23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5339 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_5339  hypothetical protein  100 
 
 		 259 aa  494  1e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.795467  normal  0.179631 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4816  hypothetical protein  53.39 
 
 		 268 aa  181  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0509  hypothetical protein  48.92 
 
 		 239 aa  161  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2312  hypothetical protein  41.5 
 
 		 257 aa  121  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.78546 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2575  hypothetical protein  39.92 
 
 		 245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.460251  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2898  hypothetical protein  36.88 
 
 		 272 aa  90.1  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.325221  normal  0.0255206 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2236  hypothetical protein  36.96 
 
 		 259 aa  85.9  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.006058 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1904  hypothetical protein  34.27 
 
 		 270 aa  69.7  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0586421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2109  hypothetical protein  33.2 
 
 		 245 aa  68.9  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2499  hypothetical protein  33.21 
 
 		 260 aa  67.4  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22310  hypothetical protein  32.56 
 
 		 269 aa  63.5  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0938212  normal  0.213332 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1692  hypothetical protein  35.26 
 
 		 265 aa  61.2  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.333526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2184  hypothetical protein  35.16 
 
 		 257 aa  55.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.850889  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3021  hypothetical protein  35.69 
 
 		 264 aa  51.6  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.365476  normal  0.947396 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11515  hypothetical protein  29.55 
 
 		 302 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.199486 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2084  hypothetical protein  29.33 
 
 		 261 aa  45.8  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0628997  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3139  hypothetical protein  28.52 
 
 		 285 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.317049  normal  0.786002 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3128  hypothetical protein  28.52 
 
 		 285 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3189  hypothetical protein  28.52 
 
 		 285 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.125082 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15850  hypothetical protein  30.8 
 
 		 261 aa  44.3  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.129128  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3655  hypothetical protein  29.95 
 
 		 289 aa  43.1  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.220655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3247  hypothetical protein  31.89 
 
 		 264 aa  42.7  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2757  hypothetical protein  30.43 
 
 		 289 aa  42.4  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.98914  normal  0.30463 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>