132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1056 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG1056  lipoate-protein ligase A  100 
 
 
339 aa  703    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0376  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  62.65 
 
 
340 aa  447  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0386  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  62.65 
 
 
340 aa  447  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.858676  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0449  lipoate-protein ligase  48.83 
 
 
345 aa  344  1e-93  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0102299  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1752  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  41.34 
 
 
329 aa  261  2e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0839  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  40.79 
 
 
329 aa  256  3e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4185  putative lipoate-protein ligase A  40.48 
 
 
329 aa  256  5e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1017  lipoate-protein ligase A  40.48 
 
 
329 aa  256  6e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1001  lipoate-protein ligase A  40.48 
 
 
329 aa  256  6e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1004  lipoate-protein ligase A  40.48 
 
 
329 aa  255  6e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1089  lipoate-protein ligase A  40.48 
 
 
329 aa  256  6e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1167  putative lipoate-protein ligase A  40.48 
 
 
329 aa  256  6e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1248  putative lipoate-protein ligase A  40.48 
 
 
329 aa  255  6e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1189  lipoate-protein ligase A, putative  40.48 
 
 
329 aa  255  7e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1121  putative lipoate-protein ligase A  40.48 
 
 
329 aa  255  8e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1006  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  40.73 
 
 
329 aa  252  6e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1086  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  36.96 
 
 
328 aa  236  4e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000389692  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1108  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  36.96 
 
 
328 aa  236  4e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000525877  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0616  lipoate-protein ligase A family protein  36.96 
 
 
328 aa  233  4.0000000000000004e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1677  lipoate-protein ligase  37 
 
 
337 aa  228  2e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0374805  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1213  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  38.01 
 
 
329 aa  223  4e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0233  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  37.42 
 
 
326 aa  223  4e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1014  lipoate-protein ligase  38.34 
 
 
329 aa  218  1e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00464071  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1551  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase family protein  35.28 
 
 
331 aa  215  9.999999999999999e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.23083  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2647  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase family protein  36.14 
 
 
331 aa  209  5e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.179015  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2184  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  35.65 
 
 
329 aa  207  2e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000642263 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0882  lipoate-protein ligase A  36.2 
 
 
329 aa  205  1e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1555  lipoate-protein ligase  37 
 
 
325 aa  201  9.999999999999999e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3768  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  37.38 
 
 
329 aa  199  6e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1974  lipoate-protein ligase  37.92 
 
 
332 aa  196  5.000000000000001e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1171  hypothetical protein  34.36 
 
 
326 aa  196  6e-49  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.268506 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0847  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  36.18 
 
 
325 aa  186  5e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.918447  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0881  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  34.56 
 
 
345 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0333925  normal  0.884852 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0736  lipoate-protein ligase  35.56 
 
 
336 aa  179  4e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0052  lipoate-protein ligase  32.74 
 
 
333 aa  175  9.999999999999999e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0785  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  32.83 
 
 
327 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0327  lipoate-protein ligase  30.34 
 
 
334 aa  157  2e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0224  lipoate-protein ligase  29.57 
 
 
334 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05080  lipoate-protein ligase  32.68 
 
 
332 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.341449  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0070  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  27.96 
 
 
343 aa  137  4e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4935  lipoate-protein ligase A  30.48 
 
 
338 aa  132  9e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.672461 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04262  lipoate-protein ligase A  30.48 
 
 
338 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4621  lipoate-protein ligase A  30.48 
 
 
338 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04227  hypothetical protein  30.48 
 
 
338 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3670  lipoate-protein ligase A  30.48 
 
 
338 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.632003 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4933  lipoate-protein ligase A  30.48 
 
 
338 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.553112  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3612  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  30.16 
 
 
338 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0545  lipoate-protein ligase A  30 
 
 
338 aa  131  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0965348 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4987  lipoate-protein ligase A  30.19 
 
 
338 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5901  unknown domain/lipoate-protein ligase A fusion protein  30.16 
 
 
562 aa  130  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4899  lipoate-protein ligase A  29.84 
 
 
338 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4985  lipoate-protein ligase A  30.48 
 
 
338 aa  129  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4933  lipoate-protein ligase A  30.48 
 
