More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3421 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1617  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  96.34 
 
 		 470 aa  898    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00988833  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3421  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  100 
 
 		 470 aa  964    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.599581  normal  0.35369 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3139  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  78.73 
 
 		 458 aa  758    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00749895  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0986  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.76 
 
 		 467 aa  279  6e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2997  nucleotide sugar dehydrogenase  36.72 
 
 		 467 aa  279  8e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.218843  hitchhiker  0.00250768 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0500  nucleotide sugar dehydrogenase  36.01 
 
 		 440 aa  269  5.9999999999999995e-71  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.64439  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2891  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.39 
 
 		 464 aa  268  1e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0166748  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2253  nucleotide sugar dehydrogenase  37.08 
 
 		 466 aa  268  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2878  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.53 
 
 		 466 aa  268  2e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.104734  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0572  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.63 
 
 		 466 aa  267  4e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1051  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.63 
 
 		 466 aa  267  4e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1116  nucleotide sugar dehydrogenase  38.46 
 
 		 437 aa  266  7e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1185  nucleotide sugar dehydrogenase  38.46 
 
 		 437 aa  266  8e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1010  nucleotide sugar dehydrogenase  37.63 
 
 		 466 aa  266  8e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0727492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0750  nucleotide sugar dehydrogenase  36.46 
 
 		 470 aa  266  8.999999999999999e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.259677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0606  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.61 
 
 		 442 aa  263  4.999999999999999e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.641401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4164  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.4 
 
 		 466 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2696  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.96 
 
 		 464 aa  261  1e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0108367  normal  0.14753 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1586  putative nucleotide sugar dehydrogenase  38.18 
 
 		 464 aa  261  2e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2116  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.23 
 
 		 438 aa  260  4e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4447  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.04 
 
 		 438 aa  260  4e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0927  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.59 
 
 		 466 aa  260  4e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.749259  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0931  nucleotide sugar dehydrogenase  36.8 
 
 		 466 aa  259  8e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1839  nucleotide sugar dehydrogenase  36.72 
 
 		 434 aa  257  3e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.158743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2323  nucleotide sugar dehydrogenase  37.12 
 
 		 440 aa  257  3e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2848  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.45 
 
 		 459 aa  257  3e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18300  putative nucleotide sugar dehydrogenase  37.96 
 
 		 464 aa  256  5e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0219649  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0913  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.58 
 
 		 457 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0400  nucleotide sugar dehydrogenase  37.31 
 
 		 446 aa  255  1.0000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3681  nucleotide sugar dehydrogenase  35.28 
 
 		 433 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.72238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3217  nucleotide sugar dehydrogenase  36.49 
 
 		 438 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0408  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.31 
 
 		 446 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1058  nucleotide sugar dehydrogenase  36.44 
 
 		 476 aa  254  3e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2941  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.74 
 
 		 466 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0854  nucleotide sugar dehydrogenase  35.62 
 
 		 454 aa  253  5.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.74874 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0783  nucleotide sugar dehydrogenase  35.41 
 
 		 454 aa  253  6e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.159514 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2988  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.74 
 
 		 466 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3703  nucleotide sugar dehydrogenase  34.82 
 
 		 470 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.757511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4542  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.82 
 
 		 470 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3821  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.82 
 
 		 470 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2708  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.45 
 
 		 447 aa  252  9.000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0287014  decreased coverage  0.0000651143 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1642  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.61 
 
 		 466 aa  251  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.602201  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3200  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.36 
 
 		 446 aa  251  2e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421836  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3724  nucleotide sugar dehydrogenase  35.08 
 
 		 470 aa  251  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114247  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2565  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.18 
 
 		 457 aa  251  3e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.208058  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3615  nucleotide sugar dehydrogenase  35.09 
 
 		 437 aa  251  3e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.285308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3925  nucleotide sugar dehydrogenase  35.09 
 
 		 437 aa  251  3e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107099  normal  0.0149623 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4918  nucleotide sugar dehydrogenase  34.75 
 
 		 470 aa  250  4e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103768  hitchhiker  0.000469095 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1408  nucleotide sugar dehydrogenase  37.42 
 
 		 445 aa  250  4e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0334536  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5547  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.87 
 
 		 470 aa  250  4e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.143587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2275  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.61 
 
