29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2236 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2236  hypothetical protein  100 
 
 
259 aa  486  1e-136  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.006058 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1904  hypothetical protein  81.4 
 
 
270 aa  317  2e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0586421  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2312  hypothetical protein  41.96 
 
 
257 aa  132  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.78546 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4816  hypothetical protein  42.51 
 
 
268 aa  122  5e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2109  hypothetical protein  42.21 
 
 
245 aa  113  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2898  hypothetical protein  35.96 
 
 
272 aa  96.7  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.325221  normal  0.0255206 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2575  hypothetical protein  40.3 
 
 
245 aa  96.7  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.460251  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0509  hypothetical protein  37.29 
 
 
239 aa  94.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5339  hypothetical protein  37.98 
 
 
259 aa  92  9e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.795467  normal  0.179631 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3021  hypothetical protein  38.28 
 
 
264 aa  84.7  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.365476  normal  0.947396 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22310  hypothetical protein  36.26 
 
 
269 aa  82.8  0.000000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0938212  normal  0.213332 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2499  hypothetical protein  35.18 
 
 
260 aa  80.9  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3247  hypothetical protein  36.4 
 
 
264 aa  78.6  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2316  hypothetical protein  39.3 
 
 
247 aa  69.3  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2184  hypothetical protein  37.57 
 
 
257 aa  69.3  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.850889  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2084  hypothetical protein  36.81 
 
 
261 aa  63.5  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0628997  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1176  hypothetical protein  36.6 
 
 
268 aa  60.5  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00920395 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15850  hypothetical protein  36.42 
 
 
261 aa  60.5  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.129128  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3139  hypothetical protein  31.94 
 
 
285 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.317049  normal  0.786002 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3128  hypothetical protein  31.6 
 
 
285 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3189  hypothetical protein  31.6 
 
 
285 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.125082 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1426  hypothetical protein  32.84 
 
 
260 aa  56.6  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2304  hypothetical protein  31.43 
 
 
268 aa  55.1  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000415891  hitchhiker  0.00123485 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11515  hypothetical protein  41.96 
 
 
302 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.199486 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1692  hypothetical protein  32.08 
 
 
265 aa  52  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.333526  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3655  hypothetical protein  36.59 
 
 
289 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.220655  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21720  hypothetical protein  29.01 
 
 
290 aa  49.3  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.477257  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2757  hypothetical protein  30.29 
 
 
289 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.98914  normal  0.30463 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2411  serine/threonine protein kinase  36.8 
 
 
283 aa  47  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>