128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0682 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0682  biotin/lipoate A/B protein ligase  100 
 
 
275 aa  557  1e-158  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0153413  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1002  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.86 
 
 
362 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0931  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.67 
 
 
343 aa  90.9  2e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000248179  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0443  biotin/lipoate A/B protein ligase  30.07 
 
 
530 aa  88.6  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1106  Lipoate--protein ligase  29.95 
 
 
245 aa  85.9  6e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000000820504  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2034  biotin/lipoate A/B protein ligase  33.74 
 
 
366 aa  82  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2168  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.38 
 
 
335 aa  80.1  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00545206  hitchhiker  0.000000520925 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1560  biotin/lipoate A/B protein ligase  31.06 
 
 
344 aa  79.3  0.00000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0396798 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2540  biotin/lipoate A/B protein ligase family protein  27.27 
 
 
303 aa  78.2  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2086  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.05 
 
 
344 aa  77.8  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1514  biotin/lipoate A/B protein ligase  23.67 
 
 
261 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0104687 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1480  lipoate-protein ligase  33.55 
 
 
364 aa  72  0.00000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.521497  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2173  biotin/lipoate A/B protein ligase  25.86 
 
 
356 aa  70.1  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.679039  decreased coverage  0.000000000726509 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2545  lipoate-protein ligase A, putative  25.86 
 
 
356 aa  70.1  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.752721  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3413  biotin/lipoate A/B protein ligase  21.67 
 
 
261 aa  68.9  0.00000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0322711  normal  0.107721 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2206  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.52 
 
 
360 aa  68.2  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.46351  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1591  biotin/lipoate A/B protein ligase  23.53 
 
 
276 aa  67.4  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00744993  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1624  biotin/lipoate A/B protein ligase  23.53 
 
 
276 aa  67.4  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.997358  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0642  Lipoate--protein ligase  25.35 
 
 
363 aa  67.8  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.336498  normal  0.0925855 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1701  biotin/lipoate A/B protein ligase  20.75 
 
 
349 aa  65.9  0.0000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.407225  normal  0.0224551 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0450  biotin/lipoate A/B protein ligase  23.31 
 
 
259 aa  64.7  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0648  biotin/lipoate A/B protein ligase  23.16 
 
 
348 aa  64.7  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.435247  normal  0.0871201 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1171  hypothetical protein  23.56 
 
 
326 aa  64.3  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.268506 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1879  biotin/lipoate A/B protein ligase  23.24 
 
 
365 aa  64.3  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00459014 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2168  biotin/lipoate A/B protein ligase  24.59 
 
 
347 aa  64.3  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1097  lipoate-protein ligase A family protein  22.61 
 
 
276 aa  63.9  0.000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1056  biotin/lipoate A/B protein ligase  25.45 
 
 
359 aa  63.9  0.000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2343  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.92 
 
 
510 aa  63.9  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.855949  hitchhiker  0.000773035 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2721  lipoate-protein ligase A, putative  26.92 
 
 
510 aa  63.9  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.966244  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1213  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  24.78 
 
 
329 aa  62  0.00000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2128  biotin/lipoate A/B protein ligase  23.63 
 
 
372 aa  62  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0607832  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0965  Lipoate--protein ligase  19.19 
 
 
257 aa  60.8  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.119458  normal  0.259111 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4031  biotin/lipoate A/B protein ligase  18.96 
 
 
349 aa  61.2  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2218  biotin/lipoate A/B protein ligase  21.39 
 
 
349 aa  60.8  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1086  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  25.79 
 
 
328 aa  59.3  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000389692  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1108  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  25.79 
 
 
328 aa  59.3  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000525877  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0233  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  29.58 
 
 
326 aa  59.3  0.00000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2899  biotin/lipoate A/B protein ligase  22.11 
 
 
278 aa  58.9  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.237083  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2663  biotin/lipoate A/B protein ligase  20.73 
 
 
275 aa  58.9  0.00000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09720  lipoate-protein ligase A  20.77 
 
 
364 aa  58.9  0.00000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.331543  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1555  lipoate-protein ligase  25 
 
 
325 aa  58.2  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10810  lipoate-protein ligase A  20.51 
 
 
349 aa  57.8  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0653511  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0219  biotin/lipoate A/B protein ligase  32.14 
 
 
278 aa  57.8  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2355  biotin/lipoate A/B protein ligase  32.14 
 
 
278 aa  56.6  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1056  lipoate-protein ligase A  28.95 
 
 
339 aa  57  0.0000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1428  biotin/lipoate A/B protein ligase  18.99 
 
