127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_04262 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_04262  lipoate-protein ligase A  100 
 
 
338 aa  704    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3612  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  97.63 
 
 
338 aa  691    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0545  lipoate-protein ligase A  90.53 
 
 
338 aa  649    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0965348 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4621  lipoate-protein ligase A  99.7 
 
 
338 aa  702    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4985  lipoate-protein ligase A  99.41 
 
 
338 aa  697    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3670  lipoate-protein ligase A  100 
 
 
338 aa  704    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.632003 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4935  lipoate-protein ligase A  98.82 
 
 
338 aa  697    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.672461 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4933  lipoate-protein ligase A  99.41 
 
 
338 aa  700    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.553112  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4933  lipoate-protein ligase A  92.01 
 
 
338 aa  652    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4985  lipoate-protein ligase A  92.6 
 
 
338 aa  657    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4826  lipoate-protein ligase A  91.42 
 
 
338 aa  658    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04227  hypothetical protein  100 
 
 
338 aa  704    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4899  lipoate-protein ligase A  93.49 
 
 
338 aa  664    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4987  lipoate-protein ligase A  89.64 
 
 
338 aa  642    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5901  unknown domain/lipoate-protein ligase A fusion protein  99.11 
 
 
562 aa  702    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2465  lipoate-protein ligase A  76.63 
 
 
338 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.249663  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1733  lipoate-protein ligase A  74.56 
 
 
338 aa  534  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2604  lipoate-protein ligase A  74.56 
 
 
338 aa  534  1e-151  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1839  lipoate-protein ligase A  74.56 
 
 
338 aa  534  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2162  lipoate-protein ligase A  72.78 
 
 
337 aa  531  1e-150  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.922433 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1629  lipoate-protein ligase A  73.62 
 
 
338 aa  500  1e-140  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4028  lipoate-protein ligase A  63.66 
 
 
337 aa  451  1.0000000000000001e-126  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1000  lipoate-protein ligase A  62.02 
 
 
338 aa  447  1.0000000000000001e-124  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0070  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  50.5 
 
 
343 aa  325  1e-87  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0197  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  43.95 
 
 
339 aa  309  4e-83  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05080  lipoate-protein ligase  41.2 
 
 
332 aa  263  2e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.341449  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2894  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  42.96 
 
 
334 aa  258  7e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1542  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  40.98 
 
 
332 aa  235  9e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1974  lipoate-protein ligase  35.74 
 
 
332 aa  192  6e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1086  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  34.11 
 
 
328 aa  189  5e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000389692  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1108  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  34.11 
 
 
328 aa  189  5e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000525877  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0616  lipoate-protein ligase A family protein  33.44 
 
 
328 aa  189  7e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01600  conserved hypothetical protein  34.37 
 
 
396 aa  187  3e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1752  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  32.63 
 
 
329 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1551  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase family protein  33.44 
 
 
331 aa  179  8e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.23083  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1189  lipoate-protein ligase A, putative  34.2 
 
 
329 aa  177  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1017  lipoate-protein ligase A  34.2 
 
 
329 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1001  lipoate-protein ligase A  34.2 
 
 
329 aa  177  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1004  lipoate-protein ligase A  34.2 
 
 
329 aa  177  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1089  lipoate-protein ligase A  34.2 
 
 
329 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1006  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  34.2 
 
 
329 aa  177  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1248  putative lipoate-protein ligase A  34.2 
 
 
329 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1121  putative lipoate-protein ligase A  34.2 
 
 
329 aa  177  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4185  putative lipoate-protein ligase A  34.2 
 
 
329 aa  177  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1167  putative lipoate-protein ligase A  34.2 
 
 
329 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0839  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  34.58 
 
 
329 aa  176  5e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0224  lipoate-protein ligase  31.68 
 
 
334 aa  172  5e-42  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1677  lipoate-protein ligase  32.93 
 
 
337 aa  172  6.999999999999999e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0374805  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0881  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  36.83 
 
 
345 aa  172  1e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0333925  normal  0.884852 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0233  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  34.11 
 
 
326 aa  172  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0847  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  35.15 
 
 
325 aa  171  1e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.918447  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1213  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  30.92 
 