 		 470 aa  249  6e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.74283  normal  0.168164 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2616  nucleotide sugar dehydrogenase  35.56 
 
 		 449 aa  249  7e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.587392  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0206  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.53 
 
 		 466 aa  249  8e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.964419  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0423  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.53 
 
 		 466 aa  249  8e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0942  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.53 
 
 		 466 aa  249  8e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2567  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.53 
 
 		 466 aa  249  8e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1057  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.8 
 
 		 437 aa  249  9e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4606  nucleotide sugar dehydrogenase  35.18 
 
 		 456 aa  249  9e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.094228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0961  UDP-glucose dehydrogenase  35.5 
 
 		 440 aa  248  1e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.837953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2224  nucleotide sugar dehydrogenase  36.36 
 
 		 434 aa  248  1e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.339815 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1276  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.7 
 
 		 450 aa  248  2e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3252  nucleotide sugar dehydrogenase  36.12 
 
 		 438 aa  248  2e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0463  nucleotide sugar dehydrogenase subfamily protein  34.57 
 
 		 440 aa  248  2e-64  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1022  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.34 
 
 		 452 aa  248  2e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000993362  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1534  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.74 
 
 		 445 aa  248  2e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1244  nucleotide sugar dehydrogenase  35.7 
 
 		 450 aa  247  3e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.170617  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1502  nucleotide sugar dehydrogenase  36.72 
 
 		 445 aa  247  4e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.239103  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1405  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.96 
 
 		 440 aa  247  4e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2245  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.03 
 
 		 482 aa  247  4e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.807872  normal  0.51685 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3028  nucleotide sugar dehydrogenase  36.12 
 
 		 438 aa  247  4e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1956  nucleotide sugar dehydrogenase  34.92 
 
 		 482 aa  246  4e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.373537  normal  0.743154 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1948  nucleotide sugar dehydrogenase  36.6 
 
 		 434 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.286781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0726  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  35.03 
 
 		 457 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0132255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0712  nucleotide sugar dehydrogenase  32.68 
 
 		 438 aa  246  6.999999999999999e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29960  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase protein  37.23 
 
 		 440 aa  246  6.999999999999999e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2236  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.28 
 
 		 452 aa  246  8e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.66393 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1072  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.56 
 
 		 457 aa  246  9e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2339  nucleotide sugar dehydrogenase  36.3 
 
 		 443 aa  245  9.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1145  nucleotide sugar dehydrogenase  33.98 
 
 		 444 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.91161  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0544  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.13 
 
 		 473 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4305  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.4 
 
 		 436 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.434047  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1003  nucleotide sugar dehydrogenase  37.17 
 
 		 445 aa  244  3e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.783372 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12150  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.5 
 
 		 458 aa  244  3e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.875801  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1858  nucleotide sugar dehydrogenase  36.02 
 
 		 450 aa  244  3e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.840288  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4441  nucleotide sugar dehydrogenase  36.4 
 
 		 435 aa  244  3e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4460  nucleotide sugar dehydrogenase  36.4 
 
 		 436 aa  244  3e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2622  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.53 
 
 		 473 aa  244  3e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1143  sugar dehydrogenase  34.13 
 
 		 522 aa  243  5e-63  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7353  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.87 
 
 		 439 aa  243  6e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.870632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1121  nucleotide sugar dehydrogenase  36.56 
 
 		 447 aa  243  6e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.396392  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0578  nucleotide sugar dehydrogenase  34.4 
 
 		 453 aa  243  7e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.851366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1280  nucleotide sugar dehydrogenase  36.88 
 
 		 445 aa  243  7.999999999999999e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000077614  normal  0.824571 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0917  UDP-glucose 6-dehydrogenase 2  34.32 
 
 		 473 aa  242  9e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.853858  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1343  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.88 
 
 		 440 aa  242  9e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.243911  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2484  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.32 
 
 		 473 aa  242  9e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2487  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.17 
 
 		 442 aa  242  1e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27790  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.39 
 
 		 440 aa  242  1e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2015  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.36 
 
 		 463 aa  241  2e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2489  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35 
 
 		 436 aa  241  2e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.656583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1388  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.78 
 
 		 442 aa  240  2.9999999999999997e-62  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>