24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2184 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2184  hypothetical protein  100 
 
 		 257 aa  479  1e-134  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.850889  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22310  hypothetical protein  55.69 
 
 		 269 aa  246  2e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0938212  normal  0.213332 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11515  hypothetical protein  36.43 
 
 		 302 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.199486 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3139  hypothetical protein  37.22 
 
 		 285 aa  119  6e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.317049  normal  0.786002 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3128  hypothetical protein  36.84 
 
 		 285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3189  hypothetical protein  36.84 
 
 		 285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.125082 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2109  hypothetical protein  40.8 
 
 		 245 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3655  hypothetical protein  36.73 
 
 		 289 aa  108  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.220655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2757  hypothetical protein  34.5 
 
 		 289 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.98914  normal  0.30463 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2084  hypothetical protein  37.18 
 
 		 261 aa  97.4  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0628997  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2499  hypothetical protein  35.55 
 
 		 260 aa  79  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2304  hypothetical protein  34.93 
 
 		 268 aa  79  0.00000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000415891  hitchhiker  0.00123485 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2312  hypothetical protein  39.09 
 
 		 257 aa  78.6  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.78546 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2575  hypothetical protein  34.85 
 
 		 245 aa  77.4  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.460251  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2898  hypothetical protein  35.41 
 
 		 272 aa  76.6  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.325221  normal  0.0255206 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2236  hypothetical protein  35.86 
 
 		 259 aa  73.2  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.006058 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4816  hypothetical protein  35.48 
 
 		 268 aa  69.3  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5339  hypothetical protein  33.05 
 
 		 259 aa  66.6  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.795467  normal  0.179631 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3021  hypothetical protein  35.66 
 
 		 264 aa  64.7  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.365476  normal  0.947396 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0509  hypothetical protein  34.73 
 
 		 239 aa  61.6  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1904  hypothetical protein  34.17 
 
 		 270 aa  61.6  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0586421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3247  hypothetical protein  34.65 
 
 		 264 aa  53.9  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1426  hypothetical protein  33.19 
 
 		 260 aa  48.1  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1692  hypothetical protein  39.18 
 
 		 265 aa  43.1  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.333526  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>