96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0786 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002620  TC0786  lipoate-protein ligase-related protein  100 
 
 
233 aa  488  1e-137  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34954  predicted protein  29.11 
 
 
260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.629581  normal  0.0447798 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12459  predicted protein  38.93 
 
 
179 aa  113  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0355992  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2611  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.33 
 
 
253 aa  75.5  0.0000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.60182  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0881  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  30.91 
 
 
345 aa  72.8  0.000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0333925  normal  0.884852 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1542  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  30.57 
 
 
332 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0233  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  27.32 
 
 
326 aa  70.1  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2894  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  30.81 
 
 
334 aa  68.6  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0847  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  29.95 
 
 
325 aa  65.9  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.918447  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1974  lipoate-protein ligase  26.88 
 
 
332 aa  65.1  0.0000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3768  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  28.76 
 
 
329 aa  63.2  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1677  lipoate-protein ligase  26.49 
 
 
337 aa  60.5  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0374805  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0224  lipoate-protein ligase  26 
 
 
334 aa  60.8  0.00000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05080  lipoate-protein ligase  31.1 
 
 
332 aa  60.8  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.341449  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0785  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  26.42 
 
 
327 aa  59.3  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1555  lipoate-protein ligase  26.36 
 
 
325 aa  58.5  0.00000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2162  lipoate-protein ligase A  28.1 
 
 
337 aa  58.2  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.922433 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1121  putative lipoate-protein ligase A  26.79 
 
 
329 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0052  lipoate-protein ligase  24.24 
 
 
333 aa  57.4  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1167  putative lipoate-protein ligase A  26.79 
 
 
329 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1752  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  26.47 
 
 
329 aa  56.6  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1189  lipoate-protein ligase A, putative  26.79 
 
 
329 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1006  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  26.79 
 
 
329 aa  56.6  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0327  lipoate-protein ligase  25.78 
 
 
334 aa  56.6  0.0000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1248  putative lipoate-protein ligase A  26.79 
 
 
329 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1017  lipoate-protein ligase A  26.79 
 
 
329 aa  56.6  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4185  putative lipoate-protein ligase A  26.79 
 
 
329 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1001  lipoate-protein ligase A  26.79 
 
 
329 aa  56.6  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1089  lipoate-protein ligase A  26.79 
 
 
329 aa  56.6  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1004  lipoate-protein ligase A  26.79 
 
 
329 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3612  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  27.2 
 
 
338 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0545  lipoate-protein ligase A  27.91 
 
 
338 aa  56.6  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0965348 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0197  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  35.07 
 
 
339 aa  56.2  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1733  lipoate-protein ligase A  27.33 
 
 
338 aa  56.2  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3670  lipoate-protein ligase A  27.91 
 
 
338 aa  55.8  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.632003 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1839  lipoate-protein ligase A  27.33 
 
 
338 aa  56.2  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4935  lipoate-protein ligase A  27.91 
 
 
338 aa  55.8  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.672461 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2604  lipoate-protein ligase A  27.33 
 
 
338 aa  56.2  0.0000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1171  hypothetical protein  24.39 
 
 
326 aa  56.2  0.0000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.268506 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4621  lipoate-protein ligase A  27.91 
 
 
338 aa  55.8  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5901  unknown domain/lipoate-protein ligase A fusion protein  27.91 
 
 
562 aa  56.2  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04227  hypothetical protein  27.91 
 
 
338 aa  55.8  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04262  lipoate-protein ligase A  27.91 
 
 
338 aa  55.8  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4985  lipoate-protein ligase A  27.91 
 
 
338 aa  55.8  0.0000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4933  lipoate-protein ligase A  27.91 
 
 
338 aa  55.8  0.0000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.553112  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0736  lipoate-protein ligase  24.81 
 
 
336 aa  55.8  0.0000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4985  lipoate-protein ligase A  27.91 
 
 
338 aa  55.5  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4826  lipoate-protein ligase A  27.91 
 
 
338 aa  55.5  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4899  lipoate-protein ligase A  27.91 
 
 
338 aa  55.1  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4987  lipoate-protein ligase A  27.91 
 
 
338 aa  55.5  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0882  lipoate-protein ligase A  27.13 
 
