74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0601 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0601  protein of unknown function DUF892  100 
 
 		 268 aa  524  1e-148  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.578011  normal  0.0901394 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2282  protein of unknown function DUF892  31.51 
 
 		 179 aa  70.5  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1452  hypothetical protein  32.67 
 
 		 164 aa  69.7  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.311216  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1308  protein of unknown function DUF892  33.58 
 
 		 191 aa  68.9  0.00000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.758326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3024  protein of unknown function DUF892  29.66 
 
 		 170 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.281762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2545  hypothetical protein  34.19 
 
 		 168 aa  67  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1727  protein of unknown function DUF892  33.58 
 
 		 184 aa  66.6  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403983  hitchhiker  0.000459015 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4845  protein of unknown function DUF892  31.58 
 
 		 167 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00641789  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2256  hypothetical protein  36.89 
 
 		 169 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.949168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1370  protein of unknown function DUF892  31.01 
 
 		 168 aa  63.2  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3623  hypothetical protein  34.43 
 
 		 169 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0183446 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3730  protein of unknown function DUF892  34.43 
 
 		 169 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2287  hypothetical protein  32.19 
 
 		 168 aa  61.2  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2857  hypothetical protein  25.16 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0993  protein of unknown function DUF892  29.73 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3586  protein of unknown function DUF892  29.45 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2487  protein of unknown function DUF892  27.71 
 
 		 247 aa  59.7  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.48482  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1599  protein of unknown function DUF892  30.3 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0568744  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3365  hypothetical protein  36.04 
 
 		 198 aa  57  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.430964  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4833  protein of unknown function DUF892  31.08 
 
 		 180 aa  56.2  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2390  protein of unknown function DUF892  29.41 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.421917  normal  0.147329 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2646  hypothetical protein  30.94 
 
 		 189 aa  55.1  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3141  hypothetical protein  33.9 
 
 		 189 aa  55.1  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51971  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3526  hypothetical protein  30.99 
 
 		 164 aa  55.1  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2773  protein of unknown function DUF892  27.74 
 
 		 165 aa  55.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3906  protein of unknown function DUF892  31.13 
 
 		 180 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7975  protein of unknown function DUF892  29.41 
 
 		 179 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1657  hypothetical protein  27.63 
 
 		 168 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0448276  normal  0.877202 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4465  protein of unknown function DUF892  26.32 
 
 		 168 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3614  hypothetical protein  30.46 
 
 		 180 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5614  protein of unknown function DUF892  29.8 
 
 		 168 aa  52.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.255585 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5857  protein of unknown function DUF892  27.52 
 
 		 174 aa  52.4  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0615276  normal  0.702479 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4540  protein of unknown function DUF892  29.5 
 
 		 165 aa  52.4  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.369842 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3294  hypothetical protein  28.08 
 
 		 163 aa  52.4  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.335875 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0289  protein of unknown function DUF892  31.03 
 
 		 162 aa  52.4  0.000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.302406 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2220  protein of unknown function DUF892  29.27 
 
 		 175 aa  52  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2066  hypothetical protein  31.67 
 
 		 195 aa  51.6  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0139243 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1470  hypothetical protein  25.66 
 
 		 168 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0321654  normal  0.306321 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3491  hypothetical protein  27.34 
 
 		 163 aa  50.8  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3832  hypothetical protein  27.63 
 
 		 168 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.148177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1446  hypothetical protein  27.56 
 
 		 165 aa  50.4  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.187122  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4247  hypothetical protein  31.21 
 
 		 158 aa  49.7  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0753724 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4547  hypothetical protein  26 
 
 		 183 aa  49.7  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5596  hypothetical protein  32.09 
 
 		 166 aa  49.3  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.756785  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5257  protein of unknown function DUF892  27.4 
 
 		 162 aa  49.3  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5592  protein of unknown function DUF892  27.81 
 
 		 166 aa  49.3  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.544575  hitchhiker  0.00495302 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0740  hypothetical protein  30.16 
 
 		 192 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4293  protein of unknown function DUF892  27.78 
 
 		 180 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1033  hypothetical protein  27.74 
 
 		 168 aa  48.9  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.665565  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2659  hypothetical protein  33.33 
 
 		 217 aa  48.5  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0088  ycfI, putative structural proteins  32.41 
 
 		 166 aa  47.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.136593  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4071  hypothetical protein  26.32 
 
 		 168 aa  47  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0479613  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1724  hypothetical protein  32.41 
 
 		 166 aa  47.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4275  protein of unknown function DUF892  28.06 
 
 		 165 aa  47  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2489  non-heme manganese-containing catalase  27.78 
 
 		 421 aa  47  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4780  hypothetical protein  25.17 
 
 		 183 aa  46.2  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.786292 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4158  protein of unknown function DUF892  29.31 
 
 		 162 aa  46.2  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1678  hypothetical protein  33.33 
 
 		 166 aa  45.8  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.108531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4862  hypothetical protein  28.95 
 
 		 177 aa  45.4  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3344  protein of unknown function DUF892  28.68 
 
 		 212 aa  45.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0480671 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5546  hypothetical protein  23.68 
 
 		 168 aa  45.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.376366  normal  0.380191 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3218  hypothetical protein  27.63 
 
 		 167 aa  45.4  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.708155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1999  protein of unknown function DUF892  28.12 
 
 		 175 aa  45.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6464  hypothetical protein  28.29 
 
 		 167 aa  45.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.255827  normal  0.636279 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2984  hypothetical protein  29.63 
 
 		 164 aa  45.4  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.602458 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5347  protein of unknown function DUF892  28.95 
 
 		 167 aa  44.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5401  protein of unknown function DUF892  29.61 
 
 		 167 aa  43.9  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.949113 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3554  protein of unknown function DUF892  32.65 
 
 		 161 aa  43.1  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0494833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0468  hypothetical protein  33.33 
 
 		 165 aa  43.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.53229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1820  hypothetical protein  33.33 
 
 		 169 aa  43.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.418457  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4791  hypothetical protein  25 
 
 		 165 aa  42.7  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1633  hypothetical protein  30.33 
 
 		 181 aa  42.4  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.351952 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4295  hypothetical protein  26.35 
 
 		 167 aa  42  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3827  hypothetical protein  30.09 
 
 		 149 aa  42  0.01  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>