More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3139 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3139  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  100 
 
 
458 aa  943    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00749895  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1617  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  78.51 
 
 
470 aa  733    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00988833  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3421  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  78.73 
 
 
470 aa  758    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.599581  normal  0.35369 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1116  nucleotide sugar dehydrogenase  38.9 
 
 
437 aa  283  5.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1185  nucleotide sugar dehydrogenase  38.9 
 
 
437 aa  283  6.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2891  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.96 
 
 
464 aa  266  5e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0166748  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1057  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.8 
 
 
437 aa  265  1e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2848  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.74 
 
 
459 aa  264  3e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2696  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.42 
 
 
464 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0108367  normal  0.14753 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0500  nucleotide sugar dehydrogenase  35.41 
 
 
440 aa  259  8e-68  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.64439  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0986  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.73 
 
 
467 aa  257  3e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0572  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.43 
 
 
466 aa  257  3e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1051  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.43 
 
 
466 aa  257  3e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2997  nucleotide sugar dehydrogenase  34.74 
 
 
467 aa  257  3e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.218843  hitchhiker  0.00250768 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2878  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.08 
 
 
466 aa  256  4e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.104734  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2253  nucleotide sugar dehydrogenase  35.01 
 
 
466 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4447  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.36 
 
 
438 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0463  nucleotide sugar dehydrogenase subfamily protein  36.44 
 
 
440 aa  254  2.0000000000000002e-66  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1010  nucleotide sugar dehydrogenase  35.22 
 
 
466 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0727492  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18300  putative nucleotide sugar dehydrogenase  36.58 
 
 
464 aa  254  3e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0219649  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1586  putative nucleotide sugar dehydrogenase  36.77 
 
 
464 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1839  nucleotide sugar dehydrogenase  35.01 
 
 
434 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.158743  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4164  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.01 
 
 
466 aa  253  6e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0606  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.36 
 
 
442 aa  252  9.000000000000001e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.641401  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2323  nucleotide sugar dehydrogenase  38.19 
 
 
440 aa  252  1e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12150  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.15 
 
 
458 aa  251  2e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.875801  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0750  nucleotide sugar dehydrogenase  34.81 
 
 
470 aa  250  3e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.259677  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3217  nucleotide sugar dehydrogenase  34.72 
 
 
438 aa  250  4e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3925  nucleotide sugar dehydrogenase  35.08 
 
 
437 aa  249  1e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107099  normal  0.0149623 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3526  nucleotide sugar dehydrogenase  33.92 
 
 
443 aa  249  1e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3615  nucleotide sugar dehydrogenase  35.08 
 
 
437 aa  249  1e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.285308  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0961  UDP-glucose dehydrogenase  35.71 
 
 
440 aa  248  2e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.837953  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1405  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.21 
 
 
440 aa  248  2e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3200  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.52 
 
 
446 aa  248  2e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421836  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3370  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  35.37 
 
 
438 aa  247  3e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0931  nucleotide sugar dehydrogenase  34.45 
 
 
466 aa  246  4e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0927  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.24 
 
 
466 aa  247  4e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.749259  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1710  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.23 
 
 
448 aa  246  6e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0481028  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3681  nucleotide sugar dehydrogenase  34.42 
 
 
433 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.72238  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1257  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.77 
 
 
445 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2708  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.57 
 
 
447 aa  244  1.9999999999999999e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0287014  decreased coverage  0.0000651143 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2015  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.5 
 
 
463 aa  245  1.9999999999999999e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3255  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.73 
 
 
434 aa  244  1.9999999999999999e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.564317  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3252  nucleotide sugar dehydrogenase  35.1 
 
 
438 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38360  putative nucleotide sugar dehydrogenase  34.56 
 
 
453 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0121251 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2116  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.53 
 
 
438 aa  244  3e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3001  nucleotide sugar dehydrogenase  34.58 
 
 
438 aa  243  5e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3736  nucleotide sugar dehydrogenase  36.12 
 
 
436 aa  243  5e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.894229  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3028  nucleotide sugar dehydrogenase  35.1 
 
