15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1176 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_1176  hypothetical protein  100 
 
 
268 aa  513  1e-144  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00920395 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21720  hypothetical protein  44.89 
 
 
290 aa  172  6.999999999999999e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.477257  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1426  hypothetical protein  41.9 
 
 
260 aa  135  8e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1692  hypothetical protein  38.27 
 
 
265 aa  123  3e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.333526  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2898  hypothetical protein  36.53 
 
 
272 aa  104  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.325221  normal  0.0255206 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2316  hypothetical protein  40.93 
 
 
247 aa  102  5e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2312  hypothetical protein  31.74 
 
 
257 aa  68.9  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.78546 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2575  hypothetical protein  31.78 
 
 
245 aa  68.9  0.00000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.460251  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2236  hypothetical protein  35.79 
 
 
259 aa  67.4  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.006058 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4816  hypothetical protein  33.33 
 
 
268 aa  57.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2109  hypothetical protein  32.27 
 
 
245 aa  55.8  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1904  hypothetical protein  33.88 
 
 
270 aa  50.1  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0586421  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2184  hypothetical protein  34.62 
 
 
257 aa  45.4  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.850889  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5339  hypothetical protein  32.14 
 
 
259 aa  42.7  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.795467  normal  0.179631 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22310  hypothetical protein  36.7 
 
 
269 aa  42.4  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0938212  normal  0.213332 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>