 
 
 		 166 aa  66.2  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3534  branched-chain amino acid transport  42.86 
 
 		 108 aa  57.4  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.450335  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1273  branched-chain amino acid transport  34.91 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3054  branched-chain amino acid transport  36.45 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1961  branched-chain amino acid transport  34.86 
 
 		 109 aa  52.8  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0288  hypothetical protein  42.2 
 
 		 110 aa  52.8  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0149216 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0008  branched-chain amino acid transport  39.05 
 
 		 107 aa  49.3  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2108  branched-chain amino acid transport  30.11 
 
 		 109 aa  48.9  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343037 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1469  branched-chain amino acid transport  36.19 
 
 		 107 aa  48.1  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.656646  normal  0.0172198 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1380  branched-chain amino acid transport  33.65 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.551237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0257  branched-chain amino acid transport  30.1 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.751249  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0460  branched-chain amino acid transport  35.85 
 
 		 113 aa  45.4  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4692  branched-chain amino acid transport  36.27 
 
 		 111 aa  45.1  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3294  branched-chain amino acid transport  38.83 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4093  hypothetical protein  29.29 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0093  branched-chain amino acid transport  33.33 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0803  branched-chain amino acid transport  31.58 
 
 		 107 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0769737  normal  0.181034 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0522  branched-chain amino acid transport  33.96 
 
 		 116 aa  41.2  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1478  branched-chain amino acid transport  38.57 
 
 		 101 aa  40  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>