21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_3189 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3128  hypothetical protein  100 
 
 
285 aa  556  1e-157  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3189  hypothetical protein  100 
 
 
285 aa  556  1e-157  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.125082 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3139  hypothetical protein  99.65 
 
 
285 aa  555  1e-157  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.317049  normal  0.786002 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3655  hypothetical protein  67.47 
 
 
289 aa  355  5e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.220655  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2757  hypothetical protein  69.07 
 
 
289 aa  354  6.999999999999999e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.98914  normal  0.30463 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11515  hypothetical protein  62.85 
 
 
302 aa  348  6e-95  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.199486 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22310  hypothetical protein  36.3 
 
 
269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0938212  normal  0.213332 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2084  hypothetical protein  36.5 
 
 
261 aa  97.1  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0628997  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2184  hypothetical protein  36.84 
 
 
257 aa  90.9  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.850889  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2304  hypothetical protein  30.35 
 
 
268 aa  64.7  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000415891  hitchhiker  0.00123485 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1904  hypothetical protein  31.87 
 
 
270 aa  62  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0586421  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2236  hypothetical protein  33.33 
 
 
259 aa  58.5  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.006058 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2109  hypothetical protein  30.07 
 
 
245 aa  54.7  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2312  hypothetical protein  32.16 
 
 
257 aa  53.5  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.78546 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2411  serine/threonine protein kinase  28.33 
 
 
283 aa  52.4  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2898  hypothetical protein  28.32 
 
 
272 aa  48.9  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.325221  normal  0.0255206 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0509  hypothetical protein  31.11 
 
 
239 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2499  hypothetical protein  26.33 
 
 
260 aa  47  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2575  hypothetical protein  29.67 
 
 
245 aa  45.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.460251  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4816  hypothetical protein  29.38 
 
 
268 aa  43.9  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5339  hypothetical protein  28.25 
 
 
259 aa  44.3  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.795467  normal  0.179631 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>