More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2080 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01253  aconitate hydratase  56.84 
 
 		 891 aa  1037    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0525201  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2371  aconitate hydratase 1  56.84 
 
 		 891 aa  1037    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00215516  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2192  aconitate hydratase  57.04 
 
 		 891 aa  1041    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000787755 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0846  aconitate hydratase  56.18 
 
 		 935 aa  1026    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2112  aconitate hydratase  57.62 
 
 		 913 aa  1038    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0880837 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1406  aconitate hydratase 1  60.13 
 
 		 914 aa  1148    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0921  aconitate hydratase  50.52 
 
 		 901 aa  957    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.446396  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1412  aconitate hydratase  51.69 
 
 		 901 aa  952    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.881286  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2003  aconitate hydratase  50.27 
 
 		 901 aa  874    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.158915 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0120  aconitate hydratase  41.54 
 
 		 865 aa  650    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3635  aconitate hydratase  52.11 
 
 		 907 aa  981    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533912  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2478  aconitate hydratase  50.05 
 
 		 905 aa  880    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0931101  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0093  aconitate hydratase  53.65 
 
 		 895 aa  976    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0493  aconitate hydratase  49.95 
 
 		 905 aa  880    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2016  aconitate hydratase 1  57.82 
 
 		 914 aa  1042    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.644961  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2745  aconitate hydratase 1  70.23 
 
 		 954 aa  1345    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3408  aconitate hydratase  52 
 
 		 907 aa  980    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.741284  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3370  aconitate hydratase  52 
 
 		 907 aa  980    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3320  aconitate hydratase  52 
 
 		 907 aa  980    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1755  aconitate hydratase  49.95 
 
 		 905 aa  880    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1659  aconitate hydratase  55.24 
 
 		 891 aa  1043    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1653  aconitate hydratase  54.8 
 
 		 891 aa  1040    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1151  aconitate hydratase  50.32 
 
 		 963 aa  902    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3404  aconitate hydratase  57.4 
 
 		 914 aa  1040    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.342513  normal  0.354094 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1145  aconitate hydratase  49.63 
 
 		 972 aa  861    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2061  aconitate hydratase  55.04 
 
 		 939 aa  1043    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1925  aconitate hydratase  73.26 
 
 		 916 aa  1421    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.128572  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1810  aconitate hydratase  43.81 
 
 		 870 aa  717    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.38661  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2331  aconitate hydratase  51.68 
 
 		 901 aa  882    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.35381  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3627  aconitate hydratase  57.52 
 
 		 913 aa  1036    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.943938 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0714  aconitate hydratase  52.84 
 
 		 934 aa  977    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0891  aconitase  52.18 
 
 		 939 aa  882    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2731  aconitase  57.16 
 
 		 894 aa  1046    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.341771 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0800  aconitate hydratase  50.05 
 
 		 905 aa  880    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2876  aconitate hydratase  75.81 
 
 		 938 aa  1436    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1788  aconitate hydratase 1  56.44 
 
 		 907 aa  984    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.83905  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1823  aconitate hydratase  49.95 
 
 		 905 aa  880    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3890  aconitate hydratase  58.18 
 
 		 913 aa  1041    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0185515 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0064  aconitate hydratase  53.91 
 
 		 926 aa  999    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2120  aconitate hydratase 1  51.3 
 
 		 891 aa  926    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.731402  normal  0.0663463 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2082  aconitate hydratase  41.85 
 
 		 873 aa  668    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.700898  normal  0.185792 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1016  aconitate hydratase  56.26 
 
 		 937 aa  1024    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.827465 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3677  aconitate hydratase  52 
 
 		 907 aa  980    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0875  aconitate hydratase  51.17 
 
 		 946 aa  902    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3511  aconitate hydratase  58.49 
 
 		 891 aa  1083    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0654  aconitate hydratase  50.05 
 
 		 905 aa  887    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0804  aconitate hydratase  46.38 
 
 		 873 aa  795    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3665  aconitase  52.01 
 
 		 945 aa  916    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258951  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1312  aconitase  70.86 
 
 		 927 aa  1320    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0948394  normal  0.862178 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0291  aconitate hydratase  52.94 
 
 		 905 aa  1004    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0448672 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11504  aconitate hydratase  70.87 
 
