208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1224 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1224  protein of unknown function UPF0005  100 
 
 		 221 aa  421  1e-117  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1784  hypothetical protein  37.07 
 
 		 226 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0234  hypothetical protein  35.71 
 
 		 231 aa  102  4e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1506  conserved hypothetical integral membrane protein (UPF0005 domain protein)  36.57 
 
 		 233 aa  102  4e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.874501  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0287  hypothetical protein  36 
 
 		 231 aa  102  6e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0261  hypothetical protein  36 
 
 		 231 aa  102  6e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0337  putative ferric receptor CfrA  37.5 
 
 		 232 aa  99.8  3e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.284951  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2115  ribonuclease 3 (ribonuclease III) (RNase III)  35 
 
 		 236 aa  97.4  1e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2270  protein of unknown function UPF0005  39.09 
 
 		 235 aa  94.4  1e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0296  integral membrane protein, interacts with FtsH  36.89 
 
 		 229 aa  94  2e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1590  hypothetical protein  34.5 
 
 		 232 aa  92  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.70175 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2545  protein of unknown function UPF0005  34.06 
 
 		 232 aa  91.3  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0069764  hitchhiker  0.00953127 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0363  hypothetical protein  33.33 
 
 		 234 aa  89.7  3e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000375584  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0852  hypothetical protein  34.43 
 
 		 230 aa  89.4  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000920073  hitchhiker  0.0000816273 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1604  hypothetical protein  34.38 
 
 		 229 aa  89  5e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000120987  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2825  hypothetical protein  33.18 
 
 		 231 aa  85.5  6e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2135  protein of unknown function UPF0005  29.11 
 
 		 224 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000126881  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1459  hypothetical protein  33.04 
 
 		 232 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.372489  normal  0.378234 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1424  hypothetical protein  32.62 
 
 		 232 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.170635  normal  0.0981664 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1754  hypothetical protein  32.61 
 
 		 232 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1727  hypothetical protein  32.61 
 
 		 232 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.593403  normal  0.215205 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6263  hypothetical protein  32.61 
 
 		 232 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1816  hypothetical protein  32.61 
 
 		 232 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.152452  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1840  hypothetical protein  32.61 
 
 		 232 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.339326 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5117  hypothetical protein  32.17 
 
 		 232 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0409876  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2081  protein of unknown function UPF0005  28.63 
 
 		 224 aa  82.4  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0430200000000002e-29 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2359  hypothetical protein  31.86 
 
 		 232 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.372177  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2230  hypothetical protein  31.86 
 
 		 232 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2194  hypothetical protein  31.86 
 
 		 232 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.259485  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2232  hypothetical protein  31.86 
 
 		 232 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0549  hypothetical protein  32.88 
 
 		 232 aa  81.6  0.000000000000008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.235256  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1349  hypothetical protein  31.86 
 
 		 232 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2111  hypothetical protein  32.55 
 
 		 235 aa  80.9  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.312383  normal  0.217151 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1782  hypothetical protein  33.82 
 
 		 218 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.104064  normal  0.0481152 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1839  hypothetical protein  31.86 
 
 		 232 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0058  hypothetical protein  31.86 
 
 		 232 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.143946  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1111  hypothetical protein  31.86 
 
 		 232 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1764  hypothetical protein  34.29 
 
 		 230 aa  80.9  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.241262  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1441  protein of unknown function UPF0005  34.29 
 
 		 230 aa  80.9  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0811132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2054  hypothetical protein  33.48 
 
 		 232 aa  79.7  0.00000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.213667  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3983  hypothetical protein  35.82 
 
 		 236 aa  77.4  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4095  protein of unknown function UPF0005  39.04 
 
 		 236 aa  77.4  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4126  protein of unknown function UPF0005  39.04 
 
 		 236 aa  77  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3069  hypothetical protein  29.44 
 
 		 231 aa  75.9  0.0000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0838324  normal  0.177428 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0971  hypothetical protein  38.64 
 
 		 223 aa  74.3  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000502235  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0538  hypothetical protein  33.52 
 
 		 228 aa  74.7  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3353  hypothetical protein  32.85 
 
 		 248 aa  74.7  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0772  hypothetical protein  34.62 
 
 		 233 aa  74.7  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.768217  normal  0.283665 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3056  hypothetical protein  29.87 
 
 		 229 aa  73.6  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2043  hypothetical protein  35.33 
 
 		 261 aa  73.2  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.28558  normal  0.977268 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2091  hypothetical protein  30.19 
 
