28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1904 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_1904  hypothetical protein  100 
 
 
270 aa  508  1e-143  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0586421  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2236  hypothetical protein  81.4 
 
 
259 aa  365  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.006058 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2312  hypothetical protein  41.73 
 
 
257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.78546 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4816  hypothetical protein  41.83 
 
 
268 aa  115  6e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2109  hypothetical protein  41.9 
 
 
245 aa  110  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0509  hypothetical protein  39.39 
 
 
239 aa  99.8  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2898  hypothetical protein  35.56 
 
 
272 aa  97.1  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.325221  normal  0.0255206 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5339  hypothetical protein  36.06 
 
 
259 aa  93.2  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.795467  normal  0.179631 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2575  hypothetical protein  36.22 
 
 
245 aa  83.2  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.460251  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2499  hypothetical protein  35.69 
 
 
260 aa  79  0.00000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22310  hypothetical protein  34.35 
 
 
269 aa  78.2  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0938212  normal  0.213332 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3021  hypothetical protein  38.26 
 
 
264 aa  75.1  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.365476  normal  0.947396 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3247  hypothetical protein  35.04 
 
 
264 aa  69.3  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2184  hypothetical protein  34.95 
 
 
257 aa  68.9  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.850889  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2084  hypothetical protein  35.43 
 
 
261 aa  68.2  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0628997  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3655  hypothetical protein  32.6 
 
 
289 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.220655  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1426  hypothetical protein  33.87 
 
 
260 aa  63.2  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3128  hypothetical protein  32.27 
 
 
285 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3189  hypothetical protein  32.27 
 
 
285 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.125082 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3139  hypothetical protein  31.91 
 
 
285 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.317049  normal  0.786002 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2304  hypothetical protein  34.43 
 
 
268 aa  58.9  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000415891  hitchhiker  0.00123485 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11515  hypothetical protein  31.69 
 
 
302 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.199486 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2757  hypothetical protein  31.78 
 
 
289 aa  55.8  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.98914  normal  0.30463 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2316  hypothetical protein  35.47 
 
 
247 aa  55.8  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1692  hypothetical protein  32.58 
 
 
265 aa  55.1  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.333526  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1176  hypothetical protein  36.87 
 
 
268 aa  54.7  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00920395 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21720  hypothetical protein  29.03 
 
 
290 aa  49.3  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.477257  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15850  hypothetical protein  33.71 
 
 
261 aa  48.9  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.129128  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>