15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2304 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_2304  hypothetical protein  100 
 
 
268 aa  506  9.999999999999999e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000415891  hitchhiker  0.00123485 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22310  hypothetical protein  36.92 
 
 
269 aa  81.6  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0938212  normal  0.213332 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3139  hypothetical protein  30.47 
 
 
285 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.317049  normal  0.786002 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3128  hypothetical protein  30.47 
 
 
285 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3189  hypothetical protein  30.47 
 
 
285 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.125082 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2109  hypothetical protein  36.95 
 
 
245 aa  65.9  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2757  hypothetical protein  30.38 
 
 
289 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.98914  normal  0.30463 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11515  hypothetical protein  30.5 
 
 
302 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.199486 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3655  hypothetical protein  31.8 
 
 
289 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.220655  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2236  hypothetical protein  32.17 
 
 
259 aa  53.1  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.006058 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2184  hypothetical protein  29.34 
 
 
257 aa  52.4  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.850889  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2898  hypothetical protein  32.58 
 
 
272 aa  52  0.000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.325221  normal  0.0255206 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2499  hypothetical protein  33.2 
 
 
260 aa  48.5  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2575  hypothetical protein  29.39 
 
 
245 aa  47.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.460251  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1904  hypothetical protein  33.7 
 
 
270 aa  44.3  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0586421  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>