28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2312 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2312  hypothetical protein  100 
 
 		 257 aa  496  1e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.78546 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2575  hypothetical protein  44.44 
 
 		 245 aa  155  8e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.460251  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4816  hypothetical protein  45.38 
 
 		 268 aa  144  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2898  hypothetical protein  42.55 
 
 		 272 aa  144  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.325221  normal  0.0255206 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5339  hypothetical protein  41.42 
 
 		 259 aa  124  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.795467  normal  0.179631 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2109  hypothetical protein  39.3 
 
 		 245 aa  123  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2236  hypothetical protein  41.57 
 
 		 259 aa  119  6e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.006058 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0509  hypothetical protein  41.33 
 
 		 239 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1904  hypothetical protein  41.67 
 
 		 270 aa  107  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0586421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3021  hypothetical protein  40 
 
 		 264 aa  99  7e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.365476  normal  0.947396 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21720  hypothetical protein  34.12 
 
 		 290 aa  97.1  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.477257  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1692  hypothetical protein  37.72 
 
 		 265 aa  95.5  8e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.333526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1426  hypothetical protein  35.87 
 
 		 260 aa  94.7  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3247  hypothetical protein  39.23 
 
 		 264 aa  92.4  7e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2184  hypothetical protein  39.25 
 
 		 257 aa  84  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.850889  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22310  hypothetical protein  37.12 
 
 		 269 aa  76.6  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0938212  normal  0.213332 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2499  hypothetical protein  35.41 
 
 		 260 aa  76.3  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2316  hypothetical protein  38.43 
 
 		 247 aa  69.7  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1176  hypothetical protein  31.74 
 
 		 268 aa  68.2  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00920395 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3655  hypothetical protein  33.33 
 
 		 289 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.220655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11515  hypothetical protein  29.66 
 
 		 302 aa  57  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.199486 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2757  hypothetical protein  32.86 
 
 		 289 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.98914  normal  0.30463 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3128  hypothetical protein  31.45 
 
 		 285 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3189  hypothetical protein  31.45 
 
 		 285 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.125082 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3139  hypothetical protein  31.45 
 
 		 285 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.317049  normal  0.786002 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2084  hypothetical protein  30.7 
 
 		 261 aa  44.3  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0628997  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2304  hypothetical protein  28.32 
 
 		 268 aa  43.5  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000415891  hitchhiker  0.00123485 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15850  hypothetical protein  32.12 
 
 		 261 aa  43.5  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.129128  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>