26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3021 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3021  hypothetical protein  100 
 
 		 264 aa  503  1e-141  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.365476  normal  0.947396 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3247  hypothetical protein  93.94 
 
 		 264 aa  382  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2499  hypothetical protein  49.02 
 
 		 260 aa  180  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2109  hypothetical protein  39.44 
 
 		 245 aa  122  6e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2312  hypothetical protein  40 
 
 		 257 aa  121  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.78546 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2575  hypothetical protein  38.82 
 
 		 245 aa  105  6e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.460251  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2236  hypothetical protein  38.82 
 
 		 259 aa  101  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.006058 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2898  hypothetical protein  38.01 
 
 		 272 aa  91.3  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.325221  normal  0.0255206 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2184  hypothetical protein  39.27 
 
 		 257 aa  90.9  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.850889  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4816  hypothetical protein  37.16 
 
 		 268 aa  83.2  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1904  hypothetical protein  37.7 
 
 		 270 aa  78.2  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0586421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22310  hypothetical protein  34.59 
 
 		 269 aa  76.6  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0938212  normal  0.213332 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5339  hypothetical protein  35.27 
 
 		 259 aa  75.1  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.795467  normal  0.179631 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1426  hypothetical protein  33.62 
 
 		 260 aa  74.3  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1692  hypothetical protein  34.09 
 
 		 265 aa  65.5  0.0000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.333526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11515  hypothetical protein  31.14 
 
 		 302 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.199486 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3655  hypothetical protein  31.88 
 
 		 289 aa  62  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.220655  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2084  hypothetical protein  32.92 
 
 		 261 aa  58.9  0.00000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0628997  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21720  hypothetical protein  41.94 
 
 		 290 aa  57  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.477257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2757  hypothetical protein  29.95 
 
 		 289 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.98914  normal  0.30463 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0509  hypothetical protein  31.47 
 
 		 239 aa  53.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3189  hypothetical protein  27.82 
 
 		 285 aa  52.4  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.125082 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3128  hypothetical protein  27.82 
 
 		 285 aa  52.4  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3139  hypothetical protein  27.46 
 
 		 285 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.317049  normal  0.786002 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2316  hypothetical protein  35.78 
 
 		 247 aa  48.9  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2304  hypothetical protein  30.2 
 
 		 268 aa  48.1  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000415891  hitchhiker  0.00123485 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>