95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1529 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1529  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 137 aa  282  1.0000000000000001e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.425819 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0882  lytic transglycosylase, catalytic  48.46 
 
 		 132 aa  124  3e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3682  lytic transglycosylase catalytic  38.74 
 
 		 170 aa  85.9  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.325069 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0060  hypothetical protein  33.33 
 
 		 187 aa  68.9  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00816784 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0379  invasion protein  33.93 
 
 		 146 aa  67.4  0.00000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.135493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2099  lytic transglycosylase, catalytic  33.81 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.462435  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3138  Lytic transglycosylase catalytic  34.4 
 
 		 157 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.82617  normal  0.443685 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0125  putative conjugal transfer protein TrbN  31.5 
 
 		 159 aa  65.1  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.268051  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2772  Lytic transglycosylase catalytic  34.4 
 
 		 157 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.806121 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3069  lytic transglycosylase catalytic  31.78 
 
 		 147 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0145622 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3796  lytic transglycosylase, catalytic  33.6 
 
 		 179 aa  63.2  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.823369  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0011  conjugal transfer protein  29.69 
 
 		 159 aa  63.2  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3935  Lytic transglycosylase catalytic  31.78 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1434  conjugal transfer protein TrbN  30.97 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4502  hypothetical protein  31.78 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.362894 
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6623  conjugal transfer protein TrbN  31.15 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4262  conjugal transfer protein TrbN  31.15 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457278 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2236  conjugal transfer protein TrbN  30.97 
 
 		 199 aa  62  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1098  Lytic transglycosylase catalytic  32.82 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.891571  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6514  conjugal transfer protein TrbN  31.15 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.224309  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0193  lytic transglycosylase, catalytic  30.77 
 
 		 168 aa  61.2  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0177  Lytic transglycosylase catalytic  31.45 
 
 		 239 aa  61.6  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000012846 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0964  Lytic transglycosylase catalytic  32.2 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0195  lytic transglycosylase catalytic protein  31.2 
 
 		 239 aa  60.8  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0565  BapC protein  35.29 
 
 		 187 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.146526  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2068  BapC protein  35.29 
 
 		 187 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0527025  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2156  BapC protein  35.29 
 
 		 187 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1938  lytic transglycosylase catalytic  33.59 
 
 		 438 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0154763 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5437  lytic transglycosylase, catalytic  30.51 
 
 		 179 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.43825  normal  0.56373 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0760  BapC protein  35.29 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.832936  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2079  BapC protein  35.29 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.22209  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1524  BapC protein  35.29 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.177877  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2896  hypothetical protein  33.06 
 
 		 170 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1265  lytic transglycosylase catalytic  32.82 
 
 		 407 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.254605 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0082  lytic transglycosylase catalytic  31.09 
 
 		 161 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1239  lytic transglycosylase, catalytic  32.06 
 
 		 404 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3245  lytic transglycosylase  30.97 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5894  lytic transglycosylase catalytic  32.23 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.431421  normal  0.0993718 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0064  lytic transglycosylase catalytic  30.77 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0057  conjugal transfer protein TrbN  28.69 
 
 		 206 aa  57.8  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0063  lytic transglycosylase catalytic  31.09 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0053  lytic transglycosylase, catalytic  31.09 
 
 		 159 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0847  BapC protein  35 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0248  Lytic transglycosylase catalytic  29.91 
 
 		 168 aa  57  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4498  lytic transglycosylase, catalytic  33.93 
 
 		 404 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4488  lytic transglycosylase, catalytic  34.19 
 
 		 248 aa  57  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4262  lytic transglycosylase, catalytic  32.56 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2361  lytic transglycosylase, catalytic  31.2 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0782158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0063  lytic transglycosylase, catalytic  30.25 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0007  lytic transglycosylase, catalytic  30.25 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.37161  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1355  lytic transglycosylase, catalytic  32.06 
 
 		 408 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0669029  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4766  Lytic transglycosylase catalytic  33.85 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3519  putative ipgF protein  30.77 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2661  putative ipgF protein  30.77 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5072  transglycosylase SLT domain protein  30.48 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.110513 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2787  ipgF protein, putative  30.77 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.062319  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0006  putative invasion protein  31.62 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435281  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0219  HpaH precursor  31.62 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0006  putative invasion protein  31.62 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1337  lytic transglycosylase catalytic  32.06 
 
 		 408 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.545884  normal  0.0328335 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1891  putative ipgF protein  30.77 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.65052  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0873  lytic transglycosylase, catalytic  32.06 
 
 		 599 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4243  lytic transglycosylase, catalytic  30.88 
 
 		 178 aa  54.7  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.547585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6296  lytic transglycosylase, catalytic  29.75 
 
 		 140 aa  53.5  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.270773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0005  transglycosylase SLT domain-containing protein  27.82 
 
 		 168 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0006  BapC protein  28.21 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2121  transglycosylase SLT domain-containing protein  29.69 
 
 		 168 aa  52.4  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7409  Lytic transglycosylase catalytic  28.24 
 
 		 226 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5666  lytic transglycosylase catalytic  32.26 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.326026  hitchhiker  0.0069947 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5550  lytic transglycosylase catalytic  43.86 
 
 		 141 aa  51.6  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0239978 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4183  lytic transglycosylase, catalytic  29.6 
 
 		 176 aa  51.6  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.158148  normal  0.513979 
 
 
-
 
NC_003296  RS05356  putative lipoprotein  30.6 
 
 		 232 aa  51.2  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.592846  normal  0.453874 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5422  Lytic transglycosylase catalytic  26.52 
 
 		 183 aa  50.8  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.984316  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3673  lytic transglycosylase catalytic  29.69 
 
 		 164 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.25232 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5017  Lytic transglycosylase catalytic  27.56 
 
 		 183 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.260237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_23  transglycosylase PilT  30 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.846222  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3066  invasion protein IagB  25.66 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.490533 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3187  cell invasion protein  25.66 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.927975 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2999  invasion protein IagB  25.66 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000303944  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3082  cell invasion protein  25.66 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000116628 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6566  lytic transglycosylase catalytic  26.79 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1531  Lytic transglycosylase catalytic  30.19 
 
 		 158 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5196  Lytic transglycosylase catalytic  30.19 
 
 		 158 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1431  lytic transglycosylase, catalytic  27.27 
 
 		 170 aa  47.4  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5883  lytic transglycosylase, catalytic  29.84 
 
 		 155 aa  47.4  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.161206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3030  invasion protein IagB  24.78 
 
 		 160 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0325324 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5233  lytic transglycosylase, catalytic  30.77 
 
 		 203 aa  47  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00145184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5033  Lytic transglycosylase catalytic  29.73 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1065  conjugal transfer protein, putative  31.07 
 
 		 196 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0168  protein IpgF  28.07 
 
 		 152 aa  45.1  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00546577  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5439  Lytic transglycosylase catalytic  28.83 
 
 		 145 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1544  lytic transglycosylase, catalytic  26.92 
 
 		 175 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0439375  normal  0.269164 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1033  Lytic transglycosylase catalytic  35.63 
 
 		 237 aa  41.6  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03391  Hpa2  31.52 
 
 		 108 aa  42  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0014  conserved hypothetical protein, SLT family  26.87 
 
 		 192 aa  40.4  0.008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>