258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0340 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_0340  thiol peroxidase  100 
 
 
160 aa  330  3e-90  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1952  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  41.36 
 
 
165 aa  120  9.999999999999999e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.386734  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1729  thiol peroxidase  36.2 
 
 
179 aa  105  2e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0346  Redoxin domain protein  38.04 
 
 
165 aa  105  2e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2971  thiol peroxidase  35.98 
 
 
165 aa  104  6e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.535001  normal  0.296496 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3579  anti-oxidant AhpCTSA family protein  39.29 
 
 
228 aa  103  7e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1306  Redoxin domain protein  39.63 
 
 
170 aa  103  1e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02074  Peroxiredoxin  34.78 
 
 
166 aa  102  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.148963  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1620  thiol peroxidase  34.57 
 
 
166 aa  100  6e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000227815  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11961  thiol peroxidase  36.65 
 
 
165 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.196708  normal  0.378209 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3341  anti-oxidant AhpCTSA family protein  37.89 
 
 
197 aa  98.6  3e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4748  thiol peroxidase  40.24 
 
 
166 aa  98.2  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1133  Redoxin domain protein  35.8 
 
 
197 aa  98.2  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0528381  normal  0.881075 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1205  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  37.89 
 
 
197 aa  97.8  6e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0888601  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4470  redoxin domain-containing protein  40.24 
 
 
166 aa  97.4  7e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2340  redoxin domain-containing protein  39.44 
 
 
171 aa  97.4  7e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0726108  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4373  thiol peroxidase  40.24 
 
 
166 aa  97.1  8e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2467  Redoxin domain protein  35.37 
 
 
171 aa  97.1  9e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.000000376738  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0035  Redoxin domain protein  39.46 
 
 
168 aa  96.7  1e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0487  thiol peroxidase  40.24 
 
 
166 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.309589 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0841  redoxin domain-containing protein  36.91 
 
 
199 aa  97.1  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.227128  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2710  Redoxin domain protein  40 
 
 
166 aa  96.7  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3029  redoxin domain-containing protein  37.27 
 
 
197 aa  95.5  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000167246  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1204  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  37.27 
 
 
197 aa  96.3  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00223089  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1275  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  37.27 
 
 
197 aa  96.3  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000737792  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2579  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  35.19 
 
 
166 aa  96.3  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0691363  normal  0.0286465 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3014  redoxin domain-containing protein  37.27 
 
 
197 aa  95.5  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000289393  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1822  Redoxin domain protein  38.19 
 
 
179 aa  96.3  2e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0729  Redoxin domain protein  38.71 
 
 
166 aa  96.3  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3172  redoxin domain-containing protein  37.27 
 
 
197 aa  94.7  4e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000900168  hitchhiker  0.000325363 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1349  Redoxin domain protein  37.27 
 
 
197 aa  94.7  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0251869  hitchhiker  0.0000000000448162 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2534  Redoxin domain protein  40.14 
 
 
167 aa  94.7  5e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0830  thiol peroxidase  33.54 
 
 
166 aa  94.4  6e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3254  thiol peroxidase  37.04 
 
 
165 aa  94  7e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.345159  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1769  thiol peroxidase  42.66 
 
 
164 aa  93.2  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2464  anti-oxidant AhpCTSA family protein  37.75 
 
 
191 aa  93.6  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00897143  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1804  thiol peroxidase  42.66 
 
 
164 aa  93.2  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1240  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  34.46 
 
 
166 aa  92.8  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.41207 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2676  redoxin domain-containing protein  36.02 
 
 
197 aa  92.4  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.055079  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1360  antioxidant Tpx  34.67 
 
 
204 aa  92.4  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000292969  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2802  redoxin domain-containing protein  37.16 
 
 
197 aa  92.4  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2140  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  35.5 
 
 
166 aa  91.7  4e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000663162  normal  0.818163 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1277  thiol peroxidase  41.78 
 
 
164 aa  91.3  5e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.189969  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1552  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  32.5 
 
 
168 aa  91.3  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.108824  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0865  redoxin domain-containing protein  33.94 
 
 
167 aa  90.9  7e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0949069 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0642  thiol peroxidase (scavengase P20)  39.32 
 
 
175 aa  90.5  9e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3312  redoxin domain-containing protein  39.74 
 
 
166 aa  89.7  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1247  Redoxin domain protein  38.41 
 
