23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0666 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0666  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 150 aa  286  9e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2219  helix-turn-helix domain-containing protein  40.91 
 
 		 146 aa  75.5  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2176  helix-turn-helix domain-containing protein  40.66 
 
 		 125 aa  50.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2259  transcriptional regulator, XRE family  30.23 
 
 		 255 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 255 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000193278  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0763  transcriptional regulator  46.67 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.305784 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1965  putative phage repressor  36.67 
 
 		 263 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.526038  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2375  hypothetical protein  45 
 
 		 220 aa  45.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19180  predicted transcriptional regulator  38.71 
 
 		 141 aa  44.3  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.433834  normal  0.0717748 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2104  helix-turn-helix domain-containing protein  43.94 
 
 		 95 aa  43.9  0.0007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0694198  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  31.3 
 
 		 256 aa  43.9  0.0008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0413  helix-turn-helix domain-containing protein  45 
 
 		 132 aa  42.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0941  transcriptional regulator, XRE family  41.94 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.551097  normal  0.0671843 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2421  helix-turn-helix domain-containing protein  45 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.195917  normal  0.223738 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0278  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 128 aa  43.5  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000672654  normal  0.646275 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0762  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1750  putative prophage repressor  53.45 
 
 		 230 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.141014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1621  transcriptional regulator, XRE family  35.8 
 
 		 368 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2653  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 		 133 aa  42  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0271139  normal  0.0108721 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1361  XRE family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 282 aa  41.2  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108942  hitchhiker  0.000206797 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2190  XRE family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 222 aa  41.6  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1733  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 133 aa  40.8  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0511  DNA-binding protein  40.91 
 
 		 210 aa  40.4  0.007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239636 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>