118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1480 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1480  lipoate-protein ligase  100 
 
 		 364 aa  750    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.521497  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2034  biotin/lipoate A/B protein ligase  74.79 
 
 		 366 aa  579  1e-164  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1560  biotin/lipoate A/B protein ligase  32.5 
 
 		 344 aa  137  2e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0396798 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2086  biotin/lipoate A/B protein ligase  32.42 
 
 		 344 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0931  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.91 
 
 		 343 aa  124  2e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000248179  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1002  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.15 
 
 		 362 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0443  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.11 
 
 		 530 aa  112  8.000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0642  Lipoate--protein ligase  26.2 
 
 		 363 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.336498  normal  0.0925855 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2173  biotin/lipoate A/B protein ligase  27 
 
 		 356 aa  104  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.679039  decreased coverage  0.000000000726509 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2545  lipoate-protein ligase A, putative  27 
 
 		 356 aa  104  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.752721  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2206  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.63 
 
 		 360 aa  102  9e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.46351  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2168  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.11 
 
 		 347 aa  102  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0233  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  28.03 
 
 		 326 aa  97.8  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1171  hypothetical protein  25.62 
 
 		 326 aa  95.1  2e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.268506 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2184  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  24.68 
 
 		 329 aa  88.6  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000642263 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0648  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.88 
 
 		 348 aa  87.8  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.435247  normal  0.0871201 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1017  lipoate-protein ligase A  27.3 
 
 		 329 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1001  lipoate-protein ligase A  27.3 
 
 		 329 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1004  lipoate-protein ligase A  27.3 
 
 		 329 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1089  lipoate-protein ligase A  27.3 
 
 		 329 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1248  putative lipoate-protein ligase A  27.3 
 
 		 329 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4185  putative lipoate-protein ligase A  27.3 
 
 		 329 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1167  putative lipoate-protein ligase A  27.3 
 
 		 329 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2168  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.27 
 
 		 335 aa  84  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00545206  hitchhiker  0.000000520925 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2540  biotin/lipoate A/B protein ligase family protein  29.27 
 
 		 303 aa  84  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1677  lipoate-protein ligase  26.63 
 
 		 337 aa  83.6  0.000000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0374805  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1189  lipoate-protein ligase A, putative  26.96 
 
 		 329 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0616  lipoate-protein ligase A family protein  27.08 
 
 		 328 aa  81.3  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0376  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  28.52 
 
 		 340 aa  81.3  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0386  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  28.52 
 
 		 340 aa  81.3  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.858676  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0839  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  26.62 
 
 		 329 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1121  putative lipoate-protein ligase A  26.62 
 
 		 329 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1086  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  25.47 
 
 		 328 aa  79.7  0.00000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000389692  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1108  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  25.47 
 
 		 328 aa  79.7  0.00000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000525877  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1752  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  26.42 
 
 		 329 aa  79.7  0.00000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1213  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  24.1 
 
 		 329 aa  79.7  0.00000000000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0785  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  25.9 
 
 		 327 aa  79.3  0.00000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1006  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  26.28 
 
 		 329 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1974  lipoate-protein ligase  26.98 
 
 		 332 aa  78.2  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0847  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  23.59 
 
 		 325 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.918447  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0882  lipoate-protein ligase A  26.15 
 
 		 329 aa  77.4  0.0000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3768  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  25.99 
 
 		 329 aa  77.8  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0449  lipoate-protein ligase  23.91 
 
 		 345 aa  77.4  0.0000000000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0102299  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1106  Lipoate--protein ligase  30.41 
 
 		 245 aa  74.7  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000000820504  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0682  biotin/lipoate A/B protein ligase  33.55 
 
 		 275 aa  72  0.00000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0153413  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0881  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  29.07 
 
 		 345 aa  70.9  0.00000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0333925  normal  0.884852 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0327  lipoate-protein ligase  30.43 
 
 		 334 aa  69.7  0.00000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0187  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.57 
 
 		 276 aa  69.3  0.00000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl038  lipoate-protein ligase  23.74 
 
 		 334 aa  69.3  0.0000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0224  lipoate-protein ligase  27.11 
 
 		 334 aa  68.9  0.0000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1014  lipoate-protein ligase  23.84 
 
 		 329 aa  68.9  0.0000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00464071  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1555  lipoate-protein ligase  24.68 
 