 
329 aa  171  2e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0785  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  36.4 
 
 
327 aa  170  3e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3768  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  30.7 
 
 
329 aa  170  4e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1014  lipoate-protein ligase  30.97 
 
 
329 aa  169  5e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00464071  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2184  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  31.48 
 
 
329 aa  168  1e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000642263 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0882  lipoate-protein ligase A  30.59 
 
 
329 aa  167  2e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2647  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase family protein  33.65 
 
 
331 aa  166  5.9999999999999996e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.179015  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0327  lipoate-protein ligase  35.27 
 
 
334 aa  166  6.9999999999999995e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1555  lipoate-protein ligase  31.73 
 
 
325 aa  165  1.0000000000000001e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl038  lipoate-protein ligase  30.82 
 
 
334 aa  162  1e-38  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0052  lipoate-protein ligase  32.69 
 
 
333 aa  160  2e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0736  lipoate-protein ligase  31.79 
 
 
336 aa  157  3e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1171  hypothetical protein  28.85 
 
 
326 aa  156  4e-37  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.268506 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58727  predicted protein  31.96 
 
 
475 aa  144  2e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0291322 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05732  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06950)  30.58 
 
 
437 aa  141  9.999999999999999e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.772126  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13820  lipoate-protein ligase A  35.69 
 
 
289 aa  140  1.9999999999999998e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1056  lipoate-protein ligase A  30.48 
 
 
339 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0376  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  27.27 
 
 
340 aa  115  8.999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0386  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  27.27 
 
 
340 aa  115  8.999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.858676  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0449  lipoate-protein ligase  28.57 
 
 
345 aa  104  3e-21  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0102299  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0897  Lipoate--protein ligase  32.23 
 
 
247 aa  103  4e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1106  Lipoate--protein ligase  31.56 
 
 
245 aa  92.4  1e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000000820504  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0931  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.23 
 
 
343 aa  83.2  0.000000000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000248179  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3413  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.92 
 
 
261 aa  80.5  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0322711  normal  0.107721 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0965  Lipoate--protein ligase  28.63 
 
 
257 aa  77  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.119458  normal  0.259111 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1053  biotin/lipoate A/B protein ligase  25.25 
 
 
357 aa  76.3  0.0000000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0642  Lipoate--protein ligase  28.68 
 
 
363 aa  75.9  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.336498  normal  0.0925855 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2128  biotin/lipoate A/B protein ligase  30.05 
 
 
372 aa  73.9  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0607832  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2173  biotin/lipoate A/B protein ligase  30.14 
 
 
356 aa  72.8  0.000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.679039  decreased coverage  0.000000000726509 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2545  lipoate-protein ligase A, putative  30.14 
 
 
356 aa  72.8  0.000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.752721  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1514  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.09 
 
 
261 aa  72.8  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0104687 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1879  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.91 
 
 
365 aa  72.8  0.000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00459014 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0443  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.62 
 
 
530 aa  71.2  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2206  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.93 
 
 
360 aa  70.1  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.46351  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4031  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.25 
 
 
349 aa  70.1  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2611  biotin/lipoate A/B protein ligase  31.11 
 
 
253 aa  69.7  0.00000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.60182  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1701  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.77 
 
 
349 aa  69.3  0.00000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.407225  normal  0.0224551 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11650  lipoate-protein ligase A  28.64 
 
 
352 aa  69.3  0.00000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2379  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.67 
 
 
358 aa  68.6  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1172  Lipoate--protein ligase  26.88 
 
 
358 aa  68.6  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.260617 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0450  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.18 
 
 
259 aa  66.6  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0980  lipoate-protein ligase A  25.84 
 
 
253 aa  66.6  0.0000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1428  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.88 
 
 
354 aa  65.9  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2218  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.35 
 
 
349 aa  65.9  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10810  lipoate-protein ligase A  26.87 
 
 
349 aa  64.3  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0653511  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4284  lipoate-protein ligase A, putative  24.81 
 
 
278 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3962  lipoate-protein ligase A  24.81 
 
 
278 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2899  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.2 
 
 
278 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.237083  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4339  putative lipoate-protein ligase A  24.81 
 
 
278 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>