22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0652 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0652  hypothetical protein  100 
 
 		 280 aa  567  1e-161  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5420600000000002e-24 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0638  hypothetical protein  93.91 
 
 		 280 aa  509  1e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0824  hypothetical protein  46.96 
 
 		 307 aa  260  2e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0175  hypothetical protein  48.29 
 
 		 299 aa  247  2e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3426  hypothetical protein  46.45 
 
 		 299 aa  232  5e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0079  hypothetical protein  45.15 
 
 		 297 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3338  hypothetical protein  42.21 
 
 		 274 aa  191  2e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0838  hypothetical protein  43.92 
 
 		 151 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6442  NLP/P60 protein  31.82 
 
 		 392 aa  49.7  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0039  NLP/P60 protein  30.48 
 
 		 270 aa  45.8  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5092  NLP/P60 protein  28.57 
 
 		 207 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1256  NLP/P60 protein  29.73 
 
 		 362 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.589306 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1239  NLP/P60  29.73 
 
 		 362 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00968494  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0048  NLP/P60 protein  29.52 
 
 		 270 aa  43.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0780825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4965  NLP/P60 protein  27.73 
 
 		 208 aa  43.1  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1776  NLP/P60  24.73 
 
 		 294 aa  43.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.390211  normal  0.0674552 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1380  hypothetical protein  29.52 
 
 		 271 aa  43.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09540  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  28.57 
 
 		 280 aa  43.1  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.623217  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1266  NLP/P60 protein  30.56 
 
 		 362 aa  42.7  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5142  NLP/P60 protein  27.73 
 
 		 208 aa  42.7  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0699781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4208  NLP/P60 protein  29.93 
 
 		 281 aa  42.7  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.200815  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0858  NLP/P60 protein  28.46 
 
 		 286 aa  42.4  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0257977  normal  0.028426 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>