More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0268 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0268  50S ribosomal protein L2  100 
 
 		 288 aa  584  1e-166  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000297487  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0288  50S ribosomal protein L2  67.02 
 
 		 274 aa  377  1e-103  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.101113  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01200  50S ribosomal protein L2  58.25 
 
 		 277 aa  317  2e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0770167  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0984  50S ribosomal protein L2  58.25 
 
 		 280 aa  315  5e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.619761  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0114  50S ribosomal protein L2  58.1 
 
 		 276 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000290971  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1521  ribosomal protein L2  57.75 
 
 		 275 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23440  LSU ribosomal protein L2P  57.39 
 
 		 276 aa  311  6.999999999999999e-84  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000561637  decreased coverage  0.0000000103379 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09970  LSU ribosomal protein L2P  56.69 
 
 		 276 aa  310  2e-83  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.7223  hitchhiker  0.00000165173 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0110  50S ribosomal protein L2  57.75 
 
 		 276 aa  310  2e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2904  ribosomal protein L2  56.69 
 
 		 275 aa  307  1.0000000000000001e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2175  ribosomal protein L2  55.99 
 
 		 276 aa  306  2.0000000000000002e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0113  50S ribosomal protein L2  55.99 
 
 		 276 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000200839  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0113  50S ribosomal protein L2  55.99 
 
 		 276 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000138046  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0109  50S ribosomal protein L2  55.99 
 
 		 276 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.27306e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0125  50S ribosomal protein L2  55.99 
 
 		 276 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.14187e-61 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0107  50S ribosomal protein L2  55.99 
 
 		 276 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000901221  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0144  50S ribosomal protein L2  55.99 
 
 		 276 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000100516  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0113  50S ribosomal protein L2  55.99 
 
 		 276 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000512601  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5192  50S ribosomal protein L2  56.34 
 
 		 276 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000180933  unclonable  2.65522e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0134  50S ribosomal protein L2  56.34 
 
 		 276 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000249417  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0108  50S ribosomal protein L2  56.34 
 
 		 276 aa  302  4.0000000000000003e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000187869  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0107  50S ribosomal protein L2  56.34 
 
 		 276 aa  302  5.000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000204251  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0683  50S ribosomal protein L2  57.04 
 
 		 274 aa  301  1e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.660032  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1349  50S ribosomal protein L2  57.39 
 
 		 274 aa  299  4e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1158  ribosomal protein L2  54.55 
 
 		 278 aa  298  6e-80  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000162145  hitchhiker  0.000000663071 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0870  50S ribosomal protein L2  55.28 
 
 		 275 aa  298  9e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000015035  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1181  ribosomal protein L2  54.93 
 
 		 274 aa  297  1e-79  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000178958  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2708  ribosomal protein L2  56.49 
 
 		 276 aa  297  2e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000275562  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2906  50S ribosomal protein L2  55.63 
 
 		 275 aa  296  2e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0172805  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0936  50S ribosomal protein L2  56.34 
 
 		 274 aa  297  2e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000014248  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1391  50S ribosomal protein L2  57.39 
 
 		 276 aa  296  3e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000232502  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0218  50S ribosomal protein L2  56.34 
 
 		 275 aa  296  3e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127498  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1295  50S ribosomal protein L2  57.39 
 
 		 276 aa  296  3e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000122183  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1571  ribosomal protein L2  54.04 
 
 		 277 aa  296  3e-79  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000641133  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0787  50S ribosomal protein L2  54.26 
 
 		 274 aa  296  3e-79  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.469967  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3325  50S ribosomal protein L2  55.99 
 
 		 274 aa  295  5e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000129312 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0845  ribosomal protein L2  54.39 
 
 		 276 aa  295  7e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2854  50S ribosomal protein L2  55.63 
 
 		 274 aa  294  1e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.16125  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1070  50S ribosomal protein L2  54.93 
 
 		 274 aa  294  1e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000147453  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0425  50S ribosomal protein L2  54.42 
 
 		 276 aa  293  2e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000111287  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2711  50S ribosomal protein L2  53.5 
 
 		 277 aa  293  3e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2396  50S ribosomal protein L2  53.5 
 
 		 277 aa  293  3e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.445207  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0629  50S ribosomal protein L2  55.28 
 
 		 274 aa  292  5e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000833663  hitchhiker  0.00000000000856838 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2330  50S ribosomal protein L2  54.93 
 
 		 275 aa  292  5e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000156043  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1742  50S ribosomal protein L2  54.04 
 
 		 276 aa  292  5e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000110614  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0850  50S ribosomal protein L2  51.94 
 
 		 277 aa  290  1e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00104266  decreased coverage  0.0000130499 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4918  50S ribosomal protein L2  53.71 
 
 		 275 aa  291  1e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.113284  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1828  50S ribosomal protein L2  55.99 
 
 		 277 aa  290  2e-77  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.256739  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1943  50S ribosomal protein L2  52.96 
 
 		 282 aa  288  5.0000000000000004e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2021  50S ribosomal protein L2  52.96 
 
 		 282 aa  288  5.0000000000000004e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1936  50S ribosomal protein L2  52.96 
 