 		 325 aa  67.4  0.0000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0052  lipoate-protein ligase  28.73 
 
 		 333 aa  66.6  0.0000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1053  biotin/lipoate A/B protein ligase  22.95 
 
 		 357 aa  66.6  0.0000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1056  lipoate-protein ligase A  24.92 
 
 		 339 aa  66.6  0.0000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2647  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase family protein  27.14 
 
 		 331 aa  66.2  0.0000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.179015  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1551  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase family protein  26.85 
 
 		 331 aa  64.3  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.23083  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1514  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.48 
 
 		 261 aa  64.3  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0104687 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1097  lipoate-protein ligase A family protein  22.66 
 
 		 276 aa  62.8  0.000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3413  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.46 
 
 		 261 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0322711  normal  0.107721 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0965  Lipoate--protein ligase  26.86 
 
 		 257 aa  62.8  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.119458  normal  0.259111 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2355  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.16 
 
 		 278 aa  62.4  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2218  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.1 
 
 		 349 aa  59.7  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0219  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.75 
 
 		 278 aa  58.9  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0736  lipoate-protein ligase  23.71 
 
 		 336 aa  58.5  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0396  biotin/lipoate A/B protein ligase  24.43 
 
 		 275 aa  58.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2899  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.47 
 
 		 278 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.237083  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1549  CO dehydrogenase beta subunit/acetyl-CoA synthase epsilon subunit  23.08 
 
 		 667 aa  58.2  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1542  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  27.69 
 
 		 332 aa  57.8  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1506  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.87 
 
 		 240 aa  56.2  0.0000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0379  biotin/lipoate A/B protein ligase family protein  23.16 
 
 		 269 aa  55.8  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1591  biotin/lipoate A/B protein ligase  21.51 
 
 		 276 aa  55.5  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00744993  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1624  biotin/lipoate A/B protein ligase  21.51 
 
 		 276 aa  55.5  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.997358  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4063  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.47 
 
 		 278 aa  55.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.934353  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4284  lipoate-protein ligase A, putative  26.05 
 
 		 278 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3952  lipoate-protein ligase A  26.05 
 
 		 278 aa  54.3  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3962  lipoate-protein ligase A  26.05 
 
 		 278 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2867  biotin/lipoate A/B protein ligase  20.37 
 
 		 261 aa  54.3  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4339  putative lipoate-protein ligase A  26.05 
 
 		 278 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4228  putative lipoate-protein ligase A  26.05 
 
 		 278 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4319  putative lipoate-protein ligase A  26.05 
 
 		 278 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0914  putative lipoate-protein ligase A  26.05 
 
 		 278 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.017149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1939  biotin/lipoate A/B protein ligase  22.59 
 
 		 273 aa  53.9  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515448  unclonable  0.000000010218 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05080  lipoate-protein ligase  23.18 
 
 		 332 aa  53.1  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.341449  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4111  lipoate-protein ligase A  25.63 
 
 		 278 aa  53.1  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4431  lipoate-protein ligase A  25.63 
 
 		 278 aa  53.1  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2805  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.37 
 
 		 278 aa  53.1  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0399  biotin/lipoate A/B protein ligase  23.33 
 
 		 266 aa  53.1  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1107  hypothetical protein  38.98 
 
 		 96 aa  51.6  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000342264  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2128  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.97 
 
 		 372 aa  51.2  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0607832  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0967  biotin/lipoate A/B protein ligase  25.14 
 
 		 278 aa  50.8  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.170763  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0450  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.5 
 
 		 259 aa  50.1  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2611  biotin/lipoate A/B protein ligase  25.91 
 
 		 253 aa  50.1  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.60182  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3819  hypothetical protein  21.78 
 
 		 386 aa  49.7  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0720248  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3151  biotin/lipoate A/B protein ligase  23.57 
 
 		 280 aa  49.3  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.857047  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0897  Lipoate--protein ligase  23.11 
 
 		 247 aa  48.5  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1527  biotin/lipoate A/B protein ligase  23 
 
 		 274 aa  48.5  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1172  Lipoate--protein ligase  26.15 
 
 		 358 aa  47.8  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.260617 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4031  biotin/lipoate A/B protein ligase  25.68 
 
 		 349 aa  47.4  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2894  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  25.42 
 
 		 334 aa  47.4  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>