13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0175 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0175  hypothetical protein  100 
 
 		 299 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3426  hypothetical protein  74.83 
 
 		 299 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0824  hypothetical protein  58.72 
 
 		 307 aa  346  3e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0079  hypothetical protein  52.01 
 
 		 297 aa  262  6e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0638  hypothetical protein  47.93 
 
 		 280 aa  239  4e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0652  hypothetical protein  48.75 
 
 		 280 aa  231  1e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5420600000000002e-24 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0838  hypothetical protein  60.67 
 
 		 151 aa  179  4e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3338  hypothetical protein  42.31 
 
 		 274 aa  171  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09540  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  32.88 
 
 		 280 aa  45.1  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.623217  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0297  hypothetical protein  31.65 
 
 		 286 aa  43.9  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.633779  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0039  NLP/P60 protein  27.15 
 
 		 270 aa  43.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0782  NLP/P60 protein  35.35 
 
 		 286 aa  43.1  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0488091 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0858  NLP/P60 protein  35.35 
 
 		 286 aa  42.7  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0257977  normal  0.028426 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>