 
173 aa  89.7  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00450523  normal  0.919673 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1783  thiol peroxidase (scavengase P20)  33.13 
 
 
181 aa  90.5  1e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3734  redoxin  33.54 
 
 
164 aa  89.7  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.085288  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2114  redoxin domain-containing protein  35.22 
 
 
165 aa  89.4  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1903  thiol peroxidase  32.93 
 
 
167 aa  89  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1795  thiol peroxidase  32.93 
 
 
167 aa  89  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1193  redoxin domain-containing protein  29.25 
 
 
165 aa  87.8  5e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0867  Redoxin domain protein  37.97 
 
 
170 aa  87.4  6e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.434649 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1262  redoxin domain-containing protein  34.97 
 
 
165 aa  87.8  6e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.828642 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4537  thiol peroxidase  38.46 
 
 
166 aa  86.7  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.451168  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4383  thiol peroxidase  38.46 
 
 
166 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4774  thiol peroxidase  38.46 
 
 
166 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3035  thiol peroxidase  34.67 
 
 
166 aa  86.3  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4890  thiol peroxidase  38.46 
 
 
166 aa  86.7  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0828  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  34 
 
 
187 aa  86.7  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4757  thiol peroxidase  38.46 
 
 
166 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1778  thiol peroxidase  35.5 
 
 
172 aa  86.7  1e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0408  redoxin domain-containing protein  39.71 
 
 
168 aa  86.7  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.989776  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4775  thiol peroxidase  38.46 
 
 
166 aa  86.3  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0875  Redoxin domain protein  32.21 
 
 
167 aa  86.3  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0473  Redoxin domain protein  34.73 
 
 
164 aa  86.3  2e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2625  thiol peroxidase  33.94 
 
 
166 aa  86.3  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.963895  normal  0.840008 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0997  thiol peroxidase  38.3 
 
 
164 aa  85.9  2e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.985452  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0879  Redoxin domain protein  32.21 
 
 
167 aa  86.3  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.980796  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0323  thiol peroxidase (scavengase P20)  34.75 
 
 
174 aa  85.5  2e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.0000438204  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0783  thiol peroxidase  36.91 
 
 
174 aa  84.3  7e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22170  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  31.01 
 
 
165 aa  84.3  7e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5269  Redoxin domain protein  36.59 
 
 
232 aa  84  8e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0833  thiol peroxidase  32.65 
 
 
173 aa  84  8e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.734828  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3430  Redoxin domain protein  30.97 
 
 
166 aa  84  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0751416  normal  0.0131471 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2616  thiol peroxidase  33.53 
 
 
167 aa  84  9e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.758954 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1535  thiol peroxidase  30.54 
 
 
168 aa  83.6  9e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0870  thiol peroxidase  28.85 
 
 
175 aa  83.6  0.000000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0445504  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1036  redoxin domain-containing protein  38.97 
 
 
168 aa  83.6  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31810  thiol peroxidase  32.65 
 
 
165 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.230308  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0800  thiol peroxidase  28.85 
 
 
175 aa  83.6  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.341037  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01301  thiol peroxidase  30.54 
 
 
168 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0108888  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2322  Redoxin domain protein  30.54 
 
 
168 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00106183  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0352  thiol peroxidase  35.37 
 
 
171 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2301  thiol peroxidase  30.54 
 
 
168 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0338964  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1969  thiol peroxidase  30.54 
 
 
168 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.934613  normal  0.35715 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01312  hypothetical protein  30.54 
 
 
168 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00805067  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0730  thiol peroxidase  36.07 
 
 
187 aa  82.8  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.543369 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1798  thiol peroxidase  30.54 
 
 
168 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.190801  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0528  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  30.32 
 
 
166 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.761124 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1439  thiol peroxidase  30.54 
 
 
168 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0524  Redoxin domain protein  38.69 
 
 
171 aa  82.8  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000965772  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2704  thiol peroxidase  32.41 
 
 
165 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.821537  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2313  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  38.13 
 
 
171 aa  82.4  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.262276  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0630  thiol peroxidase  36.03 
 
 
169 aa  82  0.000000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0146681  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0091  Redoxin domain protein  33.56 
 
 
166 aa  81.6  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2520  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  33.56 
 
 
166 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0980441 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1717  Redoxin domain protein  31.97 
 
 
175 aa  81.6  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>