96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2076 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2076  2-nitropropane dioxygenase  100 
 
 		 472 aa  976    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.321315  normal  0.310329 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2173  2-nitropropane dioxygenase-like protein  73.73 
 
 		 470 aa  745    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.639614  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3787  2-nitropropane dioxygenase, NPD  62.85 
 
 		 465 aa  599  1e-170  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0776  2-nitropropane dioxygenase, NPD  62.29 
 
 		 467 aa  592  1e-168  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2312  2-nitropropane dioxygenase, NPD  62.5 
 
 		 469 aa  587  1e-166  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.241055  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0183  hypothetical protein  58.86 
 
 		 453 aa  573  1.0000000000000001e-162  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1243  2-nitropropane dioxygenase, NPD  60.59 
 
 		 467 aa  568  1e-161  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.317364 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0774  hypothetical protein  56.48 
 
 		 467 aa  552  1e-156  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0237  hypothetical protein  55.2 
 
 		 467 aa  542  1e-153  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0189  hypothetical protein  54.35 
 
 		 465 aa  536  1e-151  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5061  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.73 
 
 		 415 aa  103  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.877356  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0091  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.68 
 
 		 382 aa  102  2e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2940  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.03 
 
 		 363 aa  100  8e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1344  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.69 
 
 		 363 aa  99  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.865033  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3113  2-nitropropane dioxygenase NPD  28.71 
 
 		 352 aa  98.2  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2694  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  28.35 
 
 		 414 aa  97.4  5e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0622  hypothetical protein  28.35 
 
 		 405 aa  95.9  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1705  2-nitropropane dioxygenase  28.35 
 
 		 438 aa  96.3  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.137412  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2751  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  28.35 
 
 		 405 aa  95.9  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.76383  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2896  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  28.35 
 
 		 414 aa  96.3  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.369795  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2391  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  28.35 
 
 		 414 aa  96.3  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1283  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.53 
 
 		 396 aa  95.5  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.756319 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2815  2-nitropropane dioxygenase  28.57 
 
 		 392 aa  95.5  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2083  2-nitropropane dioxygenase, NPD  29.33 
 
 		 393 aa  94.4  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.683958 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3007  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.23 
 
 		 379 aa  94  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1877  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  29.02 
 
 		 360 aa  90.9  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.117521  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0358  2-nitropropane dioxygenase NPD  28.57 
 
 		 353 aa  90.1  8e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.161676  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1293  2-nitropropane dioxygenase, NPD  29.47 
 
 		 361 aa  89.4  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000110305  hitchhiker  0.00000426168 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5565  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.87 
 
 		 405 aa  89.4  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286036  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0721  2-nitropropane dioxygenase, NPD  27.96 
 
 		 363 aa  89.4  1e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.214896  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0405  2-nitropropane dioxygenase NPD  28.15 
 
 		 376 aa  88.6  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1803  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  27.94 
 
 		 392 aa  88.6  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3317  2-nitropropane dioxygenase NPD  28.19 
 
 		 382 aa  88.2  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0038  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.32 
 
 		 352 aa  87.8  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3641  2-nitropropane dioxygenase NPD  28.19 
 
 		 386 aa  87.8  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0756  2-nitropropane dioxygenase NPD  28.62 
 
 		 361 aa  86.7  8e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2347  2-nitropropane dioxygenase NPD  28.13 
 
 		 393 aa  86.3  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.6039  hitchhiker  0.000000126588 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2314  2-nitropropane dioxygenase NPD  28.52 
 
 		 396 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.16521 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1681  2-nitropropane dioxygenase, NPD  26.76 
 
 		 396 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.097418  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0114  hypothetical protein  27.81 
 
 		 402 aa  85.5  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.782574 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1158  2-nitropropane dioxygenase NPD  26.58 
 
 		 357 aa  84.7  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0552766 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1770  2-nitropropane dioxygenase NPD  27.36 
 
 		 396 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.763797 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1945  putative 2-nitropropane dioxygenase  27.55 
 
 		 396 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00553543  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0485  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  27.49 
 
 		 365 aa  84  0.000000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5053  2-nitropropane dioxygenase, NPD  27.95 
 
 		 396 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1210  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  25.87 
 
 		 370 aa  83.6  0.000000000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1757  2-nitropropane dioxygenase, NPD  26.44 
 
 		 396 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6322  2-nitropropane dioxygenase, NPD  26.44 
 
 		 396 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1506  2-nitropropane dioxygenase NPD  27.7 
 
