24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2109 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2109  hypothetical protein  100 
 
 		 245 aa  458  9.999999999999999e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2312  hypothetical protein  39.3 
 
 		 257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.78546 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22310  hypothetical protein  38.61 
 
 		 269 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0938212  normal  0.213332 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2236  hypothetical protein  42.37 
 
 		 259 aa  105  6e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.006058 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3021  hypothetical protein  38.65 
 
 		 264 aa  102  5e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.365476  normal  0.947396 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3247  hypothetical protein  39.18 
 
 		 264 aa  102  8e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2184  hypothetical protein  40.98 
 
 		 257 aa  99.4  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.850889  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2499  hypothetical protein  38.15 
 
 		 260 aa  98.6  9e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2575  hypothetical protein  37.97 
 
 		 245 aa  92.8  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.460251  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1904  hypothetical protein  39.92 
 
 		 270 aa  86.7  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0586421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2898  hypothetical protein  34.43 
 
 		 272 aa  79.7  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.325221  normal  0.0255206 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11515  hypothetical protein  32.28 
 
 		 302 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.199486 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2084  hypothetical protein  33.19 
 
 		 261 aa  66.2  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0628997  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5339  hypothetical protein  32.91 
 
 		 259 aa  61.2  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.795467  normal  0.179631 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2304  hypothetical protein  36.13 
 
 		 268 aa  60.5  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000415891  hitchhiker  0.00123485 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4816  hypothetical protein  36.15 
 
 		 268 aa  58.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3139  hypothetical protein  29.47 
 
 		 285 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.317049  normal  0.786002 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3655  hypothetical protein  28.77 
 
 		 289 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.220655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3189  hypothetical protein  29.12 
 
 		 285 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.125082 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3128  hypothetical protein  29.12 
 
 		 285 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0509  hypothetical protein  33.15 
 
 		 239 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1176  hypothetical protein  32.27 
 
 		 268 aa  48.5  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00920395 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21720  hypothetical protein  30.04 
 
 		 290 aa  46.2  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.477257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2757  hypothetical protein  26.34 
 
 		 289 aa  43.1  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.98914  normal  0.30463 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>