 
354 aa  56.6  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0914  putative lipoate-protein ligase A  20.65 
 
 
278 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.017149  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4284  lipoate-protein ligase A, putative  20.65 
 
 
278 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3952  lipoate-protein ligase A  20.65 
 
 
278 aa  55.8  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3962  lipoate-protein ligase A  20.65 
 
 
278 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4339  putative lipoate-protein ligase A  20.65 
 
 
278 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4319  putative lipoate-protein ligase A  20.65 
 
 
278 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4228  putative lipoate-protein ligase A  20.65 
 
 
278 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4111  lipoate-protein ligase A  20.65 
 
 
278 aa  55.8  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4431  lipoate-protein ligase A  20.65 
 
 
278 aa  55.8  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1172  Lipoate--protein ligase  18.18 
 
 
358 aa  55.8  0.0000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.260617 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0449  lipoate-protein ligase  24.68 
 
 
345 aa  55.5  0.000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0102299  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1677  lipoate-protein ligase  23.75 
 
 
337 aa  54.7  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0374805  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2379  biotin/lipoate A/B protein ligase  19.9 
 
 
358 aa  55.5  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4063  biotin/lipoate A/B protein ligase  21.14 
 
 
278 aa  54.7  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.934353  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11650  lipoate-protein ligase A  21.05 
 
 
352 aa  54.7  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1014  lipoate-protein ligase  25.84 
 
 
329 aa  53.5  0.000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00464071  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0328  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.52 
 
 
259 aa  53.5  0.000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2238  biotin/lipoate A/B protein ligase  21.58 
 
 
271 aa  53.1  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.791553  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0881  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  28.57 
 
 
345 aa  52.8  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0333925  normal  0.884852 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2647  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase family protein  26.32 
 
 
331 aa  52.4  0.000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.179015  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0786  lipoate-protein ligase-related protein  28.75 
 
 
233 aa  51.6  0.00001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0616  lipoate-protein ligase A family protein  24.34 
 
 
328 aa  51.6  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3768  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  22.93 
 
 
329 aa  51.6  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1189  lipoate-protein ligase A, putative  23.18 
 
 
329 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1017  lipoate-protein ligase A  23.18 
 
 
329 aa  51.2  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1001  lipoate-protein ligase A  23.18 
 
 
329 aa  51.2  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1004  lipoate-protein ligase A  23.18 
 
 
329 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1089  lipoate-protein ligase A  23.18 
 
 
329 aa  51.2  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1752  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  26.53 
 
 
329 aa  50.8  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0545  lipoate-protein ligase A  24.29 
 
 
338 aa  51.2  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0965348 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1248  putative lipoate-protein ligase A  23.18 
 
 
329 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4185  putative lipoate-protein ligase A  23.18 
 
 
329 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1167  putative lipoate-protein ligase A  23.18 
 
 
329 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0785  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  25.62 
 
 
327 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0224  lipoate-protein ligase  27.08 
 
 
334 aa  50.8  0.00003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1053  biotin/lipoate A/B protein ligase  23.58 
 
 
357 aa  50.8  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1974  lipoate-protein ligase  19.35 
 
 
332 aa  50.1  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0980  lipoate-protein ligase A  19.68 
 
 
253 aa  50.1  0.00004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05080  lipoate-protein ligase  26.74 
 
 
332 aa  49.7  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.341449  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0376  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  22.55 
 
 
340 aa  49.3  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0386  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  22.55 
 
 
340 aa  49.3  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.858676  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0839  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  23.01 
 
 
329 aa  49.3  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0399  biotin/lipoate A/B protein ligase  21.9 
 
 
266 aa  49.7  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1121  putative lipoate-protein ligase A  22.94 
 
 
329 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2805  biotin/lipoate A/B protein ligase  20.91 
 
 
278 aa  49.3  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1506  biotin/lipoate A/B protein ligase  24.86 
 
 
240 aa  48.9  0.00008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0393  biotin/lipoate A/B protein ligase  21.01 
 
 
267 aa  48.9  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.50261 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4935  lipoate-protein ligase A  21.79 
 
 
338 aa  48.9  0.00009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.672461 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4899  lipoate-protein ligase A  22.68 
 
 
338 aa  48.9  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3612  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  21.79 
 
 
338 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0396  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.71 
 
 
275 aa  48.5  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4985  lipoate-protein ligase A  22.28 
 
 
338 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1006  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  22.48 
 
 
329 aa  48.5  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4826  lipoate-protein ligase A  22.68 
 
 
338 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>