 		 233 aa  72.4  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0927  protein of unknown function UPF0005  34.21 
 
 		 235 aa  72.4  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.441127 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1899  integral membrane protein, interacts with FtsH  34.48 
 
 		 237 aa  72  0.000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0383513  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1912  protein of unknown function UPF0005  34.98 
 
 		 261 aa  71.6  0.000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.224132 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2134  protein of unknown function UPF0005  32.79 
 
 		 235 aa  71.6  0.000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00000000183428  normal  0.170874 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2350  hypothetical protein  33.65 
 
 		 222 aa  70.9  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0554095  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0386  putative transport protein  34.73 
 
 		 263 aa  71.2  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.631786 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1395  hypothetical protein  32.47 
 
 		 252 aa  70.1  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.681625  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1210  hypothetical protein  31.13 
 
 		 233 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0661  protein of unknown function UPF0005  30.05 
 
 		 233 aa  70.5  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.00649456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2601  membrane protein, putaive  37.88 
 
 		 233 aa  70.1  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0232013  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2215  hypothetical protein  30.77 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000153024  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4057  protein of unknown function UPF0005  34.23 
 
 		 242 aa  70.1  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0738  protein of unknown function UPF0005  35.1 
 
 		 234 aa  70.1  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000107382  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1146  protein of unknown function UPF0005  30.7 
 
 		 233 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39216  normal  0.517284 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4182  hypothetical protein  34.23 
 
 		 256 aa  69.7  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.253743  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3734  protein of unknown function UPF0005  33.56 
 
 		 242 aa  69.3  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1054  protein of unknown function UPF0005  31.16 
 
 		 233 aa  69.3  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.698213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2776  hypothetical protein  29.13 
 
 		 231 aa  68.9  0.00000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1294  hypothetical protein  29.63 
 
 		 233 aa  68.9  0.00000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000365925  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1257  hypothetical protein  31.8 
 
 		 231 aa  68.6  0.00000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0923659 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1913  hypothetical protein  34.16 
 
 		 259 aa  68.2  0.00000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.841584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1437  protein of unknown function UPF0005  27.31 
 
 		 230 aa  67.8  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2573  hypothetical protein  29.41 
 
 		 230 aa  68.2  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.0057629  decreased coverage  0.000137367 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2411  hypothetical protein  27.31 
 
 		 230 aa  67.8  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.411936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4627  hypothetical protein  28.71 
 
 		 230 aa  67.4  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000408248 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2543  protein of unknown function UPF0005  37.01 
 
 		 255 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.516916  normal  0.0807809 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0710  integral membrane protein, interacts with FtsH  34.64 
 
 		 239 aa  67  0.0000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0741139  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6925  hypothetical protein  34.25 
 
 		 239 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0896  protein of unknown function UPF0005  32.72 
 
 		 229 aa  67  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.723604 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3316  hypothetical protein  28.91 
 
 		 230 aa  67.4  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.2042  normal  0.782956 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1325  hypothetical protein  34.42 
 
 		 236 aa  66.6  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.891235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1843  hypothetical protein  32.24 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000008049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2225  protein of unknown function UPF0005  36.22 
 
 		 255 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0352825 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2947  protein of unknown function UPF0005  33.12 
 
 		 235 aa  65.5  0.0000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2427  protein of unknown function UPF0005  32.47 
 
 		 236 aa  65.1  0.0000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1019  hypothetical protein  32.04 
 
 		 256 aa  65.5  0.0000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.219255  normal  0.241296 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2779  hypothetical protein  30.74 
 
 		 240 aa  64.3  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.196634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3076  hypothetical protein  31.33 
 
 		 245 aa  64.7  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1517  hypothetical protein  33.12 
 
 		 235 aa  64.7  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0088  hypothetical protein  34.65 
 
 		 245 aa  63.5  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.695225  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0443  hypothetical protein  32.97 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3558  hypothetical protein  35.14 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.487101  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1390  hypothetical protein  27.82 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.330784 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0001  hypothetical protein  30.2 
 
 		 257 aa  63.9  0.000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0393  protein of unknown function UPF0005  34.46 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2518  protein of unknown function UPF0005  32.47 
 
 		 236 aa  63.2  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0945287  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0086  hypothetical protein  34.65 
 
 		 245 aa  62.8  0.000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1802  protein of unknown function UPF0005  28.64 
 
 		 233 aa  62.8  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525736  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1502  integral membrane protein, interacts with FtsH  26.64 
 
 		 243 aa  62.8  0.000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.230664  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>