 
438 aa  243  6e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2224  nucleotide sugar dehydrogenase  34.14 
 
 
434 aa  243  7e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.339815 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7353  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.51 
 
 
439 aa  243  7e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.870632  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1121  nucleotide sugar dehydrogenase  35.34 
 
 
447 aa  242  9e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.396392  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1143  sugar dehydrogenase  35.52 
 
 
522 aa  241  1e-62  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0400  nucleotide sugar dehydrogenase  34.86 
 
 
446 aa  242  1e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1223  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.41 
 
 
445 aa  242  1e-62  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000260089  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2941  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.08 
 
 
466 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1145  nucleotide sugar dehydrogenase  33.69 
 
 
444 aa  241  2e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.91161  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2330  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  34.63 
 
 
448 aa  241  2e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0299492  normal  0.148756 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3703  nucleotide sugar dehydrogenase  32.69 
 
 
470 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.757511  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1968  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  34.63 
 
 
448 aa  241  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.250179  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1343  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.77 
 
 
440 aa  241  2e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.243911  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1502  nucleotide sugar dehydrogenase  34.92 
 
 
445 aa  241  2e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.239103  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3724  nucleotide sugar dehydrogenase  32.91 
 
 
470 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114247  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2077  nucleotide sugar dehydrogenase  34.63 
 
 
448 aa  241  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4542  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.69 
 
 
470 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3821  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.69 
 
 
470 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2988  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.08 
 
 
466 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0712  nucleotide sugar dehydrogenase  33.41 
 
 
438 aa  240  2.9999999999999997e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1642  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.08 
 
 
466 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.602201  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0408  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.08 
 
 
446 aa  240  4e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5547  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.69 
 
 
470 aa  240  5e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.143587  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1948  nucleotide sugar dehydrogenase  34.14 
 
 
434 aa  240  5e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.286781  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4305  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.92 
 
 
436 aa  239  1e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.434047  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1408  nucleotide sugar dehydrogenase  36.96 
 
 
445 aa  239  1e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0334536  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2489  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.2 
 
 
436 aa  239  1e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.656583  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0783  nucleotide sugar dehydrogenase  32.83 
 
 
454 aa  238  1e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.159514 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5066  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.91 
 
 
440 aa  238  2e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2275  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.48 
 
 
470 aa  238  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.74283  normal  0.168164 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4460  nucleotide sugar dehydrogenase  33.7 
 
 
436 aa  238  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2755  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.45 
 
 
436 aa  238  2e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1388  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.79 
 
 
442 aa  238  2e-61  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0913  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.69 
 
 
457 aa  237  3e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2536  nucleotide sugar dehydrogenase  32.59 
 
 
427 aa  237  3e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.171539 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0206  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.87 
 
 
466 aa  237  3e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.964419  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0423  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.87 
 
 
466 aa  237  3e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1284  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  35.79 
 
 
439 aa  237  3e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.583067 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2567  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.87 
 
 
466 aa  237  3e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4441  nucleotide sugar dehydrogenase  33.7 
 
 
435 aa  237  3e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0942  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.87 
 
 
466 aa  237  3e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2487  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.43 
 
 
442 aa  236  4e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0854  nucleotide sugar dehydrogenase  33.05 
 
 
454 aa  237  4e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.74874 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2339  nucleotide sugar dehydrogenase  35.36 
 
 
443 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1513  nucleotide sugar dehydrogenase  33.84 
 
 
437 aa  236  6e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0795  nucleotide sugar dehydrogenase  33.55 
 
 
434 aa  236  6e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2639  nucleotide sugar dehydrogenase  33.55 
 
 
434 aa  235  1.0000000000000001e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.404662  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0653  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.6 
 
 
434 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0616726  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1921  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.11 
 
 
434 aa  235  1.0000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.455282  normal  0.479029 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2306  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.6 
 
 
434 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.595452  normal  0.13158 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0785  nucleotide sugar dehydrogenase  33.83 
 
 
449 aa  235  1.0000000000000001e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180354  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2817  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.64 
 
 
446 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>