21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2084 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2084  hypothetical protein  100 
 
 		 261 aa  501  1e-141  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0628997  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11515  hypothetical protein  34.13 
 
 		 302 aa  115  6e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.199486 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3655  hypothetical protein  36.27 
 
 		 289 aa  110  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.220655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3128  hypothetical protein  36.27 
 
 		 285 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3189  hypothetical protein  36.27 
 
 		 285 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.125082 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3139  hypothetical protein  35.92 
 
 		 285 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.317049  normal  0.786002 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2757  hypothetical protein  35.29 
 
 		 289 aa  100  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.98914  normal  0.30463 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22310  hypothetical protein  36.88 
 
 		 269 aa  95.5  7e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0938212  normal  0.213332 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2184  hypothetical protein  38.5 
 
 		 257 aa  85.5  9e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.850889  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2109  hypothetical protein  34.27 
 
 		 245 aa  73.2  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2236  hypothetical protein  36.81 
 
 		 259 aa  63.9  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.006058 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1904  hypothetical protein  34.68 
 
 		 270 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0586421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2411  serine/threonine protein kinase  33.09 
 
 		 283 aa  57.8  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2898  hypothetical protein  34.04 
 
 		 272 aa  54.7  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.325221  normal  0.0255206 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2499  hypothetical protein  31.35 
 
 		 260 aa  54.3  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4816  hypothetical protein  33.2 
 
 		 268 aa  53.5  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3021  hypothetical protein  32.95 
 
 		 264 aa  45.8  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.365476  normal  0.947396 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5339  hypothetical protein  29.33 
 
 		 259 aa  45.4  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.795467  normal  0.179631 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0509  hypothetical protein  31.54 
 
 		 239 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2312  hypothetical protein  29.92 
 
 		 257 aa  42.7  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.78546 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3247  hypothetical protein  35.25 
 
 		 264 aa  42.4  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>