 		 396 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.186362 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2272  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  27.67 
 
 		 424 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.189277  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0649  2-nitropropane dioxygenase NPD  27.55 
 
 		 365 aa  81.6  0.00000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3148  2-nitropropane dioxygenase-like dioxygenase  27.7 
 
 		 369 aa  80.9  0.00000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0185089  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0619  oxidoreductase (2-nitropropane dioxygenase family)  25.71 
 
 		 366 aa  80.9  0.00000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1676  2-nitropropane dioxygenase NPD  26.42 
 
 		 396 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0582286  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1305  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  27.46 
 
 		 396 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.302592  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1062  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  27.46 
 
 		 396 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2183  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  27.46 
 
 		 396 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2128  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  27.12 
 
 		 396 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.364934  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0103  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  27.46 
 
 		 396 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1792  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  27.46 
 
 		 396 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.34549  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0498  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  25.15 
 
 		 363 aa  79  0.0000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.142021  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2314  2-nitropropane dioxygenase  27.52 
 
 		 396 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2248  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.05 
 
 		 360 aa  77.4  0.0000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.69113  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1586  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  26.21 
 
 		 373 aa  77  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.385159  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0406  2-nitropropane dioxygenase NPD  26.58 
 
 		 357 aa  77  0.0000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.25833  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3736  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.77 
 
 		 339 aa  76.3  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040511 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2985  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.15 
 
 		 364 aa  75.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.565895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1279  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  26.05 
 
 		 363 aa  74.7  0.000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0434534  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1164  2-nitropropane dioxygenase, NPD  26.64 
 
 		 373 aa  74.3  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.121776  normal  0.303682 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1025  2-nitropropane dioxygenase NPD  25.57 
 
 		 366 aa  73.6  0.000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0670  2-nitropropane dioxygenase NPD  26.1 
 
 		 421 aa  73.6  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0766  2-nitropropane dioxygenase NPD  26.97 
 
 		 373 aa  72  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0843777 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4589  2-nitropropane dioxygenase, NPD  29.51 
 
 		 422 aa  71.6  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0006  2-nitropropane dioxygenase NPD  25.65 
 
 		 332 aa  71.2  0.00000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00157351  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0455  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  25.84 
 
 		 363 aa  70.5  0.00000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000000961366  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1286  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  25.76 
 
 		 363 aa  70.1  0.00000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  unclonable  0.00000000000131785  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1851  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.23 
 
 		 373 aa  70.1  0.00000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000135103  normal  0.816566 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2188  putative 2-nitropropane dioxygenase  27.19 
 
 		 433 aa  69.7  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000766761 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1406  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  25.84 
 
 		 363 aa  69.7  0.0000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  unclonable  0.00324657  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1184  2-nitropropane dioxygenase NPD  26.64 
 
 		 414 aa  65.5  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0977  2-nitropropane dioxygenase NPD  25.72 
 
 		 380 aa  64.7  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.652012  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0610  2-nitropropane dioxygenase NPD  25.16 
 
 		 417 aa  63.9  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1061  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  25.68 
 
 		 355 aa  63.9  0.000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.992497  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1249  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  25.68 
 
 		 355 aa  63.5  0.000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1538  2-nitropropane dioxygenase, NPD  26.63 
 
 		 414 aa  63.2  0.000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1055  2-nitropropane dioxygenase, NPD  24.66 
 
 		 361 aa  62  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.455716  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0500  hypothetical protein  26.93 
 
 		 419 aa  62  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.546917 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0626  2-nitropropane dioxygenase, NPD  26.05 
 
 		 419 aa  61.6  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4381  2-nitropropane dioxygenase NPD  24.65 
 
 		 417 aa  60.1  0.00000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0231487 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1939  2-nitropropane dioxygenase NPD  25.08 
 
 		 419 aa  60.5  0.00000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1334  2-nitropropane dioxygenase, NPD  25.32 
 
 		 414 aa  59.7  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.413147  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2873  2-nitropropane dioxygenase, NPD  24.01 
 
 		 415 aa  57  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2182  putative dioxygenase related to 2-nitropropane dioxygenase  26.42 
 
 		 414 aa  57  0.0000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000148707  unclonable  0.000000279866 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3815  2-nitropropane dioxygenase NPD  25.75 
 
 		 314 aa  55.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146369  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1584  2-nitropropane dioxygenase, NPD  23.84 
 
 		 375 aa  46.2  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11150  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  27.78 
 
 		 323 aa  45.1  0.003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>