13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2316 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2316  hypothetical protein  100 
 
 		 247 aa  456  1e-127  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1426  hypothetical protein  50.4 
 
 		 260 aa  168  9e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1692  hypothetical protein  44.77 
 
 		 265 aa  134  9.999999999999999e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.333526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2898  hypothetical protein  42.12 
 
 		 272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.325221  normal  0.0255206 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21720  hypothetical protein  38.85 
 
 		 290 aa  115  7.999999999999999e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.477257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1176  hypothetical protein  40.87 
 
 		 268 aa  105  5e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00920395 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2312  hypothetical protein  37.92 
 
 		 257 aa  72.4  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.78546 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2236  hypothetical protein  39.07 
 
 		 259 aa  71.6  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.006058 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2575  hypothetical protein  35.75 
 
 		 245 aa  63.9  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.460251  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2499  hypothetical protein  33.64 
 
 		 260 aa  57  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1904  hypothetical protein  34.48 
 
 		 270 aa  48.5  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0586421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2184  hypothetical protein  36.13 
 
 		 257 aa  45.4  0.0009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.850889  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2084  hypothetical protein  36.19 
 
 		 261 aa  42.7  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0628997  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>