13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_21720 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_21720  hypothetical protein  100 
 
 		 290 aa  553  1e-157  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.477257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1426  hypothetical protein  48.7 
 
 		 260 aa  194  2e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1176  hypothetical protein  44.89 
 
 		 268 aa  178  1e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00920395 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1692  hypothetical protein  47.51 
 
 		 265 aa  174  9.999999999999999e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.333526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2898  hypothetical protein  39.5 
 
 		 272 aa  134  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.325221  normal  0.0255206 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2316  hypothetical protein  39.3 
 
 		 247 aa  104  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2312  hypothetical protein  33.46 
 
 		 257 aa  97.8  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.78546 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2575  hypothetical protein  31.05 
 
 		 245 aa  62.8  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.460251  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2236  hypothetical protein  29.93 
 
 		 259 aa  53.5  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.006058 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3021  hypothetical protein  43.18 
 
 		 264 aa  49.3  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.365476  normal  0.947396 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3247  hypothetical protein  43.18 
 
 		 264 aa  47.4  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2109  hypothetical protein  33.76 
 
 		 245 aa  46.2  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4816  hypothetical protein  28.35 
 
 		 268 aa  43.1  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>