25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2499 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2499  hypothetical protein  100 
 
 
260 aa  507  1e-143  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3021  hypothetical protein  49.02 
 
 
264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.365476  normal  0.947396 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3247  hypothetical protein  47.84 
 
 
264 aa  143  3e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2109  hypothetical protein  37.75 
 
 
245 aa  102  7e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2184  hypothetical protein  40.54 
 
 
257 aa  85.5  8e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.850889  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2575  hypothetical protein  34.63 
 
 
245 aa  80.5  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.460251  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2312  hypothetical protein  35.55 
 
 
257 aa  78.6  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.78546 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2236  hypothetical protein  37.14 
 
 
259 aa  77.8  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.006058 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22310  hypothetical protein  34.73 
 
 
269 aa  75.9  0.0000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0938212  normal  0.213332 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1904  hypothetical protein  37.34 
 
 
270 aa  67  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0586421  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5339  hypothetical protein  33.2 
 
 
259 aa  66.6  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.795467  normal  0.179631 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2898  hypothetical protein  37.63 
 
 
272 aa  66.2  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.325221  normal  0.0255206 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2084  hypothetical protein  32.24 
 
 
261 aa  59.3  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0628997  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3655  hypothetical protein  30.66 
 
 
289 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.220655  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0509  hypothetical protein  34.16 
 
 
239 aa  55.8  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11515  hypothetical protein  28.52 
 
 
302 aa  55.5  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.199486 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4816  hypothetical protein  37.97 
 
 
268 aa  55.8  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2757  hypothetical protein  29.67 
 
 
289 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.98914  normal  0.30463 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2304  hypothetical protein  32.64 
 
 
268 aa  53.5  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000415891  hitchhiker  0.00123485 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2316  hypothetical protein  35.53 
 
 
247 aa  50.8  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3139  hypothetical protein  26.69 
 
 
285 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.317049  normal  0.786002 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1692  hypothetical protein  33 
 
 
265 aa  49.3  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.333526  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3189  hypothetical protein  26.33 
 
 
285 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.125082 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3128  hypothetical protein  26.33 
 
 
285 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1426  hypothetical protein  33.64 
 
 
260 aa  47  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>