 		 943 aa  1336    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.201214 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0600  aconitate hydratase 1  47.99 
 
 		 905 aa  861    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.778708  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2127  aconitate hydratase 1  56.81 
 
 		 903 aa  1045    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.760339 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2646  aconitate hydratase  54.55 
 
 		 931 aa  1031    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.581556  decreased coverage  0.00838168 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2366  aconitate hydratase  49.32 
 
 		 978 aa  862    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1991  aconitase  55.8 
 
 		 937 aa  988    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0204  aconitate hydratase  52.74 
 
 		 906 aa  1003    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0875867 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3592  aconitate hydratase  49.04 
 
 		 966 aa  887    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.999758  normal  0.14319 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2486  aconitate hydratase  71.88 
 
 		 937 aa  1372    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.922342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2903  aconitate hydratase  48.98 
 
 		 905 aa  871    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.864497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0235  aconitate hydratase  57.47 
 
 		 919 aa  1037    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.163774  normal  0.632766 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0525  aconitate hydratase  52.43 
 
 		 905 aa  999    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.123163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4079  aconitate hydratase 1  58.27 
 
 		 984 aa  1076    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2962  aconitase  57.92 
 
 		 910 aa  1073    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0408  aconitate hydratase  53.24 
 
 		 905 aa  1004    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0914  aconitate hydratase 1  58.27 
 
 		 984 aa  1076    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.239942  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2494  aconitate hydratase  71.7 
 
 		 942 aa  1375    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.131407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2384  aconitate hydratase  54.95 
 
 		 935 aa  1043    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.780528 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1282  aconitate hydratase  54.38 
 
 		 895 aa  1005    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.14403  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2492  aconitate hydratase  49.41 
 
 		 901 aa  846    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4240  aconitate hydratase 1  49.89 
 
 		 884 aa  871    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0224  aconitase  60.23 
 
 		 907 aa  1115    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1682  aconitate hydratase  55.99 
 
 		 906 aa  1029    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00945136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1006  aconitate hydratase  55.43 
 
 		 915 aa  1041    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.304321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2096  aconitate hydratase 1  46.86 
 
 		 891 aa  776    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.931453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1903  aconitate hydratase  56.78 
 
 		 913 aa  1035    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0189889  normal  0.77377 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3674  aconitate hydratase 1  57.43 
 
 		 920 aa  1084    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2449  aconitate hydratase  71.7 
 
 		 942 aa  1375    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0618  aconitate hydratase  59.31 
 
 		 940 aa  1036    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1284  aconitate hydratase 1  56.72 
 
 		 907 aa  1072    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1358  aconitase  49.41 
 
 		 909 aa  850    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3357  aconitate hydratase  57.34 
 
 		 896 aa  1045    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3665  aconitate hydratase  71.82 
 
 		 941 aa  1363    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0265295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0620  aconitate hydratase  47.07 
 
 		 874 aa  813    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.343199  normal  0.507089 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1454  aconitate hydratase 1  59.58 
 
 		 914 aa  1104    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.293979  normal  0.11612 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1615  aconitate hydratase  49.95 
 
 		 905 aa  880    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0230  aconitate hydratase 1  55.04 
 
 		 908 aa  1003    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1199  aconitate hydratase  43.63 
 
 		 903 aa  728    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2861  aconitase  55.79 
 
 		 891 aa  1054    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.509308  normal  0.643421 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0212  aconitate hydratase  54.69 
 
 		 895 aa  1025    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1342  aconitate hydratase 1  49.89 
 
 		 939 aa  853    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00303441  hitchhiker  0.00141005 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44290  aconitate hydratase  58.65 
 
 		 910 aa  1057    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2340  aconitate hydratase  50.05 
 
 		 905 aa  880    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1246  aconitate hydratase  48.22 
 
 		 887 aa  897    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1644  aconitase  71.32 
 
 		 936 aa  1355    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.417591  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0382  aconitate hydratase  50.82 
 
 		 905 aa  915    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3024  aconitate hydratase  49.74 
 
 		 989 aa  870    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0175547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3062  aconitate hydratase 1  72.6 
 
 		 944 aa  1376    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.577163  normal  0.0664937 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1394  aconitase  71.05 
 
 		 926 aa  1352    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.295353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0106  aconitase  49.79 
 
 		 922 aa  896    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>