 		 282 aa  288  5.0000000000000004e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1343  ribosomal protein L2  54.64 
 
 		 279 aa  287  1e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0663  50S ribosomal protein L2  55.12 
 
 		 282 aa  287  1e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000112808  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2274  50S ribosomal protein L2  54.93 
 
 		 277 aa  287  2e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000299614  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2315  50S ribosomal protein L2  54.93 
 
 		 277 aa  287  2e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000290927  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0956  50S ribosomal protein L2  56.18 
 
 		 274 aa  287  2e-76  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00125176  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1762  50S ribosomal protein L2  54.42 
 
 		 276 aa  286  4e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00807764  normal  0.409688 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2457  50S ribosomal protein L2  51.23 
 
 		 276 aa  285  5e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0871736 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0061  50S ribosomal protein L2  53.68 
 
 		 277 aa  284  1.0000000000000001e-75  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.41006  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1135  50S ribosomal protein L2  55.28 
 
 		 275 aa  284  1.0000000000000001e-75  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000903374  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1904  50S ribosomal protein L2  54.04 
 
 		 277 aa  283  2.0000000000000002e-75  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0289  50S ribosomal protein L2  52.82 
 
 		 275 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0283371  normal  0.0481443 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0704  50S ribosomal protein L2  53 
 
 		 273 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000350454  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0761  50S ribosomal protein L2  54.39 
 
 		 277 aa  282  5.000000000000001e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000295488  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4023  50S ribosomal protein L2  54.39 
 
 		 275 aa  282  5.000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.796821  hitchhiker  0.00000688583 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2062  50S ribosomal protein L2  54.23 
 
 		 275 aa  281  7.000000000000001e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000331539  normal  0.228916 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0246  50S ribosomal protein L2  53.33 
 
 		 276 aa  281  8.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0249  50S ribosomal protein L2  53.33 
 
 		 276 aa  281  8.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3706  50S ribosomal protein L2  53.68 
 
 		 277 aa  281  9e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0694  50S ribosomal protein L2  52.67 
 
 		 287 aa  281  1e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00211234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2771  50S ribosomal protein L2  54.06 
 
 		 276 aa  281  1e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00347741  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2293  50S ribosomal protein L2  52.43 
 
 		 279 aa  280  1e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0106582  normal  0.012024 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0197  50S ribosomal protein L2  51.23 
 
 		 283 aa  280  2e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00345154  normal  0.0626583 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0718  ribosomal protein L2  51.94 
 
 		 273 aa  280  2e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1864  50S ribosomal protein L2  55.71 
 
 		 277 aa  280  2e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0213539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0228  50S ribosomal protein L2  52.11 
 
 		 275 aa  279  3e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1182  50S ribosomal protein L2  53.68 
 
 		 275 aa  280  3e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2166  ribosomal protein L2  51.06 
 
 		 273 aa  278  6e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.000491264  normal  0.227842 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1480  50S ribosomal protein L2  54.36 
 
 		 281 aa  278  9e-74  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000349234  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2229  50S ribosomal protein L2  52.86 
 
 		 287 aa  278  1e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.425308 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1914  50S ribosomal protein L2  51.22 
 
 		 282 aa  277  1e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.253672 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2616  50S ribosomal protein L2  54.93 
 
 		 275 aa  277  1e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0160883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1029  50S ribosomal protein L2  53 
 
 		 277 aa  276  2e-73  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000494173  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2254  50S ribosomal protein L2  53 
 
 		 276 aa  276  3e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000201463  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3992  ribosomal protein L2  53.17 
 
 		 275 aa  276  3e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2152  50S ribosomal protein L2  51.05 
 
 		 279 aa  276  4e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0924201  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0352  50S ribosomal protein L2  52.3 
 
 		 277 aa  275  7e-73  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000147687  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0294  50S ribosomal protein L2  52.11 
 
 		 278 aa  275  9e-73  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  3.4720999999999997e-28 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0037  50S ribosomal protein L2  52.65 
 
 		 276 aa  275  9e-73  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00257974  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29710  LSU ribosomal protein L2P  52.6 
 
 		 279 aa  274  1.0000000000000001e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.560922 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1282  ribosomal protein L2  53.17 
 
 		 275 aa  274  1.0000000000000001e-72  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0082  50S ribosomal protein L2  52.65 
 
 		 276 aa  274  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.173583 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0630  ribosomal protein L2  52.25 
 
 		 278 aa  273  4.0000000000000004e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0289  50S ribosomal protein L2  49.65 
 
 		 279 aa  271  7e-72  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0147738  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0590  50S ribosomal protein L2  52.25 
 
 		 278 aa  271  7e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.274558  normal  0.886345 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2061  50S ribosomal protein L2  53.12 
 
 		 279 aa  270  1e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000364134  normal  0.142265 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3021  50S ribosomal protein L2  54.07 
 
 		 274 aa  271  1e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0478203  hitchhiker  0.00883263 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1710  50S ribosomal protein L2  50.69 
 
 		 276 aa  270  2e-71  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2685  50S ribosomal protein L2  50 
 
 		 279 aa  270  2e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00277969  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2562  50S ribosomal protein L2  49.82 
 
 		 287 aa  270  2.9999999999999997e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.244819  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>