20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11515 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11515  hypothetical protein  100 
 
 
302 aa  596  1e-169  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.199486 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3139  hypothetical protein  63.19 
 
 
285 aa  332  5e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.317049  normal  0.786002 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3128  hypothetical protein  62.85 
 
 
285 aa  330  2e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3189  hypothetical protein  62.85 
 
 
285 aa  330  2e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.125082 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3655  hypothetical protein  61.07 
 
 
289 aa  304  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.220655  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2757  hypothetical protein  60.96 
 
 
289 aa  301  9e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.98914  normal  0.30463 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22310  hypothetical protein  36.71 
 
 
269 aa  117  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0938212  normal  0.213332 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2084  hypothetical protein  33.45 
 
 
261 aa  105  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0628997  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2184  hypothetical protein  36.06 
 
 
257 aa  86.7  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.850889  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2109  hypothetical protein  31.94 
 
 
245 aa  67.4  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1904  hypothetical protein  40.91 
 
 
270 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0586421  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2575  hypothetical protein  28.52 
 
 
245 aa  53.1  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.460251  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2236  hypothetical protein  41.96 
 
 
259 aa  52.4  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.006058 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2304  hypothetical protein  29.85 
 
 
268 aa  52  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000415891  hitchhiker  0.00123485 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2312  hypothetical protein  29.31 
 
 
257 aa  47.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.78546 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2898  hypothetical protein  31.63 
 
 
272 aa  47  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.325221  normal  0.0255206 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0509  hypothetical protein  29.89 
 
 
239 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2499  hypothetical protein  28.52 
 
 
260 aa  44.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2411  serine/threonine protein kinase  28.23 
 
 
283 aa  43.9  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4816  hypothetical protein  31.18 
 
 
268 aa  43.9  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>