125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C4985 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_04262  lipoate-protein ligase A  92.6 
 
 		 338 aa  657    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3612  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  93.49 
 
 		 338 aa  661    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0545  lipoate-protein ligase A  89.94 
 
 		 338 aa  642    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0965348 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04227  hypothetical protein  92.6 
 
 		 338 aa  657    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4621  lipoate-protein ligase A  92.9 
 
 		 338 aa  659    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4985  lipoate-protein ligase A  92.6 
 
 		 338 aa  655    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3670  lipoate-protein ligase A  92.6 
 
 		 338 aa  657    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.632003 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4935  lipoate-protein ligase A  93.79 
 
 		 338 aa  663    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.672461 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4933  lipoate-protein ligase A  92.6 
 
 		 338 aa  657    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.553112  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4933  lipoate-protein ligase A  98.82 
 
 		 338 aa  694    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4985  lipoate-protein ligase A  100 
 
 		 338 aa  702    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4826  lipoate-protein ligase A  96.15 
 
 		 338 aa  680    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4899  lipoate-protein ligase A  98.22 
 
 		 338 aa  691    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4987  lipoate-protein ligase A  94.67 
 
 		 338 aa  674    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5901  unknown domain/lipoate-protein ligase A fusion protein  92.9 
 
 		 562 aa  661    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2465  lipoate-protein ligase A  77.51 
 
 		 338 aa  567  1e-160  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.249663  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1733  lipoate-protein ligase A  74.26 
 
 		 338 aa  534  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2162  lipoate-protein ligase A  72.78 
 
 		 337 aa  533  1e-150  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.922433 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2604  lipoate-protein ligase A  74.26 
 
 		 338 aa  534  1e-150  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1839  lipoate-protein ligase A  74.26 
 
 		 338 aa  534  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1629  lipoate-protein ligase A  74.85 
 
 		 338 aa  507  9.999999999999999e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1000  lipoate-protein ligase A  61.72 
 
 		 338 aa  447  1e-125  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4028  lipoate-protein ligase A  63.36 
 
 		 337 aa  449  1e-125  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0070  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  48.19 
 
 		 343 aa  327  2.0000000000000001e-88  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0197  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  45.07 
 
 		 339 aa  309  4e-83  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05080  lipoate-protein ligase  40.86 
 
 		 332 aa  261  1e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.341449  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2894  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  41.58 
 
 		 334 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1542  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  40.98 
 
 		 332 aa  238  1e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1974  lipoate-protein ligase  36.84 
 
 		 332 aa  194  2e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1752  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  32.81 
 
 		 329 aa  189  4e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01600  conserved hypothetical protein  34.37 
 
 		 396 aa  187  2e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0616  lipoate-protein ligase A family protein  32.46 
 
 		 328 aa  186  6e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1086  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  33.55 
 
 		 328 aa  185  8e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000389692  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1108  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  33.55 
 
 		 328 aa  185  8e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000525877  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1006  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  34.2 
 
 		 329 aa  179  4e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1121  putative lipoate-protein ligase A  34.2 
 
 		 329 aa  179  4e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1189  lipoate-protein ligase A, putative  34.2 
 
 		 329 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1017  lipoate-protein ligase A  34.2 
 
 		 329 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1001  lipoate-protein ligase A  34.2 
 
 		 329 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1004  lipoate-protein ligase A  34.2 
 
 		 329 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1089  lipoate-protein ligase A  34.2 
 
 		 329 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1248  putative lipoate-protein ligase A  34.2 
 
 		 329 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4185  putative lipoate-protein ligase A  34.2 
 
 		 329 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1167  putative lipoate-protein ligase A  34.2 
 
 		 329 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0839  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  34.58 
 
 		 329 aa  178  1e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3768  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  30.7 
 
 		 329 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1014  lipoate-protein ligase  32.13 
 
 		 329 aa  173  2.9999999999999996e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00464071  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0881  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  37.42 
 
 		 345 aa  172  7.999999999999999e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0333925  normal  0.884852 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1677  lipoate-protein ligase  32.43 
 
 		 337 aa  172  7.999999999999999e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0374805  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0224  lipoate-protein ligase  32.79 
 
 		 334 aa  171  1e-41  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0785  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  35.87 
 
 		 327 aa  171  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0233  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  32.9 
 
