23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1679 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1679    100 
 
 		 630 bp  1249    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1748    100 
 
 		 2896 bp  204  1.9999999999999998e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.143387  normal  0.630182 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2806  hypothetical protein  87.18 
 
 		 1740 bp  75.8  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0816  hypothetical protein  90 
 
 		 1812 bp  71.9  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0516  hypothetical protein  89.47 
 
 		 1764 bp  65.9  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0359  hypothetical protein  91.67 
 
 		 1740 bp  63.9  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3083  hypothetical protein  89.29 
 
 		 1740 bp  63.9  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3192  hypothetical protein  89.29 
 
 		 1740 bp  63.9  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.440164  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3688  Type IV secretory pathway VirD2 components (relaxase)-like protein  89.29 
 
 		 1812 bp  63.9  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4008  hypothetical protein  84.34 
 
 		 1740 bp  61.9  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.487661 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0588  hypothetical protein  85.71 
 
 		 1740 bp  60  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.287847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1492  hypothetical protein  85.51 
 
 		 1728 bp  58  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0742429  normal  0.420716 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0702  hypothetical protein  87.5 
 
 		 1740 bp  56  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3848  hypothetical protein  86.67 
 
 		 1764 bp  56  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0201094  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1601  hypothetical protein  85.07 
 
 		 1740 bp  54  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3377  hypothetical protein  85.25 
 
 		 1740 bp  50.1  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.115578  normal  0.258124 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0139  hypothetical protein  88.89 
 
 		 1737 bp  50.1  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1197  hypothetical protein  96.43 
 
 		 1740 bp  48.1  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.28941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3538  hypothetical protein  96.43 
 
 		 1740 bp  48.1  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0752  hypothetical protein  85.71 
 
 		 1878 bp  48.1  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2875  hypothetical protein  81.52 
 
 		 1764 bp  48.1  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.333866 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2989  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  96.43 
 
 		 1746 bp  48.1  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.935687  normal  0.463856 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1741  hypothetical protein  85.71 
 
 		 1755 bp  48.1  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.739176  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>