45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2676 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2549  branched-chain amino acid transport  100 
 
 		 107 aa  207  4e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0554296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2676  branched-chain amino acid transport  100 
 
 		 107 aa  207  4e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5960  hypothetical protein  95.33 
 
 		 107 aa  180  7e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.139211 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2658  branched-chain amino acid transport  96.26 
 
 		 107 aa  179  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.576231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2629  branched-chain amino acid transport  96.26 
 
 		 107 aa  179  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2018  branched-chain amino acid transport  96.26 
 
 		 107 aa  179  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0669  branched-chain amino acid transport  94.34 
 
 		 107 aa  175  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.83471 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2423  hypothetical protein  82.24 
 
 		 107 aa  154  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0590  hypothetical protein  82.24 
 
 		 107 aa  154  3e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0832  AzlD family protein  82.24 
 
 		 107 aa  154  3e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0836  AzlD family protein  82.24 
 
 		 107 aa  154  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0659337  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0295  hypothetical protein  82.24 
 
 		 107 aa  154  3e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.856609  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0036  hypothetical protein  82.24 
 
 		 107 aa  154  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0662  hypothetical protein  81.31 
 
 		 107 aa  153  6e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.103029  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0688  hypothetical protein  78.1 
 
 		 107 aa  147  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.242768 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3278  branched-chain amino acid transport  77.14 
 
 		 107 aa  142  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.619269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0458  branched-chain amino acid transport  73.83 
 
 		 107 aa  137  7e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.325942 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0476  branched-chain amino acid transport  54.29 
 
 		 107 aa  103  6e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0489  branched-chain amino acid transport  54.29 
 
 		 107 aa  103  7e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0581449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0498  branched-chain amino acid transport  51.89 
 
 		 107 aa  89.7  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.388953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4636  branched-chain amino acid transport  42.99 
 
 		 111 aa  87.4  6e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.671767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0562  hypothetical protein  50.94 
 
 		 107 aa  87.4  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0354  branched-chain amino acid transport  48.08 
 
 		 109 aa  84  6e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0971347 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0569  hypothetical protein  54.29 
 
 		 107 aa  83.6  9e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5109  branched-chain amino acid transport  43.93 
 
 		 111 aa  82  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0376343  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3875  branched-chain amino acid transport  41.28 
 
 		 117 aa  77.4  0.00000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4079  branched-chain amino acid transport  37 
 
 		 166 aa  65.9  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0829  branched-chain amino acid transport  35.35 
 
 		 111 aa  63.9  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4055  branched-chain amino acid transport  36.73 
 
 		 111 aa  63.9  0.0000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.461564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3400  branched-chain amino acid transport  36.73 
 
 		 111 aa  63.9  0.0000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.737178  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1273  branched-chain amino acid transport  38.1 
 
 		 111 aa  62.4  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1961  branched-chain amino acid transport  38.18 
 
 		 109 aa  56.6  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3534  branched-chain amino acid transport  50.94 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.450335  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3054  branched-chain amino acid transport  37.96 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0288  hypothetical protein  42.06 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0149216 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2108  branched-chain amino acid transport  31.96 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343037 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0460  branched-chain amino acid transport  37.38 
 
 		 113 aa  49.7  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4692  branched-chain amino acid transport  34.62 
 
 		 111 aa  49.3  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4093  hypothetical protein  30.39 
 
 		 108 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1469  branched-chain amino acid transport  34.29 
 
 		 107 aa  46.2  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.656646  normal  0.0172198 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3294  branched-chain amino acid transport  38.68 
 
 		 109 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0008  branched-chain amino acid transport  33.33 
 
 		 107 aa  43.5  0.0009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0093  branched-chain amino acid transport  30.56 
 
 		 103 aa  42.7  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1380  branched-chain amino acid transport  30.77 
 
 		 119 aa  41.2  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.551237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0257  branched-chain amino acid transport  25.24 
 
 		 107 aa  40  0.01  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.751249  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>