 
338 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4985  lipoate-protein ligase A  30.16 
 
 
338 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2162  lipoate-protein ligase A  30.14 
 
 
337 aa  127  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.922433 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl038  lipoate-protein ligase  27.79 
 
 
334 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0197  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  30.25 
 
 
339 aa  127  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4826  lipoate-protein ligase A  30.16 
 
 
338 aa  126  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1629  lipoate-protein ligase A  27.33 
 
 
338 aa  124  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2465  lipoate-protein ligase A  28.66 
 
 
338 aa  123  5e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.249663  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2894  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  28.21 
 
 
334 aa  122  9e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1733  lipoate-protein ligase A  27.13 
 
 
338 aa  118  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2604  lipoate-protein ligase A  27.13 
 
 
338 aa  118  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1839  lipoate-protein ligase A  27.13 
 
 
338 aa  118  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1000  lipoate-protein ligase A  28.81 
 
 
338 aa  118  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4028  lipoate-protein ligase A  27.96 
 
 
337 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01600  conserved hypothetical protein  28.05 
 
 
396 aa  110  5e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1542  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  27.19 
 
 
332 aa  108  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05732  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06950)  28.92 
 
 
437 aa  96.3  8e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.772126  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13820  lipoate-protein ligase A  32.89 
 
 
289 aa  84.3  0.000000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0642  Lipoate--protein ligase  27.86 
 
 
363 aa  82.8  0.000000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.336498  normal  0.0925855 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58727  predicted protein  26.33 
 
 
475 aa  82.4  0.00000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0291322 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1701  biotin/lipoate A/B protein ligase  30.33 
 
 
349 aa  78.6  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.407225  normal  0.0224551 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0931  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.71 
 
 
343 aa  77.4  0.0000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000248179  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10810  lipoate-protein ligase A  28.57 
 
 
349 aa  76.6  0.0000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0653511  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2206  biotin/lipoate A/B protein ligase  25.89 
 
 
360 aa  75.9  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.46351  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2218  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.22 
 
 
349 aa  74.3  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1106  Lipoate--protein ligase  37.34 
 
 
245 aa  72.8  0.000000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000000820504  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0443  biotin/lipoate A/B protein ligase  24.84 
 
 
530 aa  71.6  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0965  Lipoate--protein ligase  31.01 
 
 
257 aa  71.6  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.119458  normal  0.259111 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1053  biotin/lipoate A/B protein ligase  22.61 
 
 
357 aa  71.6  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1879  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.56 
 
 
365 aa  67.8  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00459014 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0980  lipoate-protein ligase A  30.29 
 
 
253 aa  67.8  0.0000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0450  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.29 
 
 
259 aa  67  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1480  lipoate-protein ligase  24.92 
 
 
364 aa  66.6  0.0000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.521497  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2173  biotin/lipoate A/B protein ligase  30.97 
 
 
356 aa  66.6  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.679039  decreased coverage  0.000000000726509 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2545  lipoate-protein ligase A, putative  30.97 
 
 
356 aa  66.6  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.752721  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1514  biotin/lipoate A/B protein ligase  25.81 
 
 
261 aa  66.2  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0104687 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0897  Lipoate--protein ligase  25.73 
 
 
247 aa  65.9  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2128  biotin/lipoate A/B protein ligase  30.19 
 
 
372 aa  65.5  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0607832  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3413  biotin/lipoate A/B protein ligase  24.54 
 
 
261 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0322711  normal  0.107721 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2034  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.85 
 
 
366 aa  64.7  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4031  biotin/lipoate A/B protein ligase  30.38 
 
 
349 aa  64.7  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11650  lipoate-protein ligase A  26.54 
 
 
352 aa  63.5  0.000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1172  Lipoate--protein ligase  28.48 
 
 
358 aa  63.5  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.260617 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2379  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.02 
 
 
358 aa  63.2  0.000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1560  biotin/lipoate A/B protein ligase  25.18 
 
 
344 aa  62.8  0.000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0396798 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1002  biotin/lipoate A/B protein ligase  24.05 
 
 
362 aa  62  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2086  biotin/lipoate A/B protein ligase  24.81 
 
 
344 aa  61.2  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0682  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.95 
 
 
275 aa  57  0.0000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0153413  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>