23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0638 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0638  hypothetical protein  100 
 
 		 280 aa  567  1e-161  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0652  hypothetical protein  93.91 
 
 		 280 aa  481  1e-135  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5420600000000002e-24 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0824  hypothetical protein  46.28 
 
 		 307 aa  258  8e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0175  hypothetical protein  48.28 
 
 		 299 aa  250  2e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3426  hypothetical protein  45.74 
 
 		 299 aa  230  2e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0079  hypothetical protein  44.85 
 
 		 297 aa  223  2e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3338  hypothetical protein  40.71 
 
 		 274 aa  188  9e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0838  hypothetical protein  43.92 
 
 		 151 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6442  NLP/P60 protein  31.82 
 
 		 392 aa  49.3  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2681  catechol 2,3 dioxygenase  28.47 
 
 		 332 aa  44.3  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0886015 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09540  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  29 
 
 		 280 aa  44.3  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.623217  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3528  NLP/P60  29.08 
 
 		 283 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.156109  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5092  NLP/P60 protein  27.73 
 
 		 207 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0039  NLP/P60 protein  29.52 
 
 		 270 aa  43.9  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0373  NLP/P60 protein  26.89 
 
 		 208 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4208  NLP/P60 protein  29.93 
 
 		 281 aa  43.5  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.200815  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4965  NLP/P60 protein  26.89 
 
 		 208 aa  43.1  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1256  NLP/P60 protein  29.73 
 
 		 362 aa  43.1  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.589306 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1239  NLP/P60  29.73 
 
 		 362 aa  43.1  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00968494  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1776  NLP/P60  25.13 
 
 		 294 aa  43.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.390211  normal  0.0674552 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5142  NLP/P60 protein  26.89 
 
 		 208 aa  43.1  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0699781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1266  NLP/P60 protein  30.56 
 
 		 362 aa  42.4  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07830  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  32.71 
 
 		 372 aa  42.4  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>