45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_0036 on replicon NC_009080
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009080  BMA10247_0036  hypothetical protein  100 
 
 
107 aa  209  7e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0836  AzlD family protein  100 
 
 
107 aa  209  7e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0659337  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0295  hypothetical protein  100 
 
 
107 aa  209  7e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.856609  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0832  AzlD family protein  100 
 
 
107 aa  209  7e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2423  hypothetical protein  100 
 
 
107 aa  209  7e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0590  hypothetical protein  100 
 
 
107 aa  209  7e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0662  hypothetical protein  95.33 
 
 
107 aa  177  4e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.103029  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2658  branched-chain amino acid transport  84.11 
 
 
107 aa  156  7e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.576231  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2018  branched-chain amino acid transport  84.11 
 
 
107 aa  156  7e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2629  branched-chain amino acid transport  84.11 
 
 
107 aa  156  7e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5960  hypothetical protein  83.18 
 
 
107 aa  154  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.139211 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2549  branched-chain amino acid transport  82.24 
 
 
107 aa  153  6e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0554296  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2676  branched-chain amino acid transport  82.24 
 
 
107 aa  153  6e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0669  branched-chain amino acid transport  82.08 
 
 
107 aa  151  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.83471 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0688  hypothetical protein  77.36 
 
 
107 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.242768 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3278  branched-chain amino acid transport  77.36 
 
 
107 aa  143  6e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.619269  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0458  branched-chain amino acid transport  77.57 
 
 
107 aa  141  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.325942 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0476  branched-chain amino acid transport  52.38 
 
 
107 aa  99.4  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0489  branched-chain amino acid transport  51.43 
 
 
107 aa  97.4  6e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0581449  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0354  branched-chain amino acid transport  47.62 
 
 
109 aa  89.7  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0971347 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0498  branched-chain amino acid transport  51.89 
 
 
107 aa  89  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.388953  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0562  hypothetical protein  50 
 
 
107 aa  85.1  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4636  branched-chain amino acid transport  42.71 
 
 
111 aa  78.6  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.671767  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3875  branched-chain amino acid transport  41.67 
 
 
117 aa  77.8  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0569  hypothetical protein  50.48 
 
 
107 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5109  branched-chain amino acid transport  41.67 
 
 
111 aa  73.2  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0376343  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0829  branched-chain amino acid transport  38.38 
 
 
111 aa  69.3  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4079  branched-chain amino acid transport  37 
 
 
166 aa  63.9  0.0000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3400  branched-chain amino acid transport  38.78 
 
 
111 aa  63.9  0.0000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.737178  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1273  branched-chain amino acid transport  38.1 
 
 
111 aa  63.5  0.0000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4055  branched-chain amino acid transport  38.78 
 
 
111 aa  63.9  0.0000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.461564  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2108  branched-chain amino acid transport  34 
 
 
109 aa  57.8  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000343037 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0288  hypothetical protein  45.37 
 
 
110 aa  57  0.00000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0149216 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1961  branched-chain amino acid transport  36.36 
 
 
109 aa  53.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3534  branched-chain amino acid transport  36.27 
 
 
108 aa  52  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.450335  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3054  branched-chain amino acid transport  37.04 
 
 
108 aa  52  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4692  branched-chain amino acid transport  36.63 
 
 
111 aa  50.1  0.000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4093  hypothetical protein  32.69 
 
 
108 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0460  branched-chain amino acid transport  35.24 
 
 
113 aa  47.4  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1469  branched-chain amino acid transport  35.24 
 
 
107 aa  45.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.656646  normal  0.0172198 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0093  branched-chain amino acid transport  31.91 
 
 
103 aa  45.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0008  branched-chain amino acid transport  35.85 
 
 
107 aa  44.7  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3294  branched-chain amino acid transport  38.83 
 
 
109 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0257  branched-chain amino acid transport  28.12 
 
 
107 aa  42  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.751249  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2853  hypothetical protein  29.2 
 
 
106 aa  41.6  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.438366  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>