34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3338 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_3338  hypothetical protein  100 
 
 		 274 aa  555  1e-157  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0079  hypothetical protein  44.57 
 
 		 297 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0824  hypothetical protein  39.53 
 
 		 307 aa  192  4e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0175  hypothetical protein  42.31 
 
 		 299 aa  187  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0638  hypothetical protein  40.71 
 
 		 280 aa  187  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0652  hypothetical protein  42.21 
 
 		 280 aa  185  7e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5420600000000002e-24 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3426  hypothetical protein  41.82 
 
 		 299 aa  176  3e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0838  hypothetical protein  47.11 
 
 		 151 aa  115  5e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09540  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  28.16 
 
 		 280 aa  50.4  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.623217  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3361  NLP/P60 protein  32.76 
 
 		 288 aa  50.4  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3041  NLP/P60 protein  32.5 
 
 		 288 aa  47.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.241785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1776  NLP/P60  37.89 
 
 		 294 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.390211  normal  0.0674552 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1265  NLP/P60 family protein  32.17 
 
 		 284 aa  46.6  0.0005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1127  NLP/P60 protein  31.97 
 
 		 286 aa  46.2  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.111374 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0858  NLP/P60 protein  30.6 
 
 		 286 aa  46.2  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0257977  normal  0.028426 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07830  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  34.29 
 
 		 372 aa  46.2  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0039  NLP/P60 protein  31.91 
 
 		 270 aa  44.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0817  NLP/P60 protein  30.6 
 
 		 286 aa  45.4  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.391542  normal  0.198058 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4198  NLP/P60 protein  32.76 
 
 		 285 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1116  NLP/P60 protein  35.42 
 
 		 294 aa  44.3  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.19125  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4584  NLP/P60 protein  33.04 
 
 		 276 aa  44.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1049  NLP/P60 protein  21.26 
 
 		 250 aa  43.9  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1256  NLP/P60 protein  32.41 
 
 		 362 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.589306 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1239  NLP/P60  32.41 
 
 		 362 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00968494  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3528  NLP/P60  34.38 
 
 		 283 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.156109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2022  NLP/P60 protein  29.25 
 
 		 242 aa  43.9  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.321386 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0782  NLP/P60 protein  29.66 
 
 		 286 aa  43.1  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0488091 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0271  NlpC/P60 family protein  23.89 
 
 		 257 aa  43.5  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.677165 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1506  NLP/P60 protein  34.74 
 
 		 524 aa  43.5  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.483483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3657  NLP/P60 protein  25 
 
 		 385 aa  43.5  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0280  NLP/P60 protein  29.41 
 
 		 279 aa  43.1  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.273042  normal  0.043506 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4487  NLP/P60 protein  31.9 
 
 		 285 aa  43.1  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1266  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 362 aa  42.7  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1599  NLP/P60 protein  31.73 
 
 		 368 aa  42.4  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0891153 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>