24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3119 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_3119  phage transcriptional regulator, AlpA  100 
 
 		 58 aa  118  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000632591  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1968  phage transcriptional regulator, AlpA  38.46 
 
 		 72 aa  50.1  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0901685  normal  0.059551 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1611  phage transcriptional regulator, AlpA  38.89 
 
 		 74 aa  48.9  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0193561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1227  phage transcriptional regulator, AlpA  38.46 
 
 		 78 aa  48.9  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0127458  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0653  phage transcriptional regulator, AlpA  43.75 
 
 		 75 aa  47.8  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0437376  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1131  phage transcriptional regulator, AlpA  36 
 
 		 69 aa  44.3  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.232619  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1625  phage transcriptional regulator, AlpA  38 
 
 		 77 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.807663  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1156  phage transcriptional regulator, AlpA  37.5 
 
 		 71 aa  43.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1256  phage transcriptional regulator, AlpA  39.58 
 
 		 64 aa  43.5  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2683  phage transcriptional regulator, AlpA  35.71 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000806139  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2004  transcriptional regulator  38.89 
 
 		 68 aa  42.7  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0999  phage transcriptional regulator, AlpA  39.22 
 
 		 57 aa  42.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0279  prophage CP4-57 regulatory protein  35.29 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00300713  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2796  phage transcriptional regulator, AlpA  43.64 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2193  prophage CP4-57 regulatory  33.96 
 
 		 87 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3120  phage transcriptional regulator, AlpA  34 
 
 		 86 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3477  phage transcriptional regulator, AlpA  32.73 
 
 		 60 aa  42  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3481  phage transcriptional regulator, AlpA  33.33 
 
 		 127 aa  41.6  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1468  phage transcriptional regulator, AlpA  31.37 
 
 		 136 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0978574  normal  0.521864 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1265  phage transcriptional regulator, AlpA  31.37 
 
 		 127 aa  40.8  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.637502  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3167  phage transcriptional regulator, AlpA  35.42 
 
 		 72 aa  40.8  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.786341  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3427  phage transcriptional regulator, AlpA  30.91 
 
 		 70 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2960  phage DNA binding protein  33.33 
 
 		 88 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.630956  hitchhiker  0.00000157452 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3362  phage transcriptional regulator, AlpA  31.37 
 
 		 117 aa  40.8  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.253587  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>