 
329 aa  55.1  0.0000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1014  lipoate-protein ligase  26.53 
 
 
329 aa  55.5  0.0000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00464071  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0839  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  26.63 
 
 
329 aa  55.5  0.0000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl038  lipoate-protein ligase  25.49 
 
 
334 aa  54.7  0.000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0070  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  34.33 
 
 
343 aa  54.7  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1213  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  29.01 
 
 
329 aa  55.1  0.000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2465  lipoate-protein ligase A  28.12 
 
 
338 aa  54.3  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.249663  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1002  biotin/lipoate A/B protein ligase  25.15 
 
 
362 aa  53.9  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4933  lipoate-protein ligase A  27.91 
 
 
338 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11650  lipoate-protein ligase A  27.91 
 
 
352 aa  53.1  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0897  Lipoate--protein ligase  25 
 
 
247 aa  52.8  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2184  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  24.73 
 
 
329 aa  52.8  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000642263 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4028  lipoate-protein ligase A  27.67 
 
 
337 aa  52.4  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01600  conserved hypothetical protein  30.72 
 
 
396 aa  52.4  0.000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0449  lipoate-protein ligase  36.96 
 
 
345 aa  52.4  0.000007  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0102299  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1629  lipoate-protein ligase A  26.4 
 
 
338 aa  52  0.000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1056  lipoate-protein ligase A  26.17 
 
 
339 aa  52  0.000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0682  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.75 
 
 
275 aa  51.6  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0153413  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1551  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase family protein  24.5 
 
 
331 aa  50.8  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.23083  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2128  biotin/lipoate A/B protein ligase  25.53 
 
 
372 aa  50.8  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0607832  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2647  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase family protein  24.18 
 
 
331 aa  50.4  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.179015  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09720  lipoate-protein ligase A  27.27 
 
 
364 aa  50.1  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.331543  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2379  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.21 
 
 
358 aa  50.1  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1106  Lipoate--protein ligase  23.28 
 
 
245 aa  49.7  0.00004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000000820504  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0616  lipoate-protein ligase A family protein  23.41 
 
 
328 aa  49.7  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0931  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.61 
 
 
343 aa  49.7  0.00004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000248179  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1879  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.93 
 
 
365 aa  49.3  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00459014 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0450  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.47 
 
 
259 aa  48.9  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0443  biotin/lipoate A/B protein ligase  22.58 
 
 
530 aa  48.5  0.00009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1108  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  25.49 
 
 
328 aa  48.5  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000525877  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1086  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  25.49 
 
 
328 aa  48.5  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000389692  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2545  lipoate-protein ligase A, putative  22.9 
 
 
356 aa  48.1  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.752721  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2173  biotin/lipoate A/B protein ligase  22.9 
 
 
356 aa  48.1  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.679039  decreased coverage  0.000000000726509 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0642  Lipoate--protein ligase  21.52 
 
 
363 aa  47.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.336498  normal  0.0925855 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1172  Lipoate--protein ligase  24.83 
 
 
358 aa  47.4  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.260617 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13820  lipoate-protein ligase A  27.53 
 
 
289 aa  47.4  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2206  biotin/lipoate A/B protein ligase  22.58 
 
 
360 aa  47.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.46351  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2218  biotin/lipoate A/B protein ligase  25.95 
 
 
349 aa  47.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2663  biotin/lipoate A/B protein ligase  25.64 
 
 
275 aa  46.6  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1000  lipoate-protein ligase A  25.93 
 
 
338 aa  45.4  0.0008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1701  biotin/lipoate A/B protein ligase  25.87 
 
 
349 aa  43.9  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.407225  normal  0.0224551 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10810  lipoate-protein ligase A  27.52 
 
 
349 aa  43.5  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0653511  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3413  biotin/lipoate A/B protein ligase  22.54 
 
 
261 aa  42.7  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0322711  normal  0.107721 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1560  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.75 
 
 
344 aa  42.7  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0396798 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0648  biotin/lipoate A/B protein ligase  24.32 
 
 
348 aa  42.4  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.435247  normal  0.0871201 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2238  biotin/lipoate A/B protein ligase  24.43 
 
 
271 aa  42  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.791553  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>