 		 326 aa  170  4e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1213  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  30.38 
 
 		 329 aa  168  1e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1551  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase family protein  31.63 
 
 		 331 aa  167  2.9999999999999998e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.23083  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2184  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  31.68 
 
 		 329 aa  166  6.9999999999999995e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000642263 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0847  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  34.58 
 
 		 325 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.918447  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0882  lipoate-protein ligase A  30.26 
 
 		 329 aa  163  3e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl038  lipoate-protein ligase  31.48 
 
 		 334 aa  162  1e-38  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0327  lipoate-protein ligase  35.07 
 
 		 334 aa  161  1e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1555  lipoate-protein ligase  31.01 
 
 		 325 aa  160  2e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0052  lipoate-protein ligase  31.72 
 
 		 333 aa  159  5e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2647  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase family protein  33.55 
 
 		 331 aa  157  3e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.179015  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0736  lipoate-protein ligase  32.03 
 
 		 336 aa  157  3e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1171  hypothetical protein  29.17 
 
 		 326 aa  156  4e-37  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.268506 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58727  predicted protein  32.65 
 
 		 475 aa  145  1e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0291322 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05732  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06950)  31.56 
 
 		 437 aa  144  2e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.772126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13820  lipoate-protein ligase A  35.02 
 
 		 289 aa  134  1.9999999999999998e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1056  lipoate-protein ligase A  30.48 
 
 		 339 aa  129  7.000000000000001e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0376  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  29.37 
 
 		 340 aa  112  8.000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0386  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  29.37 
 
 		 340 aa  112  8.000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.858676  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0897  Lipoate--protein ligase  31.28 
 
 		 247 aa  99.4  7e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0449  lipoate-protein ligase  26.79 
 
 		 345 aa  99.4  8e-20  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0102299  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1106  Lipoate--protein ligase  27.8 
 
 		 245 aa  89.7  6e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000000820504  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0931  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.27 
 
 		 343 aa  80.5  0.00000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000248179  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3413  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.92 
 
 		 261 aa  79.3  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0322711  normal  0.107721 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0642  Lipoate--protein ligase  27.91 
 
 		 363 aa  74.7  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.336498  normal  0.0925855 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1053  biotin/lipoate A/B protein ligase  24.92 
 
 		 357 aa  73.9  0.000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0965  Lipoate--protein ligase  28.35 
 
 		 257 aa  73.6  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.119458  normal  0.259111 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2128  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.64 
 
 		 372 aa  71.2  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0607832  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2206  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.41 
 
 		 360 aa  71.6  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.46351  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0443  biotin/lipoate A/B protein ligase  30 
 
 		 530 aa  70.9  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1879  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.44 
 
 		 365 aa  70.9  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00459014 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1172  Lipoate--protein ligase  29.13 
 
 		 358 aa  70.5  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.260617 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2173  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.67 
 
 		 356 aa  70.5  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.679039  decreased coverage  0.000000000726509 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2545  lipoate-protein ligase A, putative  29.67 
 
 		 356 aa  70.5  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.752721  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2379  biotin/lipoate A/B protein ligase  32.06 
 
 		 358 aa  69.3  0.00000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1514  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.18 
 
 		 261 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0104687 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4031  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.25 
 
 		 349 aa  67.8  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2611  biotin/lipoate A/B protein ligase  30.56 
 
 		 253 aa  67  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.60182  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11650  lipoate-protein ligase A  28.64 
 
 		 352 aa  66.6  0.0000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0450  biotin/lipoate A/B protein ligase  25.86 
 
 		 259 aa  65.5  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1428  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.2 
 
 		 354 aa  65.1  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1701  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.83 
 
 		 349 aa  65.1  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.407225  normal  0.0224551 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10810  lipoate-protein ligase A  27.87 
 
 		 349 aa  63.5  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0653511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0980  lipoate-protein ligase A  25.36 
 
 		 253 aa  62.8  0.000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2218  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.35 
 
 		 349 aa  62.8  0.000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2899  biotin/lipoate A/B protein ligase  24.72 
 
 		 278 aa  62  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.237083  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4284  lipoate-protein ligase A, putative  23.99 
 
 		 278 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3962  lipoate-protein ligase A  23.99 
 
 		 278 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4339  putative lipoate-protein ligase A  23.99 